Protein–RNA interactions for Protein: P23469

PTPRE, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPREP23469 OLR1-209ENST00000543993 822 ntTSL 2 BASIC7.81□□□□□ -1.16
PTPREP23469 BICD1-206ENST00000551086 423 ntTSL 3 BASIC7.81□□□□□ -1.16
PTPREP23469 LINC02326-201ENST00000552028 540 ntTSL 3 BASIC7.81□□□□□ -1.16
PTPREP23469 AC091768.1-201ENST00000609258 930 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
PTPREP23469 MIR6861-201ENST00000618657 64 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
PTPREP23469 AC145207.9-201ENST00000623802 325 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
PTPREP23469 SLC8A1-AS1-239ENST00000631142 623 ntTSL 5 BASIC7.81□□□□□ -1.16
PTPREP23469 GRID2-204ENST00000510992 2739 ntTSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
PTPREP23469 EGFEM1P-205ENST00000483846 2327 ntTSL 5 BASIC7.81□□□□□ -1.16
PTPREP23469 PUS3-203ENST00000530811 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
PTPREP23469 CLCA3P-201ENST00000284054 2407 ntTSL 5 BASIC7.81□□□□□ -1.16
PTPREP23469 ODF2L-202ENST00000317336 4376 ntTSL 5 BASIC7.81□□□□□ -1.16
PTPREP23469 STK4-207ENST00000499879 6161 ntTSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
PTPREP23469 AC110760.2-201ENST00000508031 2546 ntTSL 2 BASIC7.81□□□□□ -1.16
PTPREP23469 ARHGAP21-201ENST00000320481 4343 ntTSL 5 BASIC7.81□□□□□ -1.16
PTPREP23469 LINC02197-201ENST00000502659 2767 ntTSL 2 BASIC7.81□□□□□ -1.16
PTPREP23469 SRBD1-201ENST00000263736 3681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.81□□□□□ -1.16
PTPREP23469 CYP19A1-202ENST00000396404 2388 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.81□□□□□ -1.16
PTPREP23469 CD163-201ENST00000359156 4268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
PTPREP23469 MROH9-201ENST00000367758 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
PTPREP23469 DOCK11-201ENST00000276202 6625 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
PTPREP23469 AC119674.1-204ENST00000641348 1343 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
PTPREP23469 KLF7-201ENST00000309446 8362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
PTPREP23469 VWA5A-203ENST00000392748 3419 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
PTPREP23469 OR7D2-203ENST00000642043 3157 ntAPPRIS P1 BASIC7.8□□□□□ -1.16
PTPREP23469 ARPP21-203ENST00000396482 2416 ntTSL 2 BASIC7.8□□□□□ -1.16
PTPREP23469 TTC8-217ENST00000622513 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
PTPREP23469 SPATA31B1P-201ENST00000434692 4016 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
PTPREP23469 CDH12-208ENST00000522262 3028 ntTSL 2 BASIC7.8□□□□□ -1.16
PTPREP23469 NBPF11-202ENST00000614015 4630 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.8□□□□□ -1.16
PTPREP23469 MTND5P7-201ENST00000413558 1798 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
PTPREP23469 LINC00922-203ENST00000569736 1760 ntTSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
PTPREP23469 OLFM4-201ENST00000219022 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
PTPREP23469 DAZ1-201ENST00000382510 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
PTPREP23469 PYROXD1-201ENST00000240651 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
PTPREP23469 ADGRL3-205ENST00000506746 4935 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
PTPREP23469 STAG3L4-201ENST00000352103 530 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
PTPREP23469 RNY4P16-201ENST00000364768 94 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
PTPREP23469 RNU6-532P-201ENST00000384318 107 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
PTPREP23469 RNU6-713P-201ENST00000384761 107 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
PTPREP23469 HMGB1P17-201ENST00000403495 628 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
PTPREP23469 ATF2-205ENST00000409499 801 ntTSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
PTPREP23469 AL359853.3-201ENST00000423879 544 ntTSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
PTPREP23469 AC005083.1-202ENST00000430859 740 ntTSL 2 BASIC7.8□□□□□ -1.16
PTPREP23469 LINC02522-201ENST00000431401 256 ntTSL 3 BASIC7.8□□□□□ -1.16
PTPREP23469 AC068888.2-201ENST00000435621 536 ntTSL 3 BASIC7.8□□□□□ -1.16
PTPREP23469 AL138787.1-202ENST00000437804 898 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
PTPREP23469 RPS10P18-201ENST00000442662 495 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
PTPREP23469 AL139161.1-201ENST00000443207 190 ntTSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
PTPREP23469 PRELID3BP1-201ENST00000457142 540 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
