Protein–RNA interactions for Protein: Q13434

MKRN4P, Putative E3 ubiquitin-protein ligase makorin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN4PQ13434 GTF2H2-201ENST00000274400 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
MKRN4PQ13434 OMG-201ENST00000247271 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
MKRN4PQ13434 ERC1-203ENST00000360905 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
MKRN4PQ13434 CPB2-AS1-202ENST00000606243 2185 ntTSL 2 BASIC8.72□□□□□ -1.01
MKRN4PQ13434 IL31RA-205ENST00000396836 2426 ntTSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
MKRN4PQ13434 KIAA1324L-203ENST00000416314 3179 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC8.72□□□□□ -1.01
MKRN4PQ13434 VPS36-201ENST00000378060 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
MKRN4PQ13434 LINC01619-207ENST00000551843 2205 ntTSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
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MKRN4PQ13434 UTY-205ENST00000382896 6661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
MKRN4PQ13434 UTY-211ENST00000540140 6652 ntTSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
MKRN4PQ13434 UTY-214ENST00000617789 6682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
MKRN4PQ13434 FLG-AS1-202ENST00000392688 2995 ntTSL 2 BASIC8.72□□□□□ -1.01
MKRN4PQ13434 ETV1-210ENST00000430479 6740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
MKRN4PQ13434 KCNMB3-205ENST00000485523 7246 ntTSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
MKRN4PQ13434 SLC5A1-204ENST00000543737 4752 ntTSL 2 BASIC8.72□□□□□ -1.01
MKRN4PQ13434 PSG5-202ENST00000366175 1766 ntTSL 5 BASIC8.72□□□□□ -1.01
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MKRN4PQ13434 SUMO3-202ENST00000397893 520 ntTSL 2 BASIC8.72□□□□□ -1.01
MKRN4PQ13434 AL353151.1-201ENST00000402406 604 ntBASIC8.72□□□□□ -1.01
MKRN4PQ13434 GH2-202ENST00000423893 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
MKRN4PQ13434 AL138479.1-201ENST00000426913 484 ntBASIC8.72□□□□□ -1.01
MKRN4PQ13434 RPL12P17-201ENST00000432393 498 ntBASIC8.72□□□□□ -1.01
MKRN4PQ13434 AJ006995.1-201ENST00000433344 572 ntTSL 3 BASIC8.72□□□□□ -1.01
MKRN4PQ13434 AC009988.1-201ENST00000434988 310 ntTSL 5 BASIC8.72□□□□□ -1.01
MKRN4PQ13434 GH2-204ENST00000456543 794 ntTSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
MKRN4PQ13434 AL445433.1-201ENST00000457507 257 ntBASIC8.72□□□□□ -1.01
MKRN4PQ13434 Y_RNA.638-201ENST00000459374 113 ntBASIC8.72□□□□□ -1.01
MKRN4PQ13434 RN7SL335P-201ENST00000482790 304 ntBASIC8.72□□□□□ -1.01
MKRN4PQ13434 AC025271.1-201ENST00000485045 429 ntBASIC8.72□□□□□ -1.01
MKRN4PQ13434 AC106774.2-201ENST00000510266 406 ntBASIC8.72□□□□□ -1.01
MKRN4PQ13434 AC079209.1-202ENST00000521953 522 ntTSL 3 BASIC8.72□□□□□ -1.01
MKRN4PQ13434 AC103796.1-201ENST00000530663 358 ntTSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
MKRN4PQ13434 UBE2Q2P11-201ENST00000559691 205 ntBASIC8.72□□□□□ -1.01
MKRN4PQ13434 AC090617.5-201ENST00000571815 528 ntTSL 3 BASIC8.72□□□□□ -1.01
MKRN4PQ13434 LINC02362-202ENST00000610683 724 ntTSL 5 BASIC8.72□□□□□ -1.01
MKRN4PQ13434 SPINK6-203ENST00000621437 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.72□□□□□ -1.01
MKRN4PQ13434 AL160287.1-202ENST00000638113 454 ntTSL 5 BASIC8.72□□□□□ -1.01
MKRN4PQ13434 C1orf141-202ENST00000371006 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC8.72□□□□□ -1.01
MKRN4PQ13434 AL445231.1-201ENST00000445523 1814 ntTSL 2 BASIC8.72□□□□□ -1.01
MKRN4PQ13434 TNFRSF19-204ENST00000403372 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.72□□□□□ -1.01
MKRN4PQ13434 AL031119.1-201ENST00000404707 1879 ntBASIC8.72□□□□□ -1.01
MKRN4PQ13434 NCOA4P3-201ENST00000513203 1877 ntBASIC8.72□□□□□ -1.01
MKRN4PQ13434 INO80C-212ENST00000592173 3245 ntTSL 2 BASIC8.72□□□□□ -1.01
MKRN4PQ13434 LINC00208-201ENST00000304233 2150 ntTSL 2 BASIC8.72□□□□□ -1.01
MKRN4PQ13434 BRD8-202ENST00000254900 4388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
MKRN4PQ13434 PRDM2-203ENST00000343137 5797 ntTSL 1 (best) BASIC8.72□□□□□ -1.01
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MKRN4PQ13434 PUM1-204ENST00000373747 5375 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.72□□□□□ -1.01
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MKRN4PQ13434 ELF3-AS1-201ENST00000415582 500 ntTSL 2 BASIC8.71□□□□□ -1.02
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MKRN4PQ13434 DEFB130C-201ENST00000528518 237 ntTSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
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MKRN4PQ13434 AL132655.1-201ENST00000601795 1153 ntTSL 3 BASIC8.71□□□□□ -1.02
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MKRN4PQ13434 ZNF451-204ENST00000370708 9478 ntTSL 2 BASIC8.71□□□□□ -1.02
MKRN4PQ13434 KAT6A-203ENST00000406337 9241 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.71□□□□□ -1.02
MKRN4PQ13434 EPS8-213ENST00000543612 2965 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.71□□□□□ -1.02
MKRN4PQ13434 ZNF680-201ENST00000309683 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
MKRN4PQ13434 AC127502.2-201ENST00000602663 2351 ntBASIC8.71□□□□□ -1.02
MKRN4PQ13434 SPATS2L-227ENST00000619961 6115 ntTSL 2 BASIC8.71□□□□□ -1.02
MKRN4PQ13434 TC2N-202ENST00000360594 3751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
MKRN4PQ13434 ALB-209ENST00000503124 1741 ntTSL 5 BASIC8.71□□□□□ -1.02
MKRN4PQ13434 AC010894.3-201ENST00000442996 2400 ntTSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
MKRN4PQ13434 ZNF724-201ENST00000418100 2764 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.71□□□□□ -1.02
MKRN4PQ13434 MYPN-201ENST00000354393 4596 ntTSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
MKRN4PQ13434 BRD8-201ENST00000230901 3198 ntTSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
MKRN4PQ13434 MSN-201ENST00000360270 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
MKRN4PQ13434 PHF2P2-202ENST00000444553 2865 ntBASIC8.71□□□□□ -1.02
MKRN4PQ13434 MAPK10-319ENST00000641459 2542 ntBASIC8.71□□□□□ -1.02
MKRN4PQ13434 LINC01179-201ENST00000507838 2163 ntTSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.02
MKRN4PQ13434 DLC1-202ENST00000316609 1837 ntTSL 2 BASIC8.7□□□□□ -1.02
MKRN4PQ13434 OR4F5-202ENST00000641515 2618 ntAPPRIS P1 BASIC8.7□□□□□ -1.02
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