Protein–RNA interactions for Protein: P23468

PTPRD, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, humanhuman

Predictions only

Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRDP23468 HSPE1P5-201ENST00000561489 272 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
PTPRDP23468 KLKP1-201ENST00000595979 403 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
PTPRDP23468 SNORA62.6-201ENST00000606322 83 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
PTPRDP23468 U3.45-201ENST00000607547 219 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
PTPRDP23468 AC243312.2-201ENST00000623340 601 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
PTPRDP23468 C2orf78-201ENST00000409561 3045 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.91□□□□□ -1.78
PTPRDP23468 BBX-203ENST00000402543 3980 ntTSL 5 BASIC3.91□□□□□ -1.78
PTPRDP23468 EMSY-215ENST00000533248 3798 ntTSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
PTPRDP23468 ARF4-206ENST00000489843 1360 ntTSL 3 BASIC3.91□□□□□ -1.78
PTPRDP23468 LBR-202ENST00000338179 3812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.91□□□□□ -1.78
PTPRDP23468 AC093535.2-201ENST00000624769 2326 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
PTPRDP23468 UGT2B17-201ENST00000317746 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
PTPRDP23468 ZNF780B-202ENST00000434248 8665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.91□□□□□ -1.78
PTPRDP23468 ZNF780B-207ENST00000617676 8664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.91□□□□□ -1.78
PTPRDP23468 ORC4-216ENST00000540442 6472 ntTSL 2 BASIC3.91□□□□□ -1.78
PTPRDP23468 VPS13C-202ENST00000261517 13400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
PTPRDP23468 IL1R1-204ENST00000409929 1858 ntTSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
PTPRDP23468 OXR1-201ENST00000297447 1944 ntTSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
PTPRDP23468 FAM169A-201ENST00000389156 5990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
PTPRDP23468 ZNF602P-201ENST00000405929 924 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
PTPRDP23468 ATP5A1P2-201ENST00000412323 255 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
PTPRDP23468 IFNAR2-206ENST00000413881 710 ntTSL 5 BASIC3.91□□□□□ -1.78
PTPRDP23468 CRYBB2P1-203ENST00000415709 538 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
PTPRDP23468 HMGB3P20-201ENST00000417997 600 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
PTPRDP23468 AL365356.5-201ENST00000478294 697 ntTSL 2 BASIC3.91□□□□□ -1.78
PTPRDP23468 AC103987.2-201ENST00000583436 417 ntTSL 2 BASIC3.91□□□□□ -1.78
PTPRDP23468 MRPS35P3-201ENST00000603189 709 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
PTPRDP23468 AC015813.4-201ENST00000610469 179 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
PTPRDP23468 AC091953.5-201ENST00000622919 233 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
PTPRDP23468 AC091905.1-201ENST00000624400 311 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
PTPRDP23468 OR5AC4P-202ENST00000642086 985 ntBASIC3.91□□□□□ -1.78
PTPRDP23468 ZNF382-203ENST00000435416 3865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
PTPRDP23468 MAP3K21-201ENST00000366622 4005 ntTSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
PTPRDP23468 WDR49-207ENST00000479765 2108 ntTSL 2 BASIC3.91□□□□□ -1.78
PTPRDP23468 MS4A14-201ENST00000300187 2997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.91□□□□□ -1.78
PTPRDP23468 DTNA-202ENST00000283365 6522 ntTSL 5 BASIC3.9□□□□□ -1.78
PTPRDP23468 WDR72-202ENST00000396328 7507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.78
PTPRDP23468 SLC4A10-203ENST00000415876 5578 ntTSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.78
PTPRDP23468 TPTE2-201ENST00000255310 1562 ntTSL 5 BASIC3.9□□□□□ -1.78
PTPRDP23468 LINC01902-203ENST00000637369 7356 ntTSL 5 BASIC3.9□□□□□ -1.78
PTPRDP23468 SNORD9-201ENST00000362566 104 ntBASIC3.9□□□□□ -1.78
PTPRDP23468 AC245054.1-201ENST00000420944 258 ntBASIC3.9□□□□□ -1.78
PTPRDP23468 AL591419.1-201ENST00000427423 339 ntBASIC3.9□□□□□ -1.78
PTPRDP23468 LMO7DN-IT1-201ENST00000436872 321 ntTSL 3 BASIC3.9□□□□□ -1.78
PTPRDP23468 AC115115.1-201ENST00000449927 248 ntBASIC3.9□□□□□ -1.78
PTPRDP23468 PPIAP3-201ENST00000450588 505 ntBASIC3.9□□□□□ -1.78
PTPRDP23468 AC123023.1-201ENST00000455974 555 ntTSL 4 BASIC3.9□□□□□ -1.78
PTPRDP23468 LINC01192-207ENST00000492553 836 ntTSL 5 BASIC3.9□□□□□ -1.78
