Protein–RNA interactions for Protein: P23469

PTPRE, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPREP23469 SFTPD-AS1-201ENST00000608229 5001 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
PTPREP23469 CA10-204ENST00000570565 2276 ntTSL 5 BASIC7.82□□□□□ -1.16
PTPREP23469 ABL2-201ENST00000344730 6910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
PTPREP23469 ITPR1-205ENST00000456211 9717 ntTSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
PTPREP23469 MAPK10-357ENST00000641831 2858 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
PTPREP23469 LINC02153-202ENST00000522604 1644 ntTSL 2 BASIC7.82□□□□□ -1.16
PTPREP23469 LINC01222-201ENST00000427439 1785 ntTSL 2 BASIC7.82□□□□□ -1.16
PTPREP23469 AL731566.1-201ENST00000620490 1937 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
PTPREP23469 ZFP62-201ENST00000502412 3415 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.82□□□□□ -1.16
PTPREP23469 FAM183A-201ENST00000335282 488 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.82□□□□□ -1.16
PTPREP23469 RNU6-666P-201ENST00000363499 107 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
PTPREP23469 RN7SKP269-201ENST00000365545 319 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
PTPREP23469 Y_RNA.493-201ENST00000384422 102 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
PTPREP23469 TRAV1-2-201ENST00000390423 402 ntAPPRIS P1 BASIC7.82□□□□□ -1.16
PTPREP23469 RNU6-952P-201ENST00000391164 108 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
PTPREP23469 MIR541-201ENST00000401360 84 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
PTPREP23469 TANK-203ENST00000402568 878 ntTSL 5 BASIC7.82□□□□□ -1.16
PTPREP23469 AP000473.1-201ENST00000413645 550 ntTSL 3 BASIC7.82□□□□□ -1.16
PTPREP23469 ARL5AP1-201ENST00000418991 388 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
PTPREP23469 EIF4EP1-201ENST00000422311 642 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
PTPREP23469 AC083862.1-201ENST00000427378 1242 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
PTPREP23469 AC093579.1-201ENST00000439455 352 ntTSL 2 BASIC7.82□□□□□ -1.16
PTPREP23469 COL11A2P1-205ENST00000441798 676 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
PTPREP23469 AC011742.2-201ENST00000443818 352 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
PTPREP23469 MORF4-201ENST00000447135 971 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
PTPREP23469 AL935212.3-201ENST00000450729 284 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
PTPREP23469 AC016724.1-201ENST00000453215 421 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
PTPREP23469 KPNA2P1-201ENST00000458289 1591 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
PTPREP23469 SNORD127-201ENST00000458892 86 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
PTPREP23469 NDUFB2-213ENST00000476470 482 ntTSL 5 BASIC7.82□□□□□ -1.16
PTPREP23469 RN7SL413P-201ENST00000482700 297 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
PTPREP23469 PLCH1-206ENST00000494598 3525 ntTSL 5 BASIC7.82□□□□□ -1.16
PTPREP23469 AC108752.1-203ENST00000496674 339 ntTSL 5 BASIC7.82□□□□□ -1.16
PTPREP23469 AC025465.3-201ENST00000510570 311 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
PTPREP23469 AC012400.1-201ENST00000518452 381 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
PTPREP23469 AP001831.1-201ENST00000524610 411 ntTSL 3 BASIC7.82□□□□□ -1.16
PTPREP23469 OR4P1P-201ENST00000530808 1136 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
PTPREP23469 AC130360.2-201ENST00000533477 1556 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
PTPREP23469 AC140063.1-201ENST00000541343 259 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
PTPREP23469 AC123567.2-202ENST00000550759 446 ntTSL 3 BASIC7.82□□□□□ -1.16
PTPREP23469 LINC02386-201ENST00000551202 509 ntTSL 3 BASIC7.82□□□□□ -1.16
PTPREP23469 AL118558.2-201ENST00000556294 238 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
PTPREP23469 AC103739.1-201ENST00000558389 474 ntTSL 3 BASIC7.82□□□□□ -1.16
PTPREP23469 AC005670.2-201ENST00000571841 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.82□□□□□ -1.16
PTPREP23469 MIR548AI-201ENST00000579940 88 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
PTPREP23469 AC005546.1-201ENST00000591837 391 ntTSL 3 BASIC7.82□□□□□ -1.16
PTPREP23469 AC010325.2-201ENST00000594114 260 ntTSL 3 BASIC7.82□□□□□ -1.16
PTPREP23469 AL136097.3-201ENST00000611097 505 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
PTPREP23469 Metazoa_SRP.35-201ENST00000611402 288 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
PTPREP23469 MIR6128-201ENST00000615528 109 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
