Protein–RNA interactions for Protein: P23467

PTPRB, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, humanhuman

Predictions only

Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRBP23467 PLCL2-202ENST00000432376 3940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
PTPRBP23467 PPP1R9A-206ENST00000433360 5369 ntTSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
PTPRBP23467 FGF12-204ENST00000445105 5406 ntTSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
PTPRBP23467 RIMS1-212ENST00000517827 3065 ntTSL 2 BASIC3.66□□□□□ -1.82
PTPRBP23467 STON1-GTF2A1L-204ENST00000405008 3821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
PTPRBP23467 GTDC1-203ENST00000392867 2408 ntTSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
PTPRBP23467 AC008079.2-201ENST00000623543 20396 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
PTPRBP23467 VIRMA-201ENST00000297591 6528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.82
PTPRBP23467 FAM107B-229ENST00000622567 3510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.65□□□□□ -1.82
PTPRBP23467 OR5W2-201ENST00000344514 933 ntAPPRIS P1 BASIC3.65□□□□□ -1.82
PTPRBP23467 OR51A2-201ENST00000380371 942 ntAPPRIS P1 BASIC3.65□□□□□ -1.82
PTPRBP23467 RBMY1KP-201ENST00000423480 476 ntBASIC3.65□□□□□ -1.82
PTPRBP23467 AC002553.2-201ENST00000453217 340 ntBASIC3.65□□□□□ -1.82
PTPRBP23467 AC092919.1-201ENST00000467896 229 ntTSL 2 BASIC3.65□□□□□ -1.82
PTPRBP23467 SSBP1-211ENST00000484178 676 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.82
PTPRBP23467 SNHG14-221ENST00000554726 1116 ntTSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.82
PTPRBP23467 LINC01584-202ENST00000563990 852 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.82
PTPRBP23467 CCNYL2-203ENST00000638057 730 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.82
PTPRBP23467 BAZ2B-204ENST00000392783 8289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.82
PTPRBP23467 MBNL3-204ENST00000370853 2661 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.82
PTPRBP23467 SAMSN1-201ENST00000285670 2185 ntTSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.82
PTPRBP23467 ZNF280C-201ENST00000370978 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
PTPRBP23467 TRAJ18-201ENST00000390519 66 ntAPPRIS P1 BASIC3.65□□□□□ -1.83
PTPRBP23467 AC073335.1-201ENST00000427776 363 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
PTPRBP23467 AL353681.1-201ENST00000435828 731 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
PTPRBP23467 CD200R1-203ENST00000440122 847 ntTSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
PTPRBP23467 AL133162.1-201ENST00000463228 453 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
PTPRBP23467 AL136126.1-201ENST00000473603 402 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
PTPRBP23467 AC012158.1-204ENST00000483430 465 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
PTPRBP23467 RFPL4AP5-201ENST00000514977 504 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
PTPRBP23467 SPAG11B-207ENST00000528168 481 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
PTPRBP23467 CSNK1A1P1-202ENST00000563423 981 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
PTPRBP23467 AC105020.2-201ENST00000564683 572 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
PTPRBP23467 AC022968.1-201ENST00000567372 442 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
PTPRBP23467 AC135178.3-202ENST00000580537 579 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
PTPRBP23467 AC105094.1-201ENST00000588245 316 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
PTPRBP23467 AC005162.3-202ENST00000609495 483 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
PTPRBP23467 AC138627.1-204ENST00000641894 765 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
PTPRBP23467 PLCZ1-206ENST00000538330 1612 ntTSL 2 BASIC3.65□□□□□ -1.83
PTPRBP23467 AC068254.2-201ENST00000623938 3577 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
PTPRBP23467 CNTN5-207ENST00000527185 4303 ntTSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
PTPRBP23467 HMCN1-201ENST00000271588 18208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
PTPRBP23467 OR5AU1-203ENST00000641697 7755 ntAPPRIS P1 BASIC3.64□□□□□ -1.83
PTPRBP23467 LCOR-205ENST00000421806 16004 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
PTPRBP23467 MYO9A-209ENST00000564571 8111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
PTPRBP23467 AC000123.3-201ENST00000624029 4975 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
PTPRBP23467 ADAM7-202ENST00000380789 3358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
PTPRBP23467 ATP5A1P2-201ENST00000412323 255 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
PTPRBP23467 AL035423.1-201ENST00000420331 213 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
PTPRBP23467 THAP12P8-201ENST00000447914 2115 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