PTPRDP23468 SUB1-203ENST00000502897 562 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC3.9□□□□□ -1.78
PTPRDP23468 CDH12P2-201ENST00000504393 298 ntBASIC3.9□□□□□ -1.78
PTPRDP23468 AC104619.4-201ENST00000510773 249 ntBASIC3.9□□□□□ -1.78
PTPRDP23468 AC108866.1-202ENST00000511064 573 ntTSL 4 BASIC3.9□□□□□ -1.78
PTPRDP23468 MYL12AP1-201ENST00000518490 515 ntBASIC3.9□□□□□ -1.78
PTPRDP23468 AC104564.2-201ENST00000581240 270 ntTSL 3 BASIC3.9□□□□□ -1.78
PTPRDP23468 PLD1-203ENST00000356327 5855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.79
PTPRDP23468 POU1F1-202ENST00000350375 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.79
PTPRDP23468 RALGAPA1-204ENST00000553892 6271 ntTSL 5 BASIC3.9□□□□□ -1.79
PTPRDP23468 POSTN-203ENST00000379747 3373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.9□□□□□ -1.79
PTPRDP23468 RPS24P12-201ENST00000402084 394 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
PTPRDP23468 AC010740.1-201ENST00000417035 684 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
PTPRDP23468 AC092647.1-201ENST00000420654 287 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
PTPRDP23468 USP12PY-201ENST00000427677 1064 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
PTPRDP23468 AC092447.2-201ENST00000435487 669 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
PTPRDP23468 LINC01017-201ENST00000508823 768 ntTSL 3 BASIC3.89□□□□□ -1.79
PTPRDP23468 AC010468.2-201ENST00000511981 438 ntTSL 2 BASIC3.89□□□□□ -1.79
PTPRDP23468 AC068875.1-201ENST00000561054 463 ntTSL 3 BASIC3.89□□□□□ -1.79
PTPRDP23468 AC243654.2-201ENST00000612843 443 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
PTPRDP23468 MIR7975-201ENST00000619350 68 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
PTPRDP23468 LINC01002-206ENST00000631772 539 ntTSL 4 BASIC3.89□□□□□ -1.79
PTPRDP23468 AP000553.6-201ENST00000641242 118 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
PTPRDP23468 DST-220ENST00000518935 3547 ntTSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
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PTPRDP23468 ZC3H12B-201ENST00000338957 7256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
PTPRDP23468 ZNF285-205ENST00000614994 6012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
PTPRDP23468 SNORD3H-201ENST00000384486 214 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
PTPRDP23468 NANOGP6-201ENST00000429190 847 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
PTPRDP23468 AL161640.1-201ENST00000429507 390 ntTSL 2 BASIC3.89□□□□□ -1.79
PTPRDP23468 IGKV1OR9-2-201ENST00000431378 277 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
PTPRDP23468 LINC00595-203ENST00000432742 683 ntTSL 3 BASIC3.89□□□□□ -1.79
PTPRDP23468 AC092809.1-201ENST00000441469 474 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
PTPRDP23468 CREM-228ENST00000473940 1182 ntTSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
PTPRDP23468 AC005726.1-201ENST00000494679 427 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
PTPRDP23468 LINC02325-201ENST00000499910 1115 ntTSL 1 (best) BASIC3.89□□□□□ -1.79
PTPRDP23468 AP001978.1-201ENST00000526851 834 ntTSL 2 BASIC3.89□□□□□ -1.79
PTPRDP23468 AC012229.1-201ENST00000558699 499 ntTSL 4 BASIC3.89□□□□□ -1.79
PTPRDP23468 IGKV2OR2-8-201ENST00000558710 300 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
PTPRDP23468 AC026368.1-201ENST00000614934 690 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
PTPRDP23468 PCBP1-AS1-348ENST00000629506 667 ntTSL 5 BASIC3.89□□□□□ -1.79
PTPRDP23468 PRLR-220ENST00000620785 11063 ntTSL 5 BASIC3.89□□□□□ -1.79
PTPRDP23468 SMARCA2-201ENST00000302401 2242 ntTSL 2 BASIC3.89□□□□□ -1.79
PTPRDP23468 MFSD8-236ENST00000641509 4050 ntBASIC3.89□□□□□ -1.79
PTPRDP23468 CNTN5-212ENST00000619298 5734 ntTSL 5 BASIC3.89□□□□□ -1.79
PTPRDP23468 BCAP29-203ENST00000379119 5773 ntTSL 3 BASIC3.88□□□□□ -1.79
PTPRDP23468 MTCO1P7-201ENST00000419523 1542 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
PTPRDP23468 TCEAL7-201ENST00000332431 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
PTPRDP23468 RNU6-525P-201ENST00000363685 104 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
PTPRDP23468 AL354766.2-201ENST00000414085 423 ntTSL 2 BASIC3.88□□□□□ -1.79
PTPRDP23468 DBIP2-201ENST00000419076 262 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
PTPRDP23468 AC114814.2-201ENST00000419195 485 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
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