Protein–RNA interactions for Protein: O75150

RNF40, E3 ubiquitin-protein ligase BRE1B, humanhuman

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Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF40O75150 SPAM1-201ENST00000223028 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
RNF40O75150 IL5RA-201ENST00000256452 2001 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
RNF40O75150 NCOA2-201ENST00000452400 8447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
RNF40O75150 FAM197Y2-202ENST00000448006 2338 ntTSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
RNF40O75150 ZNF528-203ENST00000391788 4209 ntTSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
RNF40O75150 STON2-206ENST00000555447 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
RNF40O75150 C2CD5-202ENST00000396028 3463 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
RNF40O75150 C2CD5-203ENST00000446597 3490 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
RNF40O75150 C2CD5-206ENST00000536386 3496 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
RNF40O75150 OR52H1-201ENST00000322653 1057 ntAPPRIS P1 BASIC7.4□□□□□ -1.22
RNF40O75150 RPL7-201ENST00000352983 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
RNF40O75150 IGKV7-3-201ENST00000357453 298 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
RNF40O75150 Y_RNA.378-201ENST00000365652 113 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
RNF40O75150 OR52E6-202ENST00000379946 954 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
RNF40O75150 AL360182.1-201ENST00000397433 468 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
RNF40O75150 AL136100.1-201ENST00000407696 330 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
RNF40O75150 RNU2-18P-201ENST00000411224 162 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
RNF40O75150 AL593856.1-201ENST00000419949 805 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
RNF40O75150 AC073283.2-202ENST00000426892 591 ntTSL 4 BASIC7.4□□□□□ -1.22
RNF40O75150 HNRNPA3P4-201ENST00000427514 803 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
RNF40O75150 LINC01307-201ENST00000439146 474 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
RNF40O75150 AC093579.1-201ENST00000439455 352 ntTSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
RNF40O75150 IGKV1OR-3-201ENST00000446944 348 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
RNF40O75150 AL035420.1-202ENST00000450129 357 ntTSL 3 BASIC7.4□□□□□ -1.22
RNF40O75150 KF459542.1-201ENST00000450908 553 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
RNF40O75150 RPS20P32-201ENST00000456044 356 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
RNF40O75150 RNU6-1132P-201ENST00000459214 107 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
RNF40O75150 AC040975.1-201ENST00000472104 316 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
RNF40O75150 AC092436.1-201ENST00000506450 503 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
RNF40O75150 AC093689.1-201ENST00000514737 246 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
RNF40O75150 RFPL4AP3-201ENST00000515267 345 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
RNF40O75150 AC012400.1-201ENST00000518452 381 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
RNF40O75150 AC090193.1-202ENST00000524355 566 ntTSL 4 BASIC7.4□□□□□ -1.22
RNF40O75150 AP001803.1-201ENST00000525668 147 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
RNF40O75150 RPL27A-211ENST00000532359 406 ntTSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
RNF40O75150 AC156455.1-201ENST00000538790 851 ntTSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
RNF40O75150 AL135978.1-201ENST00000553618 1266 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
RNF40O75150 RN7SL66P-201ENST00000582099 264 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
RNF40O75150 AC063962.1-201ENST00000608199 521 ntBASIC7.4□□□□□ -1.22
RNF40O75150 Z98949.1-217ENST00000609275 994 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.22
RNF40O75150 TRIM38-201ENST00000357085 9413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
RNF40O75150 HEPH-206ENST00000441993 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
RNF40O75150 KIAA1549L-201ENST00000265654 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
RNF40O75150 NCOR1-201ENST00000268712 10720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.22
RNF40O75150 ALS2CR12-207ENST00000439709 1626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.22
RNF40O75150 LINC01676-202ENST00000435253 1849 ntTSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
RNF40O75150 PCNX4-201ENST00000317623 17339 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.23
RNF40O75150 CASC1-205ENST00000545133 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.23
RNF40O75150 OR4N5-202ENST00000641086 2187 ntAPPRIS P1 BASIC7.4□□□□□ -1.23