PTPRBP23467 AC008481.1-201ENST00000463278 396 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
PTPRBP23467 AC090673.1-204ENST00000504038 977 ntTSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
PTPRBP23467 AC099550.1-201ENST00000515495 871 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
PTPRBP23467 RNU7-143P-201ENST00000516781 65 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
PTPRBP23467 AC048387.1-201ENST00000518428 494 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
PTPRBP23467 IGLV3-26-201ENST00000520756 302 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
PTPRBP23467 TIMM9-206ENST00000555593 796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
PTPRBP23467 PSMA3-213ENST00000557508 814 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
PTPRBP23467 AC011270.1-201ENST00000558606 583 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
PTPRBP23467 AC120045.1-201ENST00000563502 251 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
PTPRBP23467 AC139426.2-201ENST00000568289 251 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
PTPRBP23467 AC008759.1-201ENST00000589783 983 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
PTPRBP23467 AC009303.3-201ENST00000591103 736 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
PTPRBP23467 AC079684.1-201ENST00000621405 437 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
PTPRBP23467 RABL3-201ENST00000273375 3883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
PTPRBP23467 MARK2P15-201ENST00000432204 2186 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
PTPRBP23467 KANSL1L-209ENST00000457374 2264 ntTSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
PTPRBP23467 PCDH15-206ENST00000373965 9237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
PTPRBP23467 AC092821.1-201ENST00000640129 4180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
PTPRBP23467 CNTN5-209ENST00000528682 3800 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
PTPRBP23467 MGA-211ENST00000570161 11859 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
PTPRBP23467 RSF1-204ENST00000480887 5318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
PTPRBP23467 CFL2-201ENST00000298159 6747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
PTPRBP23467 RN7SKP247-201ENST00000411094 308 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
PTPRBP23467 DPY19L1P2-201ENST00000426647 915 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
PTPRBP23467 Z74696.2-201ENST00000436514 498 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
PTPRBP23467 PRR16-203ENST00000446965 1152 ntTSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
PTPRBP23467 LINC00448-202ENST00000448411 433 ntTSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
PTPRBP23467 AC097462.2-201ENST00000504623 481 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
PTPRBP23467 LINC00944-201ENST00000536517 421 ntTSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
PTPRBP23467 AC140847.1-201ENST00000538025 534 ntTSL 4 BASIC3.63□□□□□ -1.83
PTPRBP23467 AC008011.1-201ENST00000545989 227 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
PTPRBP23467 AC008638.3-201ENST00000603341 463 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
PTPRBP23467 AC107419.1-202ENST00000608735 1081 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
PTPRBP23467 AC064801.1-201ENST00000612025 407 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
PTPRBP23467 LINC00901.1-201ENST00000617252 152 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
PTPRBP23467 AC138907.10-201ENST00000623708 983 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
PTPRBP23467 RXFP1-204ENST00000423548 3930 ntTSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
PTPRBP23467 MTND4P26-201ENST00000415971 1359 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
PTPRBP23467 SCN3A-202ENST00000360093 9123 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
PTPRBP23467 LINC01748-204ENST00000635048 5678 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
PTPRBP23467 OR51C1P-202ENST00000641159 1444 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
PTPRBP23467 AMY2B-201ENST00000361355 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
PTPRBP23467 DNAH5-201ENST00000265104 15633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
PTPRBP23467 DMD-230ENST00000620040 13746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
PTPRBP23467 MAP2-202ENST00000360351 9711 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
PTPRBP23467 TBC1D31-210ENST00000521676 3256 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
PTPRBP23467 NAMPTP1-201ENST00000440465 2514 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
PTPRBP23467 ZNF33A-201ENST00000307441 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC3.63□□□□□ -1.83
PTPRBP23467 TMEM251-201ENST00000283534 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
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