Protein–RNA interactions for Protein: Q16787

LAMA3, Laminin subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 3,333 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA3Q16787 AC126323.3-201ENST00000565136 564 ntTSL 4 BASIC3.83□□□□□ -1.8
LAMA3Q16787 MIR7851-201ENST00000610611 160 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
LAMA3Q16787 Xist_exon4.1-201ENST00000615964 126 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
LAMA3Q16787 U4.6-201ENST00000621618 127 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
LAMA3Q16787 AL732618.1-201ENST00000623251 301 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
LAMA3Q16787 AL034408.1-201ENST00000637712 664 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
LAMA3Q16787 AP000553.6-201ENST00000641242 118 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
LAMA3Q16787 MTTP-201ENST00000265517 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
LAMA3Q16787 MIR422A-201ENST00000362286 90 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
LAMA3Q16787 BTF3P9-201ENST00000418784 283 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
LAMA3Q16787 AF228730.2-201ENST00000438784 848 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
LAMA3Q16787 AP002884.2-201ENST00000471647 395 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
LAMA3Q16787 AC022335.1-204ENST00000590779 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.83□□□□□ -1.8
LAMA3Q16787 ADARB1-213ENST00000611195 159 ntTSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
LAMA3Q16787 MLF1-208ENST00000478894 1372 ntTSL 2 BASIC3.83□□□□□ -1.8
LAMA3Q16787 ZNF826P-207ENST00000622273 1910 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
LAMA3Q16787 ZNF585B-205ENST00000532828 6210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
LAMA3Q16787 OR2H1-202ENST00000377133 3021 ntAPPRIS P1 BASIC3.82□□□□□ -1.8
LAMA3Q16787 ZC3H12C-202ENST00000453089 9542 ntTSL 2 BASIC3.82□□□□□ -1.8
LAMA3Q16787 OR12D1-207ENST00000514827 1712 ntAPPRIS P1 BASIC3.82□□□□□ -1.8
LAMA3Q16787 AC068580.2-201ENST00000449749 338 ntTSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
LAMA3Q16787 AC131956.2-201ENST00000510922 512 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
LAMA3Q16787 ZFPM2-AS1-207ENST00000524045 987 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
LAMA3Q16787 AL360157.1-201ENST00000565962 87 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
LAMA3Q16787 TLR3-201ENST00000296795 6015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
LAMA3Q16787 UBE4A-202ENST00000431736 6061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
LAMA3Q16787 MBNL3-204ENST00000370853 2661 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
LAMA3Q16787 KCNH7-205ENST00000621889 1893 ntTSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
LAMA3Q16787 CNTRL-205ENST00000373850 5824 ntTSL 2 BASIC3.82□□□□□ -1.8
LAMA3Q16787 LINC01709-201ENST00000415532 634 ntTSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
LAMA3Q16787 DPP10-AS3-201ENST00000417844 665 ntTSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
LAMA3Q16787 OR2AH1P-201ENST00000425717 928 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
LAMA3Q16787 LINC01757-201ENST00000435552 480 ntTSL 2 BASIC3.82□□□□□ -1.8
LAMA3Q16787 NPM1P13-201ENST00000452663 865 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
LAMA3Q16787 RPL5P12-201ENST00000477071 851 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
LAMA3Q16787 AL365356.5-201ENST00000478294 697 ntTSL 2 BASIC3.82□□□□□ -1.8
LAMA3Q16787 LINC01995-201ENST00000489016 621 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
LAMA3Q16787 IGKV2-26-201ENST00000518305 343 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
LAMA3Q16787 AC022469.1-201ENST00000555291 656 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
LAMA3Q16787 LINC01900-203ENST00000585185 393 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
LAMA3Q16787 SMAD5-AS1_2.1-201ENST00000617906 131 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
LAMA3Q16787 FAM26D-205ENST00000628083 1117 ntTSL 2 BASIC3.82□□□□□ -1.8
LAMA3Q16787 IL7R-201ENST00000303115 4626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
LAMA3Q16787 DHX9P1-201ENST00000436565 3076 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
LAMA3Q16787 RLIM-201ENST00000332687 8317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
LAMA3Q16787 LDHAL6CP-202ENST00000550738 3224 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
LAMA3Q16787 BRCA1-203ENST00000357654 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
LAMA3Q16787 CEP170-215ENST00000481987 3031 ntTSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
LAMA3Q16787 AGBL2-201ENST00000357610 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
