Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6Q1

CAPN6, Calpain-6, humanhuman

Predictions only

Length 641 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN6Q9Y6Q1 AP000432.1-201ENST00000416641 516 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
CAPN6Q9Y6Q1 EFCAB14-AS1-201ENST00000418985 491 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
CAPN6Q9Y6Q1 AL161935.1-201ENST00000420945 421 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
CAPN6Q9Y6Q1 AL136322.1-201ENST00000422250 548 ntTSL 4 BASIC5.96□□□□□ -1.46
CAPN6Q9Y6Q1 AL513185.2-201ENST00000425543 193 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
CAPN6Q9Y6Q1 AC074011.1-201ENST00000431376 581 ntTSL 4 BASIC5.96□□□□□ -1.46
CAPN6Q9Y6Q1 AL358934.1-201ENST00000432346 324 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
CAPN6Q9Y6Q1 SPINK8-201ENST00000434006 444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
CAPN6Q9Y6Q1 PNKDP1-201ENST00000435914 430 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
CAPN6Q9Y6Q1 RPS19P6-201ENST00000441327 433 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
CAPN6Q9Y6Q1 HMGB1P7-201ENST00000450921 612 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
CAPN6Q9Y6Q1 AZGP1P2-201ENST00000454506 345 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
CAPN6Q9Y6Q1 RPL18AP17-201ENST00000455326 198 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
CAPN6Q9Y6Q1 AC091564.1-201ENST00000464563 479 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
CAPN6Q9Y6Q1 SELENOT-204ENST00000480740 783 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
CAPN6Q9Y6Q1 ATP5LP5-201ENST00000483050 299 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
CAPN6Q9Y6Q1 AC091544.1-201ENST00000484702 348 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
CAPN6Q9Y6Q1 RPS27P20-201ENST00000492051 246 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
CAPN6Q9Y6Q1 AC114981.1-201ENST00000503897 678 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
CAPN6Q9Y6Q1 AC002460.1-201ENST00000504394 370 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
CAPN6Q9Y6Q1 AC021678.1-201ENST00000505195 936 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
CAPN6Q9Y6Q1 AC108064.1-201ENST00000513791 460 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
CAPN6Q9Y6Q1 PRMT5P1-201ENST00000514351 598 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
CAPN6Q9Y6Q1 RNU6-1261P-201ENST00000517194 104 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
CAPN6Q9Y6Q1 AC138832.1-201ENST00000522871 556 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
CAPN6Q9Y6Q1 CASC19-203ENST00000523510 575 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
CAPN6Q9Y6Q1 LINC02545-201ENST00000525381 306 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
CAPN6Q9Y6Q1 GTF2IP11-201ENST00000526931 420 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
CAPN6Q9Y6Q1 AC022878.1-201ENST00000530684 149 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
CAPN6Q9Y6Q1 AC090791.1-201ENST00000530960 492 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
CAPN6Q9Y6Q1 LDHC-203ENST00000535809 757 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
CAPN6Q9Y6Q1 AC007406.1-201ENST00000544067 315 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
CAPN6Q9Y6Q1 AC117505.1-202ENST00000547027 566 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
CAPN6Q9Y6Q1 CBX3P5-201ENST00000552017 521 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
CAPN6Q9Y6Q1 TRAV15-201ENST00000556680 249 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
CAPN6Q9Y6Q1 AC010325.1-202ENST00000562076 279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
CAPN6Q9Y6Q1 OR1E3-201ENST00000575608 948 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
CAPN6Q9Y6Q1 AC004448.4-204ENST00000585389 743 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
CAPN6Q9Y6Q1 AC006116.9-203ENST00000591036 566 ntTSL 4 BASIC5.96□□□□□ -1.46
CAPN6Q9Y6Q1 AC024075.3-201ENST00000601687 453 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
CAPN6Q9Y6Q1 XIST-210ENST00000602863 775 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
CAPN6Q9Y6Q1 AC112187.2-201ENST00000604345 283 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
CAPN6Q9Y6Q1 AP004247.3-201ENST00000608682 624 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
CAPN6Q9Y6Q1 Metazoa_SRP.35-201ENST00000611402 288 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
CAPN6Q9Y6Q1 AC009233.1-201ENST00000616477 371 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
CAPN6Q9Y6Q1 AC005154.1-203ENST00000626245 451 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
CAPN6Q9Y6Q1 MIR3662-201ENST00000637030 95 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
CAPN6Q9Y6Q1 AC092329.4-204ENST00000639327 549 ntTSL 4 BASIC5.96□□□□□ -1.46
CAPN6Q9Y6Q1 OR51F2-202ENST00000641672 1136 ntAPPRIS P2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
