Protein–RNA interactions for Protein: Q13435

SF3B2, Splicing factor 3B subunit 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 895 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B2Q13435 CTAGE5-219ENST00000640607 4239 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
SF3B2Q13435 SCAPER-207ENST00000563290 5028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
SF3B2Q13435 AC068870.3-201ENST00000625077 2536 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
SF3B2Q13435 SEMA6D-210ENST00000558816 4419 ntTSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
SF3B2Q13435 RNU6-492P-201ENST00000363035 104 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
SF3B2Q13435 EFCAB9-201ENST00000398186 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.16□□□□□ -1.26
SF3B2Q13435 AL078599.1-201ENST00000402075 293 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
SF3B2Q13435 AL590290.1-201ENST00000405336 380 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
SF3B2Q13435 RN7SKP56-201ENST00000410513 331 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
SF3B2Q13435 AL354766.2-201ENST00000414085 423 ntTSL 2 BASIC7.16□□□□□ -1.26
SF3B2Q13435 DPPA2P2-201ENST00000418220 897 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
SF3B2Q13435 OR2AM1P-201ENST00000422137 422 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
SF3B2Q13435 AP001136.1-201ENST00000425058 635 ntTSL 2 BASIC7.16□□□□□ -1.26
SF3B2Q13435 SPINK8-201ENST00000434006 444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.16□□□□□ -1.26
SF3B2Q13435 UBE2V1P8-201ENST00000437166 265 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
SF3B2Q13435 ARAFP2-201ENST00000440565 559 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
SF3B2Q13435 PARGP1-202ENST00000440803 790 ntTSL 2 BASIC7.16□□□□□ -1.26
SF3B2Q13435 AL831737.1-201ENST00000441288 271 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
SF3B2Q13435 EEF1E1P1-201ENST00000446998 430 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
SF3B2Q13435 AC013269.3-201ENST00000450486 444 ntTSL 3 BASIC7.16□□□□□ -1.26
SF3B2Q13435 AKR1C2-203ENST00000455190 1098 ntTSL 2 BASIC7.16□□□□□ -1.26
SF3B2Q13435 FAIM-205ENST00000464668 641 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
SF3B2Q13435 HMGN2P25-201ENST00000486956 268 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
SF3B2Q13435 HMGB1P44-201ENST00000508597 572 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
SF3B2Q13435 RNU6-718P-201ENST00000516166 105 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
SF3B2Q13435 RN7SKP244-201ENST00000516513 307 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
SF3B2Q13435 RNU6-506P-201ENST00000516553 94 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
SF3B2Q13435 AC092709.1-201ENST00000521355 1045 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
SF3B2Q13435 AP002812.2-201ENST00000525594 585 ntTSL 4 BASIC7.16□□□□□ -1.26
SF3B2Q13435 AC022367.1-202ENST00000535066 537 ntTSL 3 BASIC7.16□□□□□ -1.26
SF3B2Q13435 AC008033.2-201ENST00000542626 177 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
SF3B2Q13435 EEF1B2P4-201ENST00000551398 348 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
SF3B2Q13435 AC126615.2-201ENST00000553003 515 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
SF3B2Q13435 DNAL1-205ENST00000554339 548 ntTSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
SF3B2Q13435 OR11H2-201ENST00000556246 948 ntAPPRIS P1 BASIC7.16□□□□□ -1.26
SF3B2Q13435 MIR4675-201ENST00000577898 77 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
SF3B2Q13435 NUFIP2-202ENST00000579665 559 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
SF3B2Q13435 ZFP30-209ENST00000589018 444 ntTSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
SF3B2Q13435 MIR92B-201ENST00000607575 96 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
SF3B2Q13435 AC107214.2-201ENST00000608204 634 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
SF3B2Q13435 AC055764.2-201ENST00000610089 670 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
SF3B2Q13435 MIR6780A-201ENST00000615089 68 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
SF3B2Q13435 U4.5-201ENST00000617137 123 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
SF3B2Q13435 MIR7703-201ENST00000620784 77 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
SF3B2Q13435 AC021106.3-201ENST00000623925 531 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
SF3B2Q13435 OR4F17-202ENST00000585993 2669 ntAPPRIS P1 BASIC7.16□□□□□ -1.26
SF3B2Q13435 BLZF1-203ENST00000367808 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
SF3B2Q13435 C2CD6-202ENST00000439140 5512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
