Protein–RNA interactions for Protein: Q04844

CHRNE, Acetylcholine receptor subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNEQ04844 TMSB4XP6-201ENST00000415187 135 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
CHRNEQ04844 AC004690.1-201ENST00000418216 328 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
CHRNEQ04844 MTND2P23-201ENST00000422990 651 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
CHRNEQ04844 KIAA0586-203ENST00000423743 5339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
CHRNEQ04844 SERPINA9-204ENST00000424550 1462 ntTSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
CHRNEQ04844 TMSB4XP1-201ENST00000424567 135 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
CHRNEQ04844 FRMPD4-AS1-201ENST00000425057 285 ntTSL 3 BASIC5.61□□□□□ -1.51
CHRNEQ04844 AC127526.2-201ENST00000426436 775 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
CHRNEQ04844 AC010737.1-201ENST00000426699 559 ntTSL 2 BASIC5.61□□□□□ -1.51
CHRNEQ04844 AC003084.1-201ENST00000427030 435 ntTSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
CHRNEQ04844 ZEB2-AS1-203ENST00000428623 436 ntTSL 2 BASIC5.61□□□□□ -1.51
CHRNEQ04844 FGF12-202ENST00000430714 603 ntTSL 2 BASIC5.61□□□□□ -1.51
CHRNEQ04844 AC092809.1-201ENST00000441469 474 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
CHRNEQ04844 AC018816.1-203ENST00000441894 338 ntTSL 3 BASIC5.61□□□□□ -1.51
CHRNEQ04844 Z82190.1-201ENST00000454534 490 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
CHRNEQ04844 C1DP4-201ENST00000455429 424 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
CHRNEQ04844 MEMO1P3-201ENST00000459811 302 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
CHRNEQ04844 AC021660.1-201ENST00000465006 554 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
CHRNEQ04844 NIFKP7-201ENST00000503365 834 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
CHRNEQ04844 AC105343.1-201ENST00000505586 358 ntTSL 3 BASIC5.61□□□□□ -1.51
CHRNEQ04844 GABRA2-205ENST00000507069 1562 ntTSL 3 BASIC5.61□□□□□ -1.51
CHRNEQ04844 AC113346.1-201ENST00000510150 287 ntTSL 3 BASIC5.61□□□□□ -1.51
CHRNEQ04844 AC010493.1-201ENST00000513479 292 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
CHRNEQ04844 AC069272.1-201ENST00000514843 680 ntTSL 3 BASIC5.61□□□□□ -1.51
CHRNEQ04844 RNU6-150P-201ENST00000516237 95 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
CHRNEQ04844 RBPMS-207ENST00000519647 780 ntTSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
CHRNEQ04844 AC068672.1-201ENST00000520391 328 ntTSL 3 BASIC5.61□□□□□ -1.51
CHRNEQ04844 AC090692.1-202ENST00000525363 607 ntTSL 4 BASIC5.61□□□□□ -1.51
CHRNEQ04844 EYA4-211ENST00000525849 3456 ntTSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
CHRNEQ04844 MAL2-203ENST00000534619 578 ntTSL 4 BASIC5.61□□□□□ -1.51
CHRNEQ04844 PIH1D3-203ENST00000535523 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
CHRNEQ04844 AL121594.2-201ENST00000541658 472 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
CHRNEQ04844 LINC02451-202ENST00000548764 579 ntTSL 4 BASIC5.61□□□□□ -1.51
CHRNEQ04844 AC090515.3-201ENST00000560431 315 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
CHRNEQ04844 MIR4307-201ENST00000582802 84 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
CHRNEQ04844 AC009704.1-201ENST00000583702 331 ntTSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
CHRNEQ04844 LINC01909-202ENST00000584919 815 ntTSL 3 BASIC5.61□□□□□ -1.51
CHRNEQ04844 AC005726.5-201ENST00000585189 298 ntTSL 5 BASIC5.61□□□□□ -1.51
CHRNEQ04844 AC119403.2-201ENST00000590960 598 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
CHRNEQ04844 AC022916.3-201ENST00000592961 742 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
CHRNEQ04844 LLPHP1-201ENST00000603571 367 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
CHRNEQ04844 AL391646.1-201ENST00000603860 190 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
CHRNEQ04844 MIR7109-201ENST00000613748 65 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
CHRNEQ04844 Six3os1_2.1-201ENST00000616963 217 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
CHRNEQ04844 AC234782.5-201ENST00000617723 324 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
CHRNEQ04844 ATE1-AS1-202ENST00000636460 506 ntBASIC5.61□□□□□ -1.51
CHRNEQ04844 AC134980.1-203ENST00000640541 570 ntTSL 4 BASIC5.61□□□□□ -1.51
CHRNEQ04844 MKI67-201ENST00000368653 11417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.61□□□□□ -1.51
CHRNEQ04844 CNTNAP4-205ENST00000476707 4355 ntTSL 2 BASIC5.61□□□□□ -1.51
CHRNEQ04844 PLEKHA1-203ENST00000368990 14010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
CHRNEQ04844 MSR1-204ENST00000381998 2826 ntTSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
