Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q05

TRAPPC9, Trafficking protein particle complex subunit 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC9Q96Q05 AC004057.1-202ENST00000356247 284 ntTSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
TRAPPC9Q96Q05 OR51A7-201ENST00000359350 1048 ntAPPRIS P1 BASIC4.93□□□□□ -1.62
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-839P-201ENST00000363347 108 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
TRAPPC9Q96Q05 CNIH4-201ENST00000366856 808 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
TRAPPC9Q96Q05 EIF1AY-202ENST00000382772 746 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
TRAPPC9Q96Q05 MIR217-201ENST00000384817 110 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
TRAPPC9Q96Q05 AL138749.1-201ENST00000397864 791 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
TRAPPC9Q96Q05 AL160275.2-201ENST00000412010 394 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
TRAPPC9Q96Q05 SRGAP3-AS1-201ENST00000414633 428 ntTSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
TRAPPC9Q96Q05 AL591468.1-201ENST00000417932 573 ntTSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
TRAPPC9Q96Q05 AL672277.1-201ENST00000420865 588 ntTSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
TRAPPC9Q96Q05 AC007435.1-201ENST00000421086 415 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
TRAPPC9Q96Q05 AL589946.1-201ENST00000421465 420 ntTSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
TRAPPC9Q96Q05 OFD1P2Y-201ENST00000421895 1149 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
TRAPPC9Q96Q05 AC017002.2-201ENST00000426124 792 ntTSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
TRAPPC9Q96Q05 DPRXP1-201ENST00000426312 460 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
TRAPPC9Q96Q05 AL031736.2-201ENST00000426573 787 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
TRAPPC9Q96Q05 AC092164.1-202ENST00000428036 486 ntTSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
TRAPPC9Q96Q05 AP000695.2-201ENST00000428667 715 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
TRAPPC9Q96Q05 RBMY2QP-201ENST00000429799 1147 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
TRAPPC9Q96Q05 AL451070.1-201ENST00000430143 439 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
TRAPPC9Q96Q05 CASP12-204ENST00000433738 709 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
TRAPPC9Q96Q05 KCNIP1-205ENST00000434108 726 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
TRAPPC9Q96Q05 AC068058.1-201ENST00000435782 389 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
TRAPPC9Q96Q05 RHOT1P3-201ENST00000436571 331 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
TRAPPC9Q96Q05 LINC01052-201ENST00000437777 496 ntTSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
TRAPPC9Q96Q05 AC015971.1-202ENST00000439077 514 ntTSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
TRAPPC9Q96Q05 AL139230.1-201ENST00000440094 425 ntTSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
TRAPPC9Q96Q05 RAB11AP1-201ENST00000442978 646 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
TRAPPC9Q96Q05 H2AFZP6-201ENST00000444403 394 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
TRAPPC9Q96Q05 AC096644.1-201ENST00000446169 390 ntTSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
TRAPPC9Q96Q05 RPL7P59-201ENST00000447700 943 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
TRAPPC9Q96Q05 USP9YP25-201ENST00000457708 443 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
TRAPPC9Q96Q05 AC011979.1-201ENST00000472300 483 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
TRAPPC9Q96Q05 AC126121.1-201ENST00000482313 553 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
TRAPPC9Q96Q05 SSBP1-211ENST00000484178 676 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
TRAPPC9Q96Q05 HMGN2P25-201ENST00000486956 268 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
TRAPPC9Q96Q05 AL136537.1-202ENST00000501725 430 ntTSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
TRAPPC9Q96Q05 AC106821.1-201ENST00000502861 572 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
TRAPPC9Q96Q05 MTCYBP35-201ENST00000503630 1137 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
TRAPPC9Q96Q05 AC097173.1-201ENST00000505862 819 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
TRAPPC9Q96Q05 AC109471.1-201ENST00000511631 612 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
TRAPPC9Q96Q05 RPL7L1P13-201ENST00000511702 739 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
TRAPPC9Q96Q05 MRPS36P3-201ENST00000519284 130 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
TRAPPC9Q96Q05 AL035078.2-201ENST00000533832 326 ntTSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
TRAPPC9Q96Q05 PRR4-212ENST00000544994 326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
TRAPPC9Q96Q05 LINC01859-201ENST00000565584 1024 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
TRAPPC9Q96Q05 AC133065.1-201ENST00000572017 575 ntTSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
TRAPPC9Q96Q05 AC087501.4-201ENST00000574460 235 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
