Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKS6

PACSIN3, Protein kinase C and casein kinase substrate in neurons protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3Q9UKS6 AC007389.5-201ENST00000629214 744 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
PACSIN3Q9UKS6 NANOGNB-202ENST00000640040 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
PACSIN3Q9UKS6 R3HDM1-204ENST00000410054 4442 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
PACSIN3Q9UKS6 SMARCA2-206ENST00000382185 1584 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
PACSIN3Q9UKS6 WDHD1-201ENST00000360586 5996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
PACSIN3Q9UKS6 AC125336.1-201ENST00000508893 2827 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
PACSIN3Q9UKS6 AMD1-204ENST00000368885 3438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
PACSIN3Q9UKS6 APAF1-209ENST00000550527 6581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
PACSIN3Q9UKS6 EIF3M-208ENST00000531120 5051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
PACSIN3Q9UKS6 ACTR3BP5-201ENST00000448440 1479 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
PACSIN3Q9UKS6 LINC00901-201ENST00000487512 1452 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
PACSIN3Q9UKS6 POLK-210ENST00000508526 2019 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
PACSIN3Q9UKS6 LRP6-201ENST00000261349 10020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
PACSIN3Q9UKS6 UGT2A1-203ENST00000503640 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
PACSIN3Q9UKS6 CSNK1G3-205ENST00000510842 1979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
PACSIN3Q9UKS6 ADGRG4-202ENST00000394141 8971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
PACSIN3Q9UKS6 PSG1-202ENST00000312439 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
PACSIN3Q9UKS6 RGS4-202ENST00000367908 2606 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
PACSIN3Q9UKS6 CNBD1-202ENST00000518476 1594 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
PACSIN3Q9UKS6 RNF20-202ENST00000389120 3940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
PACSIN3Q9UKS6 LDHC-201ENST00000280704 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
PACSIN3Q9UKS6 OR6C75-201ENST00000343399 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
PACSIN3Q9UKS6 RNU6-500P-201ENST00000362349 107 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PACSIN3Q9UKS6 RNU6-931P-201ENST00000363850 107 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PACSIN3Q9UKS6 CD84-205ENST00000368051 965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
PACSIN3Q9UKS6 FAM24A-201ENST00000368894 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
PACSIN3Q9UKS6 AL049649.1-202ENST00000412405 414 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
PACSIN3Q9UKS6 HMGB3P31-201ENST00000413333 595 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PACSIN3Q9UKS6 AC100848.1-201ENST00000417298 637 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
PACSIN3Q9UKS6 AC002064.2-201ENST00000420245 289 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
PACSIN3Q9UKS6 LINC02518-201ENST00000421737 524 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
PACSIN3Q9UKS6 MYCBP2-AS2-201ENST00000428716 428 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
PACSIN3Q9UKS6 AC104653.2-201ENST00000435407 416 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
PACSIN3Q9UKS6 LINC01359-202ENST00000436350 710 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
PACSIN3Q9UKS6 TRIM31-AS1-204ENST00000440874 549 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
PACSIN3Q9UKS6 LINC02195-201ENST00000443373 294 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
PACSIN3Q9UKS6 AL929236.1-201ENST00000443622 518 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
PACSIN3Q9UKS6 LINC01828-201ENST00000445514 531 ntTSL 4 BASIC5.05□□□□□ -1.6
PACSIN3Q9UKS6 LINC01344-202ENST00000449842 571 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
PACSIN3Q9UKS6 RPL36AP33-201ENST00000450395 310 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PACSIN3Q9UKS6 LINC01069-201ENST00000452933 546 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
PACSIN3Q9UKS6 AC108693.1-201ENST00000496068 432 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PACSIN3Q9UKS6 AC025459.1-201ENST00000504072 156 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PACSIN3Q9UKS6 AC022118.1-201ENST00000512352 547 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
PACSIN3Q9UKS6 AC114781.4-201ENST00000513707 639 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PACSIN3Q9UKS6 AC116347.2-201ENST00000514912 523 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PACSIN3Q9UKS6 RFPL4AP3-201ENST00000515267 345 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PACSIN3Q9UKS6 FTH1P11-201ENST00000517577 551 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PACSIN3Q9UKS6 AC018682.2-201ENST00000517716 399 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