LAMA3Q16787 TAS2R10-201ENST00000240619 1042 ntAPPRIS P1 BASIC3.82□□□□□ -1.8
LAMA3Q16787 RPS4XP8-201ENST00000402039 771 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
LAMA3Q16787 BX842559.1-201ENST00000419615 532 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
LAMA3Q16787 MIR4319-201ENST00000577285 85 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
LAMA3Q16787 RPL23AP92-201ENST00000603609 255 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
LAMA3Q16787 RNA5SP439-201ENST00000617595 124 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
LAMA3Q16787 AC010149.2-201ENST00000637608 315 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
LAMA3Q16787 ANXA1-202ENST00000376911 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
LAMA3Q16787 MAP3K19-203ENST00000375845 4369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
LAMA3Q16787 AC079062.1-203ENST00000581862 3610 ntTSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
LAMA3Q16787 DNAH17-202ENST00000585328 13708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
LAMA3Q16787 AC018865.1-201ENST00000433507 578 ntTSL 4 BASIC3.81□□□□□ -1.8
LAMA3Q16787 ATP5HP2-201ENST00000433885 485 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
LAMA3Q16787 RNA5SP230-201ENST00000517039 122 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
LAMA3Q16787 AL355075.3-201ENST00000554678 492 ntTSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
LAMA3Q16787 AC015802.5-201ENST00000607478 399 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
LAMA3Q16787 SULF1-204ENST00000458141 5551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
LAMA3Q16787 DENND4A-202ENST00000443035 8665 ntTSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
LAMA3Q16787 ARFGEF2-201ENST00000371917 8852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
LAMA3Q16787 GTF2H1-204ENST00000524753 1510 ntTSL 3 BASIC3.81□□□□□ -1.8
LAMA3Q16787 AL138885.1-201ENST00000405921 675 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
LAMA3Q16787 AC007003.1-201ENST00000472463 736 ntTSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
LAMA3Q16787 AC090403.1-205ENST00000580883 516 ntTSL 2 BASIC3.81□□□□□ -1.8
LAMA3Q16787 AC234782.5-201ENST00000617723 324 ntBASIC3.81□□□□□ -1.8
LAMA3Q16787 AC007620.2-201ENST00000600539 1697 ntTSL 5 BASIC3.81□□□□□ -1.8
LAMA3Q16787 NRDE2-201ENST00000354366 14208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.81□□□□□ -1.8
LAMA3Q16787 OR2AT4-202ENST00000641504 8661 ntAPPRIS P1 BASIC3.8□□□□□ -1.8
LAMA3Q16787 RFC1-201ENST00000349703 4859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
LAMA3Q16787 OR5J1P-201ENST00000313544 939 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
LAMA3Q16787 AC035139.1-201ENST00000423256 273 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
LAMA3Q16787 AC091493.1-201ENST00000426218 411 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
LAMA3Q16787 NPM1P25-201ENST00000429734 854 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
LAMA3Q16787 AL513175.1-201ENST00000431492 780 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
LAMA3Q16787 AL513124.1-201ENST00000450410 614 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
LAMA3Q16787 MIR4524B-201ENST00000581569 115 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
LAMA3Q16787 RNVU1-4-201ENST00000612985 164 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
LAMA3Q16787 TRPM6-202ENST00000360774 8425 ntTSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
LAMA3Q16787 CLUL1-208ENST00000581619 2449 ntTSL 2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
LAMA3Q16787 AL117337.1-201ENST00000412789 444 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
LAMA3Q16787 HMGB1P18-201ENST00000438801 619 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
LAMA3Q16787 AC005008.2-202ENST00000447776 439 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
LAMA3Q16787 AP000916.1-201ENST00000533869 835 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
LAMA3Q16787 AC021517.1-203ENST00000590257 421 ntTSL 3 BASIC3.8□□□□□ -1.8
LAMA3Q16787 OR7C1-204ENST00000642000 11290 ntAPPRIS P1 BASIC3.8□□□□□ -1.8
LAMA3Q16787 C3orf67-AS1-202ENST00000482372 2203 ntTSL 2 BASIC3.8□□□□□ -1.8
LAMA3Q16787 TCN1-201ENST00000257264 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
LAMA3Q16787 RNASE2-201ENST00000304625 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
LAMA3Q16787 RPL21P112-201ENST00000434403 463 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
LAMA3Q16787 AC108734.1-201ENST00000439549 399 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
LAMA3Q16787 RPL7P36-201ENST00000444633 681 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
LAMA3Q16787 AC104058.1-201ENST00000448028 297 ntBASIC3.8□□□□□ -1.8
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