CHRNEQ04844 RIC3-202ENST00000335425 5223 ntTSL 1 (best) BASIC5.61□□□□□ -1.51
CHRNEQ04844 CSNK1G3-210ENST00000521364 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.61□□□□□ -1.51
CHRNEQ04844 MAP3K19-204ENST00000392915 5030 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
CHRNEQ04844 CA1-225ENST00000626824 2405 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
CHRNEQ04844 NUDCD1-202ENST00000427660 2098 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
CHRNEQ04844 LINC00616-205ENST00000514600 2017 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
CHRNEQ04844 ZNF33A-203ENST00000432900 3994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
CHRNEQ04844 PPFIBP1-201ENST00000228425 5933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
CHRNEQ04844 LINC02153-202ENST00000522604 1644 ntTSL 2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
CHRNEQ04844 CASP1-208ENST00000527979 1521 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
CHRNEQ04844 PCLO-201ENST00000333891 20329 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
CHRNEQ04844 TRAPPC13-204ENST00000438419 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
CHRNEQ04844 HNMT-201ENST00000280096 504 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
CHRNEQ04844 RNA5SP110-201ENST00000362638 115 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
CHRNEQ04844 RNU6-216P-201ENST00000363282 104 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
CHRNEQ04844 SNORD1C-201ENST00000363315 78 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
CHRNEQ04844 CRP-204ENST00000368112 787 ntTSL 2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
CHRNEQ04844 MIR188-201ENST00000385034 86 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
CHRNEQ04844 SNRPEP2-201ENST00000397592 279 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
CHRNEQ04844 MIR1275-201ENST00000408770 80 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
CHRNEQ04844 RNA5SP198-201ENST00000410376 127 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
CHRNEQ04844 Y_RNA.608-201ENST00000410647 95 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
CHRNEQ04844 RN7SKP108-201ENST00000411367 328 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
CHRNEQ04844 ZNRF3-IT1-201ENST00000412798 674 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
CHRNEQ04844 RPL35AP31-201ENST00000418340 337 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
CHRNEQ04844 AC092634.6-201ENST00000418558 192 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
CHRNEQ04844 LINC01362-201ENST00000419658 338 ntTSL 5 BASIC5.6□□□□□ -1.51
CHRNEQ04844 RAD23BP1-201ENST00000421404 1227 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
CHRNEQ04844 NIPA2P1-201ENST00000426223 976 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
CHRNEQ04844 RPS27AP6-201ENST00000427962 448 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
CHRNEQ04844 DYNLL1P7-201ENST00000429273 258 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
CHRNEQ04844 RPL7P4-203ENST00000430239 730 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
CHRNEQ04844 CACYBPP1-201ENST00000438592 684 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
CHRNEQ04844 LSM1P1-201ENST00000438629 273 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
CHRNEQ04844 AC009950.1-206ENST00000445199 517 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
CHRNEQ04844 AC004888.1-201ENST00000450480 547 ntTSL 2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
CHRNEQ04844 AL935212.3-201ENST00000450729 284 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
CHRNEQ04844 SNRPGP6-201ENST00000451124 220 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
CHRNEQ04844 ACA64.4-201ENST00000459070 127 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
CHRNEQ04844 AC017015.1-201ENST00000477387 286 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
CHRNEQ04844 PLGLA-202ENST00000482249 475 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
CHRNEQ04844 MTND1P3-201ENST00000484956 952 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
CHRNEQ04844 AC007182.2-201ENST00000489251 402 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
CHRNEQ04844 RPL39P36-201ENST00000490784 156 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
CHRNEQ04844 AF250324.1-203ENST00000508156 517 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
CHRNEQ04844 RNU2-46P-201ENST00000517038 113 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
CHRNEQ04844 AP003469.3-201ENST00000518090 473 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
CHRNEQ04844 AC024405.1-201ENST00000532521 1042 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
CHRNEQ04844 LINC00944-202ENST00000540684 888 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.8 ms