RNF40O75150 OR2J2-203ENST00000641417 2392 ntAPPRIS P1 BASIC7.4□□□□□ -1.23
RNF40O75150 ZNF138-204ENST00000437743 2574 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
RNF40O75150 AC107884.1-202ENST00000622955 2703 ntTSL 5 BASIC7.4□□□□□ -1.23
RNF40O75150 RRS1-AS1-201ENST00000499642 4366 ntTSL 2 BASIC7.4□□□□□ -1.23
RNF40O75150 SPHKAP-201ENST00000344657 6804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
RNF40O75150 ARHGAP32-201ENST00000310343 10111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.4□□□□□ -1.23
RNF40O75150 SULF1-201ENST00000260128 5710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
RNF40O75150 BROX-201ENST00000340934 4124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
RNF40O75150 ZNF761-202ENST00000432094 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
RNF40O75150 L3MBTL3-209ENST00000533560 3165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
RNF40O75150 MLIP-206ENST00000502396 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
RNF40O75150 SCYL3-201ENST00000367770 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
RNF40O75150 AC006305.1-201ENST00000382897 2558 ntTSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
RNF40O75150 Z98257.1-202ENST00000431027 2493 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
RNF40O75150 HSP90AA2P-201ENST00000530115 2196 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
RNF40O75150 SAMD3-205ENST00000457563 1877 ntTSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
RNF40O75150 WDR93-204ENST00000558000 1886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
RNF40O75150 ZNF480-201ENST00000334564 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
RNF40O75150 UEVLD-202ENST00000320750 1799 ntTSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
RNF40O75150 AL121949.2-201ENST00000403446 1548 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
RNF40O75150 WDR95P-201ENST00000425638 1542 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
RNF40O75150 AC011346.1-201ENST00000638059 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
RNF40O75150 CSDE1-203ENST00000358528 4076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.39□□□□□ -1.23
RNF40O75150 AL139352.1-201ENST00000255183 1001 ntTSL 2 BASIC7.39□□□□□ -1.23
RNF40O75150 Y_RNA.22-201ENST00000362492 102 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
RNF40O75150 SNORD113-7-201ENST00000363762 77 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
RNF40O75150 Y_RNA.180-201ENST00000363867 113 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
RNF40O75150 RN7SKP62-201ENST00000384539 329 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
RNF40O75150 RNU6-328P-201ENST00000390887 106 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
RNF40O75150 RN7SKP121-201ENST00000410842 305 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
RNF40O75150 PRELID3BP11-201ENST00000414230 479 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
RNF40O75150 AL133268.2-201ENST00000416595 430 ntTSL 3 BASIC7.39□□□□□ -1.23
RNF40O75150 RPS15AP12-201ENST00000419498 388 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
RNF40O75150 PGBD4P6-201ENST00000421501 610 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
RNF40O75150 CHIAP3-201ENST00000423668 1133 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
RNF40O75150 OR4K11P-201ENST00000431829 904 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
RNF40O75150 FTLP17-201ENST00000432567 525 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
RNF40O75150 AC005019.1-201ENST00000436455 431 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
RNF40O75150 AC064862.5-201ENST00000440618 334 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
RNF40O75150 AC108463.2-201ENST00000451230 412 ntTSL 5 BASIC7.39□□□□□ -1.23
RNF40O75150 AL356364.1-201ENST00000458443 182 ntTSL 3 BASIC7.39□□□□□ -1.23
RNF40O75150 RPL35AP28-201ENST00000459730 331 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
RNF40O75150 AC117395.2-201ENST00000463122 1128 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
RNF40O75150 RN7SL160P-201ENST00000468558 284 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
RNF40O75150 RN7SL88P-201ENST00000480166 299 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
RNF40O75150 AP001025.2-201ENST00000490908 477 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
RNF40O75150 ALDH7A1P3-201ENST00000492517 345 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
RNF40O75150 AC008967.1-201ENST00000504843 163 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
RNF40O75150 AC111194.1-201ENST00000509711 422 ntTSL 3 BASIC7.39□□□□□ -1.23
RNF40O75150 RNU6-138P-201ENST00000515952 107 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
RNF40O75150 RN7SKP99-201ENST00000517028 307 ntBASIC7.39□□□□□ -1.23
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