CAPN6Q9Y6Q1 ERC1-222ENST00000589028 9202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
CAPN6Q9Y6Q1 SEC31A-204ENST00000355196 4104 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
CAPN6Q9Y6Q1 BCORP1-203ENST00000513194 5093 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
CAPN6Q9Y6Q1 NADK2-201ENST00000282512 2507 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
CAPN6Q9Y6Q1 AL359313.1-201ENST00000447311 2293 ntTSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
CAPN6Q9Y6Q1 AC025034.1-201ENST00000552778 1711 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
CAPN6Q9Y6Q1 SLC12A1-205ENST00000558405 3426 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
CAPN6Q9Y6Q1 TUBD1-214ENST00000592426 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
CAPN6Q9Y6Q1 PATE4-201ENST00000457514 1983 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
CAPN6Q9Y6Q1 ALCAM-205ENST00000472644 4189 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
CAPN6Q9Y6Q1 DCDC1-203ENST00000406071 4758 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
CAPN6Q9Y6Q1 ATXN7-208ENST00000484332 2741 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
CAPN6Q9Y6Q1 LARP4-203ENST00000398473 6427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
CAPN6Q9Y6Q1 OR7C1-203ENST00000641666 11711 ntAPPRIS P1 BASIC5.95□□□□□ -1.46
CAPN6Q9Y6Q1 DNAH12-201ENST00000311202 1555 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
CAPN6Q9Y6Q1 GAPDHP24-201ENST00000328713 983 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
CAPN6Q9Y6Q1 RNU6-582P-201ENST00000362989 107 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
CAPN6Q9Y6Q1 RNU6-492P-201ENST00000363035 104 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
CAPN6Q9Y6Q1 Y_RNA.162-201ENST00000363683 102 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
CAPN6Q9Y6Q1 RNU4-7P-201ENST00000364758 141 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
CAPN6Q9Y6Q1 ABI1-210ENST00000376170 3362 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
CAPN6Q9Y6Q1 RNA5SP187-201ENST00000384400 119 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
CAPN6Q9Y6Q1 RNU6-1122P-201ENST00000384449 107 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
CAPN6Q9Y6Q1 MIR551B-201ENST00000384984 96 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
CAPN6Q9Y6Q1 U8.14-201ENST00000390843 143 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
CAPN6Q9Y6Q1 RPS6P23-201ENST00000413224 722 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
CAPN6Q9Y6Q1 RPS3AP9-201ENST00000417027 792 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
CAPN6Q9Y6Q1 TMBIM7P-201ENST00000418074 855 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
CAPN6Q9Y6Q1 AC083875.1-201ENST00000419509 405 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
CAPN6Q9Y6Q1 AL034379.1-201ENST00000423216 253 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
CAPN6Q9Y6Q1 TXNDC8-204ENST00000423740 356 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
CAPN6Q9Y6Q1 AL589986.2-201ENST00000429352 397 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
CAPN6Q9Y6Q1 AC024908.1-202ENST00000441907 764 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
CAPN6Q9Y6Q1 RPL5P7-201ENST00000444235 813 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
CAPN6Q9Y6Q1 AL138921.1-201ENST00000444359 846 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
CAPN6Q9Y6Q1 AL356859.1-201ENST00000449180 414 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
CAPN6Q9Y6Q1 RPS29P25-201ENST00000481709 171 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
CAPN6Q9Y6Q1 AC009120.1-201ENST00000493458 473 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
CAPN6Q9Y6Q1 RN7SL57P-201ENST00000493687 290 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
CAPN6Q9Y6Q1 AC008443.2-201ENST00000499096 566 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
CAPN6Q9Y6Q1 AC093864.1-201ENST00000504555 745 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
CAPN6Q9Y6Q1 AC098799.3-201ENST00000506095 438 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
CAPN6Q9Y6Q1 GABRA2-205ENST00000507069 1562 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
CAPN6Q9Y6Q1 SEC24D-211ENST00000511481 2626 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
CAPN6Q9Y6Q1 MTND5P4-201ENST00000514978 288 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
CAPN6Q9Y6Q1 TBCA-203ENST00000517679 545 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
CAPN6Q9Y6Q1 TPT1-AS1-207ENST00000520310 563 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
CAPN6Q9Y6Q1 YWHAZ-220ENST00000522819 875 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
CAPN6Q9Y6Q1 AC022695.3-201ENST00000523385 478 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
CAPN6Q9Y6Q1 AC084125.1-201ENST00000525461 429 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
CAPN6Q9Y6Q1 TAS2R14-202ENST00000537503 1858 ntAPPRIS P1 BASIC5.95□□□□□ -1.46
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