Protein–RNA interactions for Protein: O43365

HOXA3, Homeobox protein Hox-A3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 443 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA3O43365 MLECP1-201ENST00000615893 709 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
HOXA3O43365 MIR6826-201ENST00000617808 98 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
HOXA3O43365 AC099654.5-201ENST00000636479 350 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
HOXA3O43365 AC008703.1-201ENST00000637629 1174 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
HOXA3O43365 AC018793.1-201ENST00000638166 585 ntAPPRIS P1 BASIC4.81□□□□□ -1.64
HOXA3O43365 OR2L1P-202ENST00000641567 1023 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
HOXA3O43365 KSR2-202ENST00000425217 17008 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
HOXA3O43365 AC005162.3-201ENST00000609389 3695 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
HOXA3O43365 AP002004.1-201ENST00000532510 3530 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
HOXA3O43365 AC123769.1-201ENST00000530992 3192 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
HOXA3O43365 AC011504.1-201ENST00000623331 4103 ntBASIC4.81□□□□□ -1.64
HOXA3O43365 CPSF2-201ENST00000298875 13035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
HOXA3O43365 SFT2D2-201ENST00000271375 11040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.64
HOXA3O43365 BMPR2-204ENST00000638587 3443 ntTSL 5 BASIC4.81□□□□□ -1.64
HOXA3O43365 LGI1-202ENST00000371418 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
HOXA3O43365 TDO2-208ENST00000536354 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
HOXA3O43365 ZC3H7A-214ENST00000575984 2632 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
HOXA3O43365 RWDD2A-201ENST00000369724 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
HOXA3O43365 AC016745.2-201ENST00000608834 3443 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
HOXA3O43365 CCPG1-202ENST00000425574 1945 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
HOXA3O43365 ANKRD62P1-201ENST00000434304 1623 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
HOXA3O43365 HSPA13-201ENST00000285667 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
HOXA3O43365 MMP8-201ENST00000236826 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
HOXA3O43365 KCNH5-201ENST00000322893 11290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
HOXA3O43365 DYNC1I2-207ENST00000410079 2159 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
HOXA3O43365 SELENOWP1-201ENST00000322792 252 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
HOXA3O43365 OR6K2-201ENST00000359610 975 ntAPPRIS P1 BASIC4.8□□□□□ -1.64
HOXA3O43365 U8.3-201ENST00000363321 132 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
HOXA3O43365 FAM26F-203ENST00000368606 546 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
HOXA3O43365 RNU6-780P-201ENST00000391030 104 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
HOXA3O43365 RNU6-952P-201ENST00000391164 108 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
HOXA3O43365 KRTAP3-2-201ENST00000391587 702 ntAPPRIS P1 BASIC4.8□□□□□ -1.64
HOXA3O43365 AC016739.1-201ENST00000405359 345 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
HOXA3O43365 SNORA11B-201ENST00000408175 129 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
HOXA3O43365 RN7SKP285-201ENST00000410137 318 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
HOXA3O43365 RNU4-55P-201ENST00000410731 137 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
HOXA3O43365 LINC01359-201ENST00000415842 1157 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
HOXA3O43365 AC002064.2-201ENST00000420245 289 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
HOXA3O43365 AC078960.1-201ENST00000422160 177 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
HOXA3O43365 AC007568.1-201ENST00000422912 471 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
HOXA3O43365 AL360007.1-201ENST00000426166 349 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
HOXA3O43365 AC127526.2-201ENST00000426436 775 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
HOXA3O43365 AL355314.2-201ENST00000427182 436 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
HOXA3O43365 AC003092.1-202ENST00000438538 743 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
HOXA3O43365 LINC01891-201ENST00000439798 538 ntTSL 4 BASIC4.8□□□□□ -1.64
HOXA3O43365 MTND5P14-201ENST00000441481 1267 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
HOXA3O43365 DPPA3P1-201ENST00000448050 469 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
HOXA3O43365 AL645937.3-201ENST00000453647 936 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
HOXA3O43365 LINC00456-201ENST00000453862 692 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