PTPREP23469 AC023509.5-201ENST00000617434 807 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
PTPREP23469 AC073592.6-201ENST00000624271 415 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
PTPREP23469 SH3D19-210ENST00000514152 5107 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.82□□□□□ -1.16
PTPREP23469 MEF2C-244ENST00000636998 5936 ntTSL 5 BASIC7.82□□□□□ -1.16
PTPREP23469 ZHX3-205ENST00000432768 3551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.82□□□□□ -1.16
PTPREP23469 AC062029.1-202ENST00000606164 3651 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
PTPREP23469 KIAA0586-201ENST00000261244 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
PTPREP23469 NLRP4-203ENST00000587891 3201 ntTSL 2 BASIC7.82□□□□□ -1.16
PTPREP23469 ITPR1-202ENST00000354582 10242 ntTSL 5 BASIC7.82□□□□□ -1.16
PTPREP23469 TRIP11-201ENST00000267622 9996 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
PTPREP23469 ITGA1-201ENST00000282588 10757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
PTPREP23469 BRWD1-203ENST00000342449 12929 ntTSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
PTPREP23469 PGM3-211ENST00000512866 2013 ntTSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
PTPREP23469 CTDSPL2-204ENST00000558966 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
PTPREP23469 SGK3-201ENST00000345714 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
PTPREP23469 ESRRG-201ENST00000359162 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
PTPREP23469 UBA2-202ENST00000439527 2802 ntTSL 2 BASIC7.81□□□□□ -1.16
PTPREP23469 GCNA-201ENST00000373695 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
PTPREP23469 BMPR1APS1-201ENST00000403332 1598 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
PTPREP23469 AC019270.1-201ENST00000523495 3488 ntTSL 5 BASIC7.81□□□□□ -1.16
PTPREP23469 KIAA1210-201ENST00000402510 7824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.81□□□□□ -1.16
PTPREP23469 ZNF326-203ENST00000370447 9433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
PTPREP23469 AL023755.1-201ENST00000441851 1801 ntTSL 2 BASIC7.81□□□□□ -1.16
PTPREP23469 ABI1-207ENST00000376142 3576 ntTSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
PTPREP23469 RN7SKP15-201ENST00000364742 309 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
PTPREP23469 RHOT1P2-201ENST00000366423 333 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
PTPREP23469 Y_RNA.461-201ENST00000384263 103 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
PTPREP23469 RNA5SP474-201ENST00000391234 90 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
PTPREP23469 AL391419.1-201ENST00000398901 1275 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
PTPREP23469 AFDN-AS1-202ENST00000417244 182 ntTSL 2 BASIC7.81□□□□□ -1.16
PTPREP23469 RPS15AP12-201ENST00000419498 388 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
PTPREP23469 AC079790.1-201ENST00000420365 507 ntTSL 3 BASIC7.81□□□□□ -1.16
PTPREP23469 AC016766.1-201ENST00000429636 714 ntTSL 3 BASIC7.81□□□□□ -1.16
PTPREP23469 AC079807.1-201ENST00000429993 481 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
PTPREP23469 CEP57L1P1-201ENST00000430943 1201 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
PTPREP23469 RPS17P8-201ENST00000434525 335 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
PTPREP23469 FABP5P2-201ENST00000439042 408 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
PTPREP23469 AL591178.1-201ENST00000439239 454 ntTSL 5 BASIC7.81□□□□□ -1.16
PTPREP23469 SNRPBP1-201ENST00000443634 282 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
PTPREP23469 OSTCP8-201ENST00000445117 448 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
PTPREP23469 AP1S2P1-201ENST00000457344 379 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
PTPREP23469 AC016746.1-201ENST00000489557 831 ntTSL 2 BASIC7.81□□□□□ -1.16
PTPREP23469 ALDH7A1P3-201ENST00000492517 345 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
PTPREP23469 BFSP2-AS1-201ENST00000515542 894 ntTSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
PTPREP23469 SNORD27.1-201ENST00000516319 72 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
PTPREP23469 RNU6-1038P-201ENST00000516516 104 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
PTPREP23469 AF233439.1-201ENST00000526235 401 ntTSL 3 BASIC7.81□□□□□ -1.16
PTPREP23469 AC090458.1-202ENST00000530387 462 ntTSL 5 BASIC7.81□□□□□ -1.16
PTPREP23469 TOMM20P1-201ENST00000534518 427 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
PTPREP23469 SDHAF2-208ENST00000543265 438 ntTSL 5 BASIC7.81□□□□□ -1.16
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