Protein–RNA interactions for Protein: Q15431

SYCP1, Synaptonemal complex protein 1, humanhuman

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Length 976 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP1Q15431 ATP6V0E1P2-201ENST00000441771 245 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
SYCP1Q15431 AL500522.2-201ENST00000448562 343 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
SYCP1Q15431 AL672167.3-201ENST00000465951 960 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
SYCP1Q15431 RN7SL385P-201ENST00000468873 276 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
SYCP1Q15431 AC008958.1-201ENST00000511047 682 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
SYCP1Q15431 SPINK13-203ENST00000512953 1022 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC4.5□□□□□ -1.69
SYCP1Q15431 FTH1P9-201ENST00000513251 355 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
SYCP1Q15431 LINC02365-202ENST00000520280 607 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
SYCP1Q15431 C1GALT1P1-201ENST00000548895 1089 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
SYCP1Q15431 SNHG14-221ENST00000554726 1116 ntTSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
SYCP1Q15431 AL163932.1-201ENST00000555776 542 ntTSL 4 BASIC4.5□□□□□ -1.69
SYCP1Q15431 TVP23BP1-201ENST00000557500 617 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
SYCP1Q15431 C15orf41-203ENST00000562489 715 ntTSL 2 BASIC4.5□□□□□ -1.69
SYCP1Q15431 RPL23AP87-202ENST00000573039 466 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
SYCP1Q15431 AMZ2-204ENST00000577273 895 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
SYCP1Q15431 AC022655.2-201ENST00000577280 318 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
SYCP1Q15431 AL157938.2-204ENST00000589667 826 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
SYCP1Q15431 DTNA-232ENST00000599844 853 ntTSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
SYCP1Q15431 AC234771.5-201ENST00000600161 514 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
SYCP1Q15431 AC005191.1-201ENST00000603950 358 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
SYCP1Q15431 AL360267.1-201ENST00000607309 666 ntTSL 4 BASIC4.5□□□□□ -1.69
SYCP1Q15431 AL023583.1-201ENST00000607518 1143 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
SYCP1Q15431 AC019131.2-201ENST00000609071 870 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
SYCP1Q15431 AC016252.1-201ENST00000609721 474 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
SYCP1Q15431 AC092683.2-203ENST00000618807 788 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
SYCP1Q15431 AL139254.3-201ENST00000641097 674 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
SYCP1Q15431 ADAM29-211ENST00000514159 3010 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.5□□□□□ -1.69
SYCP1Q15431 ZNF266-203ENST00000588933 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
SYCP1Q15431 FAN1-202ENST00000561594 2738 ntTSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
SYCP1Q15431 PIGW-206ENST00000620233 2264 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.49□□□□□ -1.69
SYCP1Q15431 ATXN3-207ENST00000503767 1315 ntTSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
SYCP1Q15431 ZNF705A-201ENST00000359286 3455 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.49□□□□□ -1.69
SYCP1Q15431 RNA5SP447-201ENST00000363749 119 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
SYCP1Q15431 PMS1-202ENST00000374826 948 ntTSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
SYCP1Q15431 ATP5F1P4-201ENST00000397288 746 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
SYCP1Q15431 RPL31P52-201ENST00000407532 367 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
SYCP1Q15431 AC009237.5-201ENST00000414271 501 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
SYCP1Q15431 AF230666.1-201ENST00000429151 786 ntTSL 2 BASIC4.49□□□□□ -1.69
SYCP1Q15431 AP000943.1-201ENST00000438416 712 ntTSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
SYCP1Q15431 AL606490.8-201ENST00000441624 319 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
SYCP1Q15431 RPL5P32-201ENST00000454085 879 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
SYCP1Q15431 AL392086.1-201ENST00000457632 299 ntTSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
SYCP1Q15431 AC005912.1-201ENST00000495392 255 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
SYCP1Q15431 AC092924.1-201ENST00000496084 487 ntTSL 4 BASIC4.49□□□□□ -1.69
SYCP1Q15431 AC021192.1-201ENST00000510169 791 ntTSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
SYCP1Q15431 KRT19P6-201ENST00000510983 209 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
SYCP1Q15431 AC027801.4-201ENST00000518420 395 ntTSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
SYCP1Q15431 OR7E10P-201ENST00000526420 991 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
SYCP1Q15431 OR5M1-201ENST00000526538 948 ntAPPRIS P1 BASIC4.49□□□□□ -1.69
SYCP1Q15431 C11orf65-206ENST00000529391 973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.49□□□□□ -1.69
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SYCP1Q15431 MBNL1-218ENST00000485910 4257 ntTSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
SYCP1Q15431 SYNE1-207ENST00000367255 27748 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
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SYCP1Q15431 LINC01619-203ENST00000549802 2169 ntTSL 2 BASIC4.48□□□□□ -1.69
SYCP1Q15431 PSMA5-201ENST00000271308 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
SYCP1Q15431 CNOT2-231ENST00000551483 4753 ntTSL 2 BASIC4.48□□□□□ -1.69
SYCP1Q15431 LINC02120-201ENST00000505518 2008 ntTSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
SYCP1Q15431 TNPO1P3-201ENST00000436471 2662 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
SYCP1Q15431 OR5T3-202ENST00000313033 969 ntAPPRIS P1 BASIC4.48□□□□□ -1.69
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SYCP1Q15431 DNAJC19P7-201ENST00000428811 344 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
SYCP1Q15431 LINC01645-201ENST00000451341 491 ntTSL 3 BASIC4.48□□□□□ -1.69
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SYCP1Q15431 AC116533.1-201ENST00000459748 321 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
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SYCP1Q15431 AC087888.1-201ENST00000550884 1254 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
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SYCP1Q15431 AL161729.3-201ENST00000603533 673 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
SYCP1Q15431 AL713922.2-201ENST00000619384 716 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
SYCP1Q15431 KIAA1524-208ENST00000625495 147 ntTSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
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