HOXA3O43365 MTCO3P20-201ENST00000454926 688 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
HOXA3O43365 AC099563.1-201ENST00000456086 418 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
HOXA3O43365 AC092832.2-201ENST00000456621 389 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
HOXA3O43365 LINC01546-201ENST00000457435 674 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
HOXA3O43365 NCOR1P1-201ENST00000478176 406 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
HOXA3O43365 RN7SL284P-201ENST00000498823 275 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
HOXA3O43365 HMGB1P29-201ENST00000505659 499 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
HOXA3O43365 ARL4AP2-201ENST00000507378 601 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
HOXA3O43365 AC097460.1-201ENST00000514624 590 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
HOXA3O43365 RNU6-507P-201ENST00000516045 100 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
HOXA3O43365 RN7SKP96-201ENST00000516948 297 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
HOXA3O43365 LINC00535-202ENST00000517785 264 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
HOXA3O43365 AC105177.1-201ENST00000523110 555 ntTSL 4 BASIC4.8□□□□□ -1.64
HOXA3O43365 AC013644.1-201ENST00000523724 555 ntTSL 4 BASIC4.8□□□□□ -1.64
HOXA3O43365 IGHVIII-67-4-201ENST00000524281 296 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
HOXA3O43365 CASP1-212ENST00000531166 300 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
HOXA3O43365 AC022075.3-201ENST00000539009 649 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
HOXA3O43365 AC073912.2-201ENST00000542821 317 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
HOXA3O43365 AP003781.1-201ENST00000543403 404 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
HOXA3O43365 MYL6-213ENST00000549017 502 ntTSL 3 BASIC4.8□□□□□ -1.64
HOXA3O43365 AC025031.1-201ENST00000552634 562 ntTSL 4 BASIC4.8□□□□□ -1.64
HOXA3O43365 CENPUP2-201ENST00000555897 1186 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
HOXA3O43365 HSPE1P3-201ENST00000559254 309 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
HOXA3O43365 TMEM159-205ENST00000572599 713 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
HOXA3O43365 MIR5186-201ENST00000577504 120 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
HOXA3O43365 MIR4675-201ENST00000577898 77 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
HOXA3O43365 AC020916.2-201ENST00000591242 360 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
HOXA3O43365 MIR7515HG-254ENST00000593269 943 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
HOXA3O43365 AL356055.1-201ENST00000602528 446 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
HOXA3O43365 AC078899.5-201ENST00000612475 178 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
HOXA3O43365 BIRC6-AS2-201ENST00000623382 589 ntTSL 2 BASIC4.8□□□□□ -1.64
HOXA3O43365 AP003400.3-201ENST00000624904 346 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
HOXA3O43365 AP005264.7-201ENST00000625003 745 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
HOXA3O43365 PISRT1-201ENST00000626175 531 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
HOXA3O43365 LRRC77P-213ENST00000637727 880 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
HOXA3O43365 IGLV10-54-202ENST00000640991 351 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
HOXA3O43365 AC116667.2-201ENST00000641075 823 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
HOXA3O43365 WDPCP-203ENST00000409120 5408 ntTSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
HOXA3O43365 AC117529.2-201ENST00000512159 2068 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
HOXA3O43365 NRCAM-210ENST00000425651 3915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
HOXA3O43365 CLCC1-204ENST00000369968 4151 ntTSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
HOXA3O43365 NRDE2-201ENST00000354366 14208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
HOXA3O43365 CPB2-201ENST00000181383 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
HOXA3O43365 ECT2L-201ENST00000367682 4343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
HOXA3O43365 ECT2L-203ENST00000423192 4319 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
HOXA3O43365 HSFY2-201ENST00000304790 1444 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
HOXA3O43365 HSFY1-201ENST00000307393 1444 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC4.8□□□□□ -1.64
HOXA3O43365 AP002907.1-201ENST00000606361 1430 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
HOXA3O43365 AC083837.1-201ENST00000565297 2994 ntBASIC4.8□□□□□ -1.64
HOXA3O43365 MGAT4C-202ENST00000548651 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
HOXA3O43365 LPAR6-209ENST00000620633 2175 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.8□□□□□ -1.64
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