SF3B2Q13435 SEL1L3-203ENST00000502949 3500 ntTSL 2 BASIC7.16□□□□□ -1.26
SF3B2Q13435 MMP8-201ENST00000236826 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
SF3B2Q13435 TNKS-206ENST00000518281 3897 ntTSL 2 BASIC7.16□□□□□ -1.26
SF3B2Q13435 PPP1R1C-201ENST00000280295 1636 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
SF3B2Q13435 ADAMTS9-AS1-203ENST00000471990 1606 ntTSL 2 BASIC7.16□□□□□ -1.26
SF3B2Q13435 AL158064.2-205ENST00000640346 4082 ntTSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
SF3B2Q13435 C2orf66-201ENST00000342506 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
SF3B2Q13435 ENPP2-207ENST00000522167 1695 ntTSL 2 BASIC7.16□□□□□ -1.26
SF3B2Q13435 SENP8-202ENST00000542035 1672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.16□□□□□ -1.26
SF3B2Q13435 TRPM6-202ENST00000360774 8425 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
SF3B2Q13435 PPFIBP1-201ENST00000228425 5933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
SF3B2Q13435 MPDZ-219ENST00000546205 6342 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
SF3B2Q13435 TMEM133-201ENST00000303130 1953 ntAPPRIS P1 BASIC7.15□□□□□ -1.26
SF3B2Q13435 MAPK10-236ENST00000638313 3971 ntTSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
SF3B2Q13435 MFSD8-216ENST00000641147 4009 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
SF3B2Q13435 PRKDC-201ENST00000314191 13509 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
SF3B2Q13435 GOLT1B-201ENST00000229314 3227 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
SF3B2Q13435 FAT4-202ENST00000394329 16123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
SF3B2Q13435 LARS-201ENST00000274562 2213 ntTSL 2 BASIC7.15□□□□□ -1.26
SF3B2Q13435 TAS2R3-201ENST00000247879 1101 ntAPPRIS P1 BASIC7.15□□□□□ -1.26
SF3B2Q13435 OR5F1-201ENST00000278409 945 ntAPPRIS P1 BASIC7.15□□□□□ -1.26
SF3B2Q13435 RNU6-582P-201ENST00000362989 107 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
SF3B2Q13435 TMLHE-202ENST00000369439 1248 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
SF3B2Q13435 XAGE1A-202ENST00000375600 474 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
SF3B2Q13435 XAGE1B-202ENST00000375613 474 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
SF3B2Q13435 IGLV5-48-201ENST00000390293 369 ntAPPRIS P1 BASIC7.15□□□□□ -1.26
SF3B2Q13435 AC104297.1-201ENST00000393779 870 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
SF3B2Q13435 MAGI2-AS2-201ENST00000411616 476 ntTSL 2 BASIC7.15□□□□□ -1.26
SF3B2Q13435 AC118345.1-201ENST00000411785 366 ntTSL 3 BASIC7.15□□□□□ -1.26
SF3B2Q13435 GJA6P-201ENST00000415117 1042 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
SF3B2Q13435 RPL21P32-201ENST00000419877 477 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
SF3B2Q13435 IPMKP1-201ENST00000425988 855 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
SF3B2Q13435 AL121902.1-201ENST00000426963 459 ntTSL 2 BASIC7.15□□□□□ -1.26
SF3B2Q13435 ZRANB2-AS2-204ENST00000430605 213 ntTSL 2 BASIC7.15□□□□□ -1.26
SF3B2Q13435 VAV3-AS1-201ENST00000438318 619 ntTSL 2 BASIC7.15□□□□□ -1.26
SF3B2Q13435 AL713851.1-201ENST00000438753 918 ntTSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
SF3B2Q13435 NANOGNBP1-201ENST00000448444 480 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
SF3B2Q13435 RPL38P3-201ENST00000484463 213 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
SF3B2Q13435 LINC00992-202ENST00000514186 564 ntTSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
SF3B2Q13435 DEFB108A-201ENST00000530110 222 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
SF3B2Q13435 AC116535.2-201ENST00000532365 441 ntTSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
SF3B2Q13435 AC026888.1-201ENST00000553348 559 ntTSL 4 BASIC7.15□□□□□ -1.26
SF3B2Q13435 NPM1P47-201ENST00000560843 856 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
SF3B2Q13435 AC009117.1-201ENST00000563948 554 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
SF3B2Q13435 LINC01904-201ENST00000564872 861 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
SF3B2Q13435 AC090751.1-201ENST00000566966 267 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
SF3B2Q13435 MIR4528-201ENST00000577763 90 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
SF3B2Q13435 AC105094.2-203ENST00000590357 555 ntTSL 4 BASIC7.15□□□□□ -1.26
SF3B2Q13435 SMIM24-204ENST00000591708 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.15□□□□□ -1.26
SF3B2Q13435 Z98949.1-211ENST00000596813 773 ntTSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
SF3B2Q13435 AC090948.3-201ENST00000606713 551 ntTSL 4 BASIC7.15□□□□□ -1.26
SF3B2Q13435 ATE1-AS1-202ENST00000636460 506 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 121.5 ms