Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPL8

TIMMDC1, Complex I assembly factor TIMMDC1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 285 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMMDC1Q9NPL8 LALBA-201ENST00000301046 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
TIMMDC1Q9NPL8 OR6P1-201ENST00000334632 954 ntAPPRIS P1 BASIC6.46□□□□□ -1.38
TIMMDC1Q9NPL8 RN7SKP107-201ENST00000364157 290 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
TIMMDC1Q9NPL8 RNU11-201ENST00000387069 134 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
TIMMDC1Q9NPL8 MRPL42P3-201ENST00000401492 326 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
TIMMDC1Q9NPL8 DHFRP6-201ENST00000401776 268 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
TIMMDC1Q9NPL8 AL359715.1-201ENST00000404330 555 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
TIMMDC1Q9NPL8 MIR548I3-201ENST00000408378 149 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
TIMMDC1Q9NPL8 MIR548I1-201ENST00000408810 149 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
TIMMDC1Q9NPL8 NUCB1-AS1-201ENST00000416432 433 ntTSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.38
TIMMDC1Q9NPL8 AP006748.1-201ENST00000418874 346 ntTSL 3 BASIC6.46□□□□□ -1.38
TIMMDC1Q9NPL8 AL672212.1-201ENST00000422246 400 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
TIMMDC1Q9NPL8 AC233981.1-201ENST00000423224 461 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
TIMMDC1Q9NPL8 LINC01208-202ENST00000434969 827 ntTSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.38
TIMMDC1Q9NPL8 AC133865.1-201ENST00000438619 339 ntTSL 3 BASIC6.46□□□□□ -1.38
TIMMDC1Q9NPL8 AC004980.3-201ENST00000447046 365 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
TIMMDC1Q9NPL8 AC107399.1-201ENST00000451226 265 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
TIMMDC1Q9NPL8 RPS24P6-201ENST00000452670 400 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
TIMMDC1Q9NPL8 RPL23AP12-201ENST00000467573 473 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
TIMMDC1Q9NPL8 RPL21P99-201ENST00000480369 423 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
TIMMDC1Q9NPL8 MRPL57P6-201ENST00000506570 309 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
TIMMDC1Q9NPL8 TMPRSS11BNL-202ENST00000510782 3202 ntTSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.38
TIMMDC1Q9NPL8 AC109454.3-201ENST00000512748 669 ntTSL 3 BASIC6.46□□□□□ -1.38
TIMMDC1Q9NPL8 RNU4ATAC8P-201ENST00000516196 109 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
TIMMDC1Q9NPL8 SCARNA24.1-201ENST00000516465 137 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
TIMMDC1Q9NPL8 RNU6-410P-201ENST00000517006 107 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
TIMMDC1Q9NPL8 AC022509.1-203ENST00000541940 708 ntTSL 4 BASIC6.46□□□□□ -1.38
TIMMDC1Q9NPL8 AC012100.2-201ENST00000558317 304 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
TIMMDC1Q9NPL8 HSPE1P3-201ENST00000559254 309 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
TIMMDC1Q9NPL8 AC009117.3-202ENST00000563825 557 ntTSL 4 BASIC6.46□□□□□ -1.38
TIMMDC1Q9NPL8 AC010287.1-201ENST00000566916 357 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
TIMMDC1Q9NPL8 AC105411.1-203ENST00000568819 601 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
TIMMDC1Q9NPL8 AC011476.3-203ENST00000586961 346 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
TIMMDC1Q9NPL8 AC114684.1-201ENST00000587659 352 ntTSL 3 BASIC6.46□□□□□ -1.38
TIMMDC1Q9NPL8 AP001029.3-201ENST00000588063 596 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
TIMMDC1Q9NPL8 AC011447.2-201ENST00000592921 283 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
TIMMDC1Q9NPL8 AC010139.1-201ENST00000596963 445 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
TIMMDC1Q9NPL8 AC012313.1-202ENST00000597309 423 ntTSL 3 BASIC6.46□□□□□ -1.38
TIMMDC1Q9NPL8 AL360012.1-201ENST00000602813 131 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
TIMMDC1Q9NPL8 AC106782.7-201ENST00000624024 418 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
TIMMDC1Q9NPL8 AC133555.5-201ENST00000624430 418 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
TIMMDC1Q9NPL8 STK3-216ENST00000523601 3107 ntTSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.38
TIMMDC1Q9NPL8 AL391704.1-201ENST00000422206 2368 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
TIMMDC1Q9NPL8 PRRC1-201ENST00000296666 4699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
TIMMDC1Q9NPL8 ECT2-201ENST00000232458 4087 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
TIMMDC1Q9NPL8 TYW3-203ENST00000457880 3335 ntTSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.38
TIMMDC1Q9NPL8 AC011455.2-201ENST00000599320 3336 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
TIMMDC1Q9NPL8 TAB3P1-202ENST00000452645 1634 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
TIMMDC1Q9NPL8 LARP1B-203ENST00000432347 2707 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
TIMMDC1Q9NPL8 LPAR6-201ENST00000345941 2428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.46□□□□□ -1.38
