Protein–RNA interactions for Protein: Q68G74

LHX8, LIM/homeobox protein Lhx8, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX8Q68G74 ZFX-201ENST00000304543 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
LHX8Q68G74 FAM49B-226ENST00000523509 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
LHX8Q68G74 AC025569.1-202ENST00000548687 5903 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
LHX8Q68G74 AOX3P-204ENST00000491025 2107 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
LHX8Q68G74 ZNF181-203ENST00000459757 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
LHX8Q68G74 C14orf105-201ENST00000216445 3082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
LHX8Q68G74 MAPK14-203ENST00000310795 1066 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
LHX8Q68G74 RNA5SP308-201ENST00000362532 115 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
LHX8Q68G74 RNU4-90P-201ENST00000362773 141 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
LHX8Q68G74 RNA5-8SP7-201ENST00000363443 155 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
LHX8Q68G74 DEFB136-201ENST00000382209 237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
LHX8Q68G74 CACNA1C-220ENST00000399655 13433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
LHX8Q68G74 MIR1275-201ENST00000408770 80 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
LHX8Q68G74 RPS10P21-201ENST00000430654 475 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
LHX8Q68G74 AL358972.1-201ENST00000434356 466 ntTSL 2 BASIC7.99□□□□□ -1.13
LHX8Q68G74 AL353898.1-201ENST00000444055 238 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
LHX8Q68G74 MYT1L-AS1-202ENST00000448106 3230 ntTSL 2 BASIC7.99□□□□□ -1.13
LHX8Q68G74 AC013460.1-205ENST00000450695 518 ntTSL 4 BASIC7.99□□□□□ -1.13
LHX8Q68G74 CYCSP34-201ENST00000458172 304 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
LHX8Q68G74 AC117395.2-201ENST00000463122 1128 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
LHX8Q68G74 AC022795.1-201ENST00000473808 480 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
LHX8Q68G74 TBCAP3-201ENST00000512475 312 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
LHX8Q68G74 AC093816.1-201ENST00000515076 913 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
LHX8Q68G74 AC010420.1-201ENST00000515077 509 ntTSL 3 BASIC7.99□□□□□ -1.13
LHX8Q68G74 IGLC4-201ENST00000517690 248 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
LHX8Q68G74 IGHVIII-47-1-201ENST00000518187 331 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
LHX8Q68G74 AC104241.1-201ENST00000530039 628 ntTSL 3 BASIC7.99□□□□□ -1.13
LHX8Q68G74 AC103796.1-201ENST00000530663 358 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
LHX8Q68G74 DYNLL1P4-201ENST00000549314 266 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
LHX8Q68G74 AC026371.1-201ENST00000551867 419 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
LHX8Q68G74 AC015908.3-202ENST00000579367 457 ntTSL 2 BASIC7.99□□□□□ -1.13
LHX8Q68G74 MIR6861-201ENST00000618657 64 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
LHX8Q68G74 AC068860.1-201ENST00000623701 3736 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
LHX8Q68G74 LINC01951-201ENST00000377300 1925 ntTSL 2 BASIC7.99□□□□□ -1.13
LHX8Q68G74 GPR161-201ENST00000271357 7806 ntTSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
LHX8Q68G74 AC090132.1-201ENST00000524071 1480 ntBASIC7.99□□□□□ -1.13
LHX8Q68G74 GOLGA8B-202ENST00000438958 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.99□□□□□ -1.13
LHX8Q68G74 SPATS2L-201ENST00000358677 6156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
LHX8Q68G74 ARHGEF7-208ENST00000426073 4921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.99□□□□□ -1.13
LHX8Q68G74 TRPC5-201ENST00000262839 5839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
LHX8Q68G74 OR1L8-202ENST00000641027 2024 ntAPPRIS P1 BASIC7.98□□□□□ -1.13
LHX8Q68G74 ANKRD30A-205ENST00000611781 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
LHX8Q68G74 SGK1-223ENST00000528577 1850 ntTSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
LHX8Q68G74 MTMR10-201ENST00000435680 4961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
LHX8Q68G74 C1orf158-203ENST00000614859 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
LHX8Q68G74 GPX6-201ENST00000361902 1712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
LHX8Q68G74 EHHADH-201ENST00000231887 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
LHX8Q68G74 NAV2-213ENST00000533917 5084 ntTSL 2 BASIC7.98□□□□□ -1.13
LHX8Q68G74 LINC01910-201ENST00000582251 2637 ntTSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
LHX8Q68G74 DEFB119-201ENST00000339144 484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