PTPREP23469 RPL23AP11-201ENST00000475260 469 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
PTPREP23469 RPL7P43-201ENST00000478876 753 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
PTPREP23469 AC018797.1-201ENST00000510791 255 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
PTPREP23469 MTCO3P44-201ENST00000510977 541 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
PTPREP23469 AC093664.1-201ENST00000511779 289 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
PTPREP23469 AC093689.1-201ENST00000514737 246 ntTSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
PTPREP23469 RNU4ATAC7P-201ENST00000516280 125 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
PTPREP23469 RNA5SP337-201ENST00000517007 109 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
PTPREP23469 SNRPCP6-201ENST00000528310 210 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
PTPREP23469 AP003031.2-202ENST00000533590 572 ntTSL 4 BASIC7.8□□□□□ -1.16
PTPREP23469 COG2-209ENST00000534989 2963 ntTSL 2 BASIC7.8□□□□□ -1.16
PTPREP23469 AP000763.2-201ENST00000540641 163 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
PTPREP23469 AC092375.1-201ENST00000550410 637 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
PTPREP23469 AL133279.2-201ENST00000556546 428 ntTSL 3 BASIC7.8□□□□□ -1.16
PTPREP23469 MIR7515HG-226ENST00000588330 1055 ntTSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
PTPREP23469 AC002115.1-201ENST00000589603 568 ntTSL 4 BASIC7.8□□□□□ -1.16
PTPREP23469 AC008752.2-201ENST00000591174 750 ntTSL 3 BASIC7.8□□□□□ -1.16
PTPREP23469 AC125232.2-201ENST00000592457 143 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
PTPREP23469 AL355297.3-201ENST00000604082 446 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
PTPREP23469 Z99755.2-201ENST00000610215 364 ntTSL 3 BASIC7.8□□□□□ -1.16
PTPREP23469 AC239809.3-203ENST00000611286 1050 ntTSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
PTPREP23469 MIR6071-201ENST00000616741 78 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
PTPREP23469 Six3os1_1.1-201ENST00000620900 87 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
PTPREP23469 AL512643.1-201ENST00000635735 524 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
PTPREP23469 AC132825.6-201ENST00000638861 357 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
PTPREP23469 AL354702.2-202ENST00000641481 890 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
PTPREP23469 USP32-214ENST00000592339 4045 ntTSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
PTPREP23469 SUPT7L-202ENST00000404798 4114 ntTSL 2 BASIC7.8□□□□□ -1.16
PTPREP23469 TNRC6A-202ENST00000395799 8438 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
PTPREP23469 REST-201ENST00000309042 7300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
PTPREP23469 ZNF101P1-201ENST00000435701 1720 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
PTPREP23469 SLC26A7-202ENST00000309536 2656 ntTSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
PTPREP23469 THUMPD3P1-201ENST00000506556 1480 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
PTPREP23469 GABRA2-205ENST00000507069 1562 ntTSL 3 BASIC7.8□□□□□ -1.16
PTPREP23469 LINC01011-204ENST00000605901 1573 ntTSL 2 BASIC7.8□□□□□ -1.16
PTPREP23469 AL136317.2-201ENST00000619851 2254 ntTSL 2 BASIC7.8□□□□□ -1.16
PTPREP23469 EPHA3-203ENST00000494014 3085 ntTSL 1 (best) BASIC7.8□□□□□ -1.16
PTPREP23469 TEX14-203ENST00000389934 4927 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
PTPREP23469 C12orf60-201ENST00000330828 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
PTPREP23469 AC110597.1-201ENST00000562669 3176 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
PTPREP23469 EOGT-209ENST00000540955 1332 ntTSL 2 BASIC7.79□□□□□ -1.16
PTPREP23469 PYROXD1-205ENST00000538582 3639 ntTSL 2 BASIC7.79□□□□□ -1.16
PTPREP23469 NXF2B-203ENST00000604395 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
PTPREP23469 NXF2-201ENST00000604790 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
PTPREP23469 NEK5-201ENST00000355568 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.79□□□□□ -1.16
PTPREP23469 AC009948.3-201ENST00000603415 1798 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
PTPREP23469 SRGAP3-213ENST00000618999 3929 ntTSL 5 BASIC7.79□□□□□ -1.16
PTPREP23469 SAMMSON-213ENST00000641336 1521 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
PTPREP23469 AC233263.6-201ENST00000631132 1963 ntBASIC7.79□□□□□ -1.16
PTPREP23469 ANKFN1-201ENST00000318698 2426 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.79□□□□□ -1.16
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