TIMMDC1Q9NPL8 MTPAP-201ENST00000263063 5601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
TIMMDC1Q9NPL8 ZC3H7A-214ENST00000575984 2632 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
TIMMDC1Q9NPL8 DTNA-206ENST00000399121 6490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
TIMMDC1Q9NPL8 JADE3-203ENST00000611250 4713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
TIMMDC1Q9NPL8 AL121949.2-201ENST00000403446 1548 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
TIMMDC1Q9NPL8 ARHGEF6-201ENST00000250617 6019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
TIMMDC1Q9NPL8 HPS5-205ENST00000438420 4147 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
TIMMDC1Q9NPL8 SETDB2-205ENST00000611815 5313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
TIMMDC1Q9NPL8 GRAMD2B-210ENST00000511134 1577 ntTSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
TIMMDC1Q9NPL8 MBNL2-201ENST00000343600 4596 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
TIMMDC1Q9NPL8 LINC00939-201ENST00000502479 4972 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
TIMMDC1Q9NPL8 SLC16A4-201ENST00000369779 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
TIMMDC1Q9NPL8 TSHB-201ENST00000256592 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
TIMMDC1Q9NPL8 RPL23AP57-201ENST00000332361 466 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
TIMMDC1Q9NPL8 RNU6-1013P-201ENST00000384180 107 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
TIMMDC1Q9NPL8 LIPN-201ENST00000404459 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
TIMMDC1Q9NPL8 AL590290.1-201ENST00000405336 380 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
TIMMDC1Q9NPL8 MEIG1-202ENST00000407572 625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
TIMMDC1Q9NPL8 RN7SKP271-201ENST00000410528 320 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
TIMMDC1Q9NPL8 RPSAP60-201ENST00000415403 880 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
TIMMDC1Q9NPL8 METTL15P3-201ENST00000415522 1221 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
TIMMDC1Q9NPL8 RPL31P12-201ENST00000422587 358 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
TIMMDC1Q9NPL8 AC007365.2-201ENST00000428806 458 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
TIMMDC1Q9NPL8 AL138759.1-201ENST00000432120 645 ntTSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
TIMMDC1Q9NPL8 TXNP1-201ENST00000441872 371 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
TIMMDC1Q9NPL8 AL845321.1-201ENST00000444603 348 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
TIMMDC1Q9NPL8 AL035666.1-201ENST00000446195 348 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
TIMMDC1Q9NPL8 ELOCP24-201ENST00000456370 334 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
TIMMDC1Q9NPL8 KCNIP2-211ENST00000461105 858 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
TIMMDC1Q9NPL8 RPS26P11-201ENST00000463445 348 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
TIMMDC1Q9NPL8 AC010301.1-201ENST00000473936 355 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
TIMMDC1Q9NPL8 RPS26P6-201ENST00000475156 348 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
TIMMDC1Q9NPL8 AC034234.1-201ENST00000502993 465 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
TIMMDC1Q9NPL8 AC099499.1-201ENST00000505040 558 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
TIMMDC1Q9NPL8 AC091885.1-201ENST00000506658 268 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
TIMMDC1Q9NPL8 MTCYBP40-201ENST00000509390 1135 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
TIMMDC1Q9NPL8 RPS3A-208ENST00000509736 576 ntTSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
TIMMDC1Q9NPL8 AC084116.3-201ENST00000519123 429 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
TIMMDC1Q9NPL8 RANP9-201ENST00000519957 271 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
TIMMDC1Q9NPL8 AC024405.1-201ENST00000532521 1042 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
TIMMDC1Q9NPL8 ATPAF1-210ENST00000532925 998 ntTSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
TIMMDC1Q9NPL8 AC015818.3-202ENST00000579603 283 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
TIMMDC1Q9NPL8 SNORD39.2-201ENST00000579995 76 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
TIMMDC1Q9NPL8 AC090398.1-202ENST00000580403 457 ntTSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
TIMMDC1Q9NPL8 MIR4428-201ENST00000584884 73 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
TIMMDC1Q9NPL8 LINC01515-204ENST00000595269 402 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
TIMMDC1Q9NPL8 Metazoa_SRP.57-201ENST00000597717 283 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
TIMMDC1Q9NPL8 LINC02098-201ENST00000608492 475 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
TIMMDC1Q9NPL8 AC130324.3-201ENST00000614165 542 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
TIMMDC1Q9NPL8 Metazoa_SRP.66-201ENST00000615609 282 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.9 ms