LHX8Q68G74 Y_RNA.136-201ENST00000363444 102 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
LHX8Q68G74 RN7SKP189-201ENST00000365042 330 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
LHX8Q68G74 RNA5SP85-201ENST00000365378 119 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
LHX8Q68G74 RNA5SP122-201ENST00000384457 108 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
LHX8Q68G74 SNORA69.1-201ENST00000390904 137 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
LHX8Q68G74 RNU4ATAC2P-201ENST00000408674 126 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
LHX8Q68G74 ERI3-IT1-201ENST00000414156 619 ntTSL 3 BASIC7.98□□□□□ -1.13
LHX8Q68G74 AC051618.1-201ENST00000414295 207 ntTSL 3 BASIC7.98□□□□□ -1.13
LHX8Q68G74 AC000089.1-201ENST00000424559 801 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
LHX8Q68G74 AC007365.2-201ENST00000428806 458 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
LHX8Q68G74 AC127537.2-201ENST00000439258 465 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
LHX8Q68G74 AC007395.1-201ENST00000451333 677 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
LHX8Q68G74 DNAJC19P8-201ENST00000452887 259 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
LHX8Q68G74 CBX1P2-201ENST00000453841 458 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
LHX8Q68G74 ISCUP1-201ENST00000454451 448 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
LHX8Q68G74 EGFLAM-AS3-201ENST00000505267 549 ntTSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
LHX8Q68G74 Y_RNA.687-201ENST00000516558 91 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
LHX8Q68G74 RNU6-885P-201ENST00000516607 104 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
LHX8Q68G74 RNA5SP490-201ENST00000517141 136 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
LHX8Q68G74 AC069120.1-201ENST00000521623 379 ntTSL 3 BASIC7.98□□□□□ -1.13
LHX8Q68G74 IGLVI-42-201ENST00000522485 381 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
LHX8Q68G74 AP005660.1-201ENST00000522972 293 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
LHX8Q68G74 AL929601.2-201ENST00000549951 381 ntTSL 4 BASIC7.98□□□□□ -1.13
LHX8Q68G74 AC084365.1-201ENST00000552470 310 ntTSL 3 BASIC7.98□□□□□ -1.13
LHX8Q68G74 AL512791.1-201ENST00000555853 300 ntTSL 3 BASIC7.98□□□□□ -1.13
LHX8Q68G74 MIR3941-201ENST00000582572 103 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
LHX8Q68G74 AC020909.2-201ENST00000595005 626 ntTSL 2 BASIC7.98□□□□□ -1.13
LHX8Q68G74 AC145423.1-201ENST00000605712 336 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
LHX8Q68G74 CACNB2-213ENST00000612134 3825 ntTSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
LHX8Q68G74 AC011155.2-201ENST00000623202 216 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
LHX8Q68G74 U6.95-201ENST00000636931 70 ntBASIC7.98□□□□□ -1.13
LHX8Q68G74 KLHL32-202ENST00000369261 3698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.98□□□□□ -1.13
LHX8Q68G74 CACNA1D-203ENST00000422281 6414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
LHX8Q68G74 ZNF334-201ENST00000347606 3890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
LHX8Q68G74 ZKSCAN1-201ENST00000324306 9418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
LHX8Q68G74 VPS13A-203ENST00000360280 15320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
LHX8Q68G74 TRIM42-201ENST00000286349 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
LHX8Q68G74 PGK2-201ENST00000304801 1657 ntAPPRIS P1 BASIC7.98□□□□□ -1.13
LHX8Q68G74 NEDD1-201ENST00000266742 4046 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.98□□□□□ -1.13
LHX8Q68G74 DENND2C-202ENST00000393276 5701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.98□□□□□ -1.13
LHX8Q68G74 CFAP65-201ENST00000295729 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.98□□□□□ -1.13
LHX8Q68G74 C6orf89-204ENST00000480824 6861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
LHX8Q68G74 SEMA5A-201ENST00000382496 11762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
LHX8Q68G74 NBPF12-202ENST00000579935 5035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.97□□□□□ -1.13
LHX8Q68G74 NOTCH2-207ENST00000602566 5046 ntTSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
LHX8Q68G74 NSD2-224ENST00000514045 3964 ntTSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
LHX8Q68G74 FBXW10-201ENST00000301938 3221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
LHX8Q68G74 BANF2-201ENST00000246090 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
LHX8Q68G74 BPIFA2-201ENST00000253362 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
LHX8Q68G74 BPIFA2-202ENST00000354932 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.97□□□□□ -1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.7 ms