TRAPPC9Q96Q05 GAPLINC-202ENST00000579007 643 ntTSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
TRAPPC9Q96Q05 AC104785.1-201ENST00000603220 588 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
TRAPPC9Q96Q05 IMMP1LP1-201ENST00000605170 488 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
TRAPPC9Q96Q05 AC005392.3-201ENST00000607109 459 ntTSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
TRAPPC9Q96Q05 AP005432.2-201ENST00000608162 586 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
TRAPPC9Q96Q05 AC105227.2-201ENST00000615075 605 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
TRAPPC9Q96Q05 AL513314.2-204ENST00000619187 459 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
TRAPPC9Q96Q05 AC097655.1-201ENST00000635075 318 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
TRAPPC9Q96Q05 CNOT1-201ENST00000317147 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
TRAPPC9Q96Q05 AL451142.2-201ENST00000429076 2090 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
TRAPPC9Q96Q05 DCAF13P3-201ENST00000561147 1334 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
TRAPPC9Q96Q05 EEF1A1P42-201ENST00000613436 1331 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
TRAPPC9Q96Q05 AC092435.4-201ENST00000623012 4159 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
TRAPPC9Q96Q05 AC024337.2-201ENST00000616608 2797 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
TRAPPC9Q96Q05 IQGAP2-204ENST00000502745 3404 ntTSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
TRAPPC9Q96Q05 NFIB-210ENST00000543693 7622 ntTSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
TRAPPC9Q96Q05 MTND4P26-201ENST00000415971 1359 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
TRAPPC9Q96Q05 ZRANB3-201ENST00000264159 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
TRAPPC9Q96Q05 CNTN5-212ENST00000619298 5734 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
TRAPPC9Q96Q05 SMG1P6-201ENST00000532337 2930 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
TRAPPC9Q96Q05 AC064875.1-201ENST00000425974 1942 ntTSL 2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
TRAPPC9Q96Q05 ANKRD36B-202ENST00000359901 4297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
TRAPPC9Q96Q05 NT5C3A-203ENST00000396152 1788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
TRAPPC9Q96Q05 OR5F1-201ENST00000278409 945 ntAPPRIS P1 BASIC4.92□□□□□ -1.62
TRAPPC9Q96Q05 RNA5SP223-201ENST00000365174 120 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
TRAPPC9Q96Q05 RNA5SP455-201ENST00000365190 119 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
TRAPPC9Q96Q05 RNA5SP372-201ENST00000390836 115 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
TRAPPC9Q96Q05 AC136624.1-201ENST00000400791 413 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
TRAPPC9Q96Q05 AL109941.1-201ENST00000401925 229 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
TRAPPC9Q96Q05 PRRC2CP1-201ENST00000404428 159 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
TRAPPC9Q96Q05 AL590084.1-201ENST00000407885 387 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
TRAPPC9Q96Q05 AC098820.3-201ENST00000414135 976 ntTSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
TRAPPC9Q96Q05 PRELID3BP11-201ENST00000414230 479 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
TRAPPC9Q96Q05 GJA6P-201ENST00000415117 1042 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
TRAPPC9Q96Q05 AC013429.2-201ENST00000418798 781 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
TRAPPC9Q96Q05 NAALADL2-AS2-201ENST00000424690 1038 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
TRAPPC9Q96Q05 RPL21P43-201ENST00000425440 472 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
TRAPPC9Q96Q05 Z93242.1-201ENST00000427102 353 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
TRAPPC9Q96Q05 AL122010.1-201ENST00000429293 720 ntTSL 2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
TRAPPC9Q96Q05 AL353689.2-201ENST00000433837 440 ntTSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
TRAPPC9Q96Q05 PPIAP17-201ENST00000438507 471 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
TRAPPC9Q96Q05 USP9YP22-201ENST00000438971 294 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
TRAPPC9Q96Q05 MTND1P26-201ENST00000440488 538 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
TRAPPC9Q96Q05 AC004160.1-211ENST00000445839 565 ntTSL 4 BASIC4.92□□□□□ -1.62
TRAPPC9Q96Q05 HMGB1P48-201ENST00000446155 598 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
TRAPPC9Q96Q05 AC009987.1-201ENST00000446888 806 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
TRAPPC9Q96Q05 EIF4A1P11-201ENST00000451239 222 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
TRAPPC9Q96Q05 AL356981.1-201ENST00000454879 684 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
TRAPPC9Q96Q05 AL445488.1-201ENST00000457272 706 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
TRAPPC9Q96Q05 OR52A4P-201ENST00000472867 958 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
TRAPPC9Q96Q05 MYL12AP1-201ENST00000518490 515 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.5 ms