Protein–RNA interactions for Protein: P49454

CENPF, Centromere protein F, humanhuman

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Length 3,210 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPFP49454 TAS2R14-202ENST00000537503 1858 ntAPPRIS P1 BASIC4.02□□□□□ -1.77
CENPFP49454 CD80-201ENST00000264246 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
CENPFP49454 UACA-211ENST00000560441 4723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.77
CENPFP49454 RNA5SP187-201ENST00000384400 119 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
CENPFP49454 BX890604.2-201ENST00000427883 474 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
CENPFP49454 HSPE1P27-201ENST00000430808 296 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
CENPFP49454 AL592182.1-201ENST00000440897 250 ntTSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.77
CENPFP49454 ZNF92-204ENST00000450302 2957 ntTSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
CENPFP49454 AC073522.1-201ENST00000483312 377 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
CENPFP49454 AC093732.2-201ENST00000607950 274 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
CENPFP49454 MKKS-203ENST00000609375 882 ntTSL 2 BASIC4.02□□□□□ -1.77
CENPFP49454 SENP7-202ENST00000348610 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
CENPFP49454 AC079062.1-203ENST00000581862 3610 ntTSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
CENPFP49454 PSG6-202ENST00000292125 1391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
CENPFP49454 LINC02120-201ENST00000505518 2008 ntTSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
CENPFP49454 AL161912.2-201ENST00000565707 3007 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
CENPFP49454 MIR133A2-201ENST00000347538 102 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
CENPFP49454 RNU1-140P-201ENST00000365040 165 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
CENPFP49454 CT45A3-201ENST00000597510 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
CENPFP49454 CT45A2-201ENST00000605791 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
CENPFP49454 CT45A5-202ENST00000617203 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
CENPFP49454 MIR7111-201ENST00000619751 72 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
CENPFP49454 MIR7702-201ENST00000621931 59 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
CENPFP49454 AC007998.5-201ENST00000622938 237 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
CENPFP49454 AL732618.1-201ENST00000623251 301 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
CENPFP49454 AP001153.1-201ENST00000641024 338 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
CENPFP49454 AK9-202ENST00000355283 2499 ntTSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
CENPFP49454 ZNF705D-202ENST00000400085 3377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.77
CENPFP49454 SV2B-201ENST00000330276 11202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
CENPFP49454 SYTL2-203ENST00000359152 4123 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
CENPFP49454 ZNF807-201ENST00000328088 1707 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
CENPFP49454 CSPP1-203ENST00000519668 3715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
CENPFP49454 SNORA44-201ENST00000384584 132 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
CENPFP49454 RPL5P12-201ENST00000477071 851 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
CENPFP49454 STMN1P2-201ENST00000508435 439 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
CENPFP49454 IL18-204ENST00000528832 795 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC4.01□□□□□ -1.77
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CENPFP49454 CKS1BP3-201ENST00000600888 237 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
CENPFP49454 AC112503.1-201ENST00000608436 391 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
CENPFP49454 AL162274.2-201ENST00000614406 332 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
CENPFP49454 GCNT1-202ENST00000442371 5972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
CENPFP49454 SLC38A9-201ENST00000318672 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.01□□□□□ -1.77
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CENPFP49454 AL451129.1-201ENST00000437471 285 ntTSL 3 BASIC4.01□□□□□ -1.77
CENPFP49454 AC123023.1-201ENST00000455974 555 ntTSL 4 BASIC4.01□□□□□ -1.77
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CENPFP49454 AC022106.2-201ENST00000620114 757 ntBASIC4□□□□□ -1.77
CENPFP49454 CTNND1-212ENST00000525902 4984 ntTSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
CENPFP49454 Z95114.1-201ENST00000624264 14574 ntBASIC4□□□□□ -1.77
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CENPFP49454 OR4F6-201ENST00000328882 1238 ntAPPRIS P1 BASIC4□□□□□ -1.77
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CENPFP49454 DEFB116-201ENST00000400549 309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
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CENPFP49454 MSANTD4-206ENST00000617528 508 ntTSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
CENPFP49454 LINC01232-201ENST00000625254 836 ntTSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
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CENPFP49454 MUC7-201ENST00000304887 2443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
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CENPFP49454 TAX1BP1-203ENST00000409980 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
CENPFP49454 SPINK1-201ENST00000296695 542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
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CENPFP49454 FRG1CP-201ENST00000358464 769 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
CENPFP49454 LINC02266-201ENST00000610239 1151 ntTSL 3 BASIC3.99□□□□□ -1.77
CENPFP49454 WDR17-204ENST00000507824 4119 ntTSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
CENPFP49454 AL132656.3-201ENST00000606384 1595 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
CENPFP49454 GJA9-202ENST00000360786 1901 ntAPPRIS P1 BASIC3.99□□□□□ -1.77
CENPFP49454 ZNF83-201ENST00000301096 2599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.99□□□□□ -1.77
CENPFP49454 HIGD1AP4-201ENST00000430194 280 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
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