PACSIN3Q9UKS6 AC079209.1-202ENST00000521953 522 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
PACSIN3Q9UKS6 IGKV2-18-201ENST00000522607 343 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PACSIN3Q9UKS6 EBAG9-207ENST00000531677 777 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
PACSIN3Q9UKS6 AC005906.2-204ENST00000541095 481 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
PACSIN3Q9UKS6 OR11J2P-201ENST00000555298 907 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PACSIN3Q9UKS6 PSMA3-213ENST00000557508 814 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
PACSIN3Q9UKS6 AC009269.4-201ENST00000557828 440 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
PACSIN3Q9UKS6 AC090971.2-201ENST00000558142 510 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
PACSIN3Q9UKS6 ANP32BP3-201ENST00000559213 706 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PACSIN3Q9UKS6 PWRN4-201ENST00000563016 420 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
PACSIN3Q9UKS6 AC092140.1-201ENST00000563090 549 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
PACSIN3Q9UKS6 AC009113.2-201ENST00000563182 403 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
PACSIN3Q9UKS6 ANKRD36BP2-206ENST00000575193 1245 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PACSIN3Q9UKS6 MIR4489-201ENST00000578869 62 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PACSIN3Q9UKS6 AC015845.1-202ENST00000580184 242 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
PACSIN3Q9UKS6 AC008507.1-201ENST00000587506 734 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PACSIN3Q9UKS6 AC010618.3-202ENST00000598141 476 ntTSL 3 BASIC5.05□□□□□ -1.6
PACSIN3Q9UKS6 LINC02109-204ENST00000602801 563 ntTSL 4 BASIC5.05□□□□□ -1.6
PACSIN3Q9UKS6 RNU6-84P-201ENST00000607737 102 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PACSIN3Q9UKS6 AC109583.2-201ENST00000617367 129 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PACSIN3Q9UKS6 MALAT1-210ENST00000617489 318 ntTSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
PACSIN3Q9UKS6 LINC01320-210ENST00000626008 929 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
PACSIN3Q9UKS6 LINC01902-203ENST00000637369 7356 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
PACSIN3Q9UKS6 OR2AT4-205ENST00000641931 8357 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
PACSIN3Q9UKS6 SKP1-202ENST00000353411 9474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
PACSIN3Q9UKS6 IFIT1B-201ENST00000371809 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
PACSIN3Q9UKS6 DNAH14-208ENST00000430092 13763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
PACSIN3Q9UKS6 ALS2CR12-202ENST00000392257 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
PACSIN3Q9UKS6 AC092111.2-201ENST00000611627 1414 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PACSIN3Q9UKS6 EPHA7-202ENST00000369303 6588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
PACSIN3Q9UKS6 TMEM154-201ENST00000304385 10698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
PACSIN3Q9UKS6 UGT2B17-201ENST00000317746 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
PACSIN3Q9UKS6 PIK3C3-217ENST00000639914 2722 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
PACSIN3Q9UKS6 EXO1-201ENST00000348581 3192 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
PACSIN3Q9UKS6 SLC26A5-207ENST00000393729 2422 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
PACSIN3Q9UKS6 AC126323.6-202ENST00000568092 3511 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
PACSIN3Q9UKS6 ZBTB38-220ENST00000514251 7683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
PACSIN3Q9UKS6 SPEF2-216ENST00000637569 7350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
PACSIN3Q9UKS6 ZBED6-201ENST00000545588 7979 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
PACSIN3Q9UKS6 CRYAB-201ENST00000227251 848 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
PACSIN3Q9UKS6 AC010132.2-201ENST00000295493 1043 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
PACSIN3Q9UKS6 OR5K1-201ENST00000332650 1097 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
PACSIN3Q9UKS6 AL353740.1-201ENST00000366253 575 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
PACSIN3Q9UKS6 RCAN3-201ENST00000374393 382 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
PACSIN3Q9UKS6 Y_RNA.554-201ENST00000384672 102 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
PACSIN3Q9UKS6 MIR589-201ENST00000385238 99 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
PACSIN3Q9UKS6 TAS2R31-201ENST00000390675 1021 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
PACSIN3Q9UKS6 AC093719.1-202ENST00000392735 373 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
PACSIN3Q9UKS6 AL035419.1-201ENST00000397037 564 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
PACSIN3Q9UKS6 AL035604.1-201ENST00000416481 531 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
PACSIN3Q9UKS6 Z99497.1-201ENST00000421282 135 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
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