Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q05

TRAPPC9, Trafficking protein particle complex subunit 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC9Q96Q05 AC110775.1-201ENST00000513721 462 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
TRAPPC9Q96Q05 LINC00534-201ENST00000517400 793 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
TRAPPC9Q96Q05 AC068880.2-201ENST00000521016 362 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
TRAPPC9Q96Q05 AC025437.5-201ENST00000522769 314 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
TRAPPC9Q96Q05 AC007876.1-201ENST00000527562 983 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
TRAPPC9Q96Q05 OR4U1P-201ENST00000554958 912 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
TRAPPC9Q96Q05 NOP10-202ENST00000557912 436 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
TRAPPC9Q96Q05 AC138305.2-201ENST00000561595 556 ntTSL 4 BASIC4.95□□□□□ -1.62
TRAPPC9Q96Q05 AC022166.2-201ENST00000566030 536 ntTSL 4 BASIC4.95□□□□□ -1.62
TRAPPC9Q96Q05 AC091057.2-201ENST00000602594 792 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
TRAPPC9Q96Q05 AP003973.1-201ENST00000604639 691 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
TRAPPC9Q96Q05 Z99289.3-201ENST00000605586 594 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
TRAPPC9Q96Q05 AC007349.4-201ENST00000608114 532 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
TRAPPC9Q96Q05 PLSCR2-206ENST00000610787 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
TRAPPC9Q96Q05 C8orf59-213ENST00000619594 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
TRAPPC9Q96Q05 Metazoa_SRP.93-201ENST00000622525 276 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
TRAPPC9Q96Q05 SATB1-AS1-258ENST00000629405 664 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
TRAPPC9Q96Q05 AC006210.2-201ENST00000367074 1545 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
TRAPPC9Q96Q05 B3GNT5-201ENST00000326505 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
TRAPPC9Q96Q05 LTA4H-202ENST00000413268 1908 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
TRAPPC9Q96Q05 TTC3-204ENST00000399017 10363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
TRAPPC9Q96Q05 OR2T7-202ENST00000641557 3409 ntAPPRIS P1 BASIC4.95□□□□□ -1.62
TRAPPC9Q96Q05 ZEB1-202ENST00000361642 5990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
TRAPPC9Q96Q05 EDIL3-202ENST00000380138 4244 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
TRAPPC9Q96Q05 KPNA2P2-201ENST00000419546 1489 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
TRAPPC9Q96Q05 CLSPN-203ENST00000373220 3977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
TRAPPC9Q96Q05 SPEF2-216ENST00000637569 7350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
TRAPPC9Q96Q05 IRAK4-203ENST00000448290 1381 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
TRAPPC9Q96Q05 SULT1E1-201ENST00000226444 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
TRAPPC9Q96Q05 UBR5-204ENST00000518205 1931 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
TRAPPC9Q96Q05 OR10A5-201ENST00000299454 1054 ntAPPRIS P1 BASIC4.94□□□□□ -1.62
TRAPPC9Q96Q05 SNORD116.1-201ENST00000365628 92 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
TRAPPC9Q96Q05 RGS10-201ENST00000369101 738 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
TRAPPC9Q96Q05 KRTAP27-1-201ENST00000382835 682 ntAPPRIS P1 BASIC4.94□□□□□ -1.62
TRAPPC9Q96Q05 FCF1P5-201ENST00000406490 482 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
TRAPPC9Q96Q05 RPL31P52-201ENST00000407532 367 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
TRAPPC9Q96Q05 RN7SKP114-201ENST00000410327 279 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
TRAPPC9Q96Q05 TMBIM7P-201ENST00000418074 855 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
TRAPPC9Q96Q05 ELOCP9-201ENST00000418624 239 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
TRAPPC9Q96Q05 AL356056.1-206ENST00000424615 407 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
TRAPPC9Q96Q05 NIPA2P1-201ENST00000426223 976 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
TRAPPC9Q96Q05 AP001599.1-201ENST00000426771 361 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
TRAPPC9Q96Q05 RPL12P28-201ENST00000430852 489 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
TRAPPC9Q96Q05 RPL37P1-201ENST00000432310 284 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
TRAPPC9Q96Q05 VAV3-AS1-201ENST00000438318 619 ntTSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
TRAPPC9Q96Q05 AC006466.1-201ENST00000438721 289 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
TRAPPC9Q96Q05 AC064874.1-202ENST00000440101 287 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
TRAPPC9Q96Q05 HRAT17-201ENST00000447785 547 ntTSL 4 BASIC4.94□□□□□ -1.62
TRAPPC9Q96Q05 AL583803.1-201ENST00000454262 334 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
TRAPPC9Q96Q05 AC092832.2-201ENST00000456621 389 ntTSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
TRAPPC9Q96Q05 CDKN3-205ENST00000458126 845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
TRAPPC9Q96Q05 AL049548.1-201ENST00000458194 385 ntTSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
TRAPPC9Q96Q05 AC096992.1-201ENST00000459808 709 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
TRAPPC9Q96Q05 AC092957.1-201ENST00000473299 570 ntTSL 4 BASIC4.94□□□□□ -1.62
TRAPPC9Q96Q05 MORC1-AS1-201ENST00000480826 564 ntTSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
TRAPPC9Q96Q05 VPS26AP1-201ENST00000483197 979 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
TRAPPC9Q96Q05 AC048346.1-201ENST00000510247 144 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
TRAPPC9Q96Q05 RN7SKP260-201ENST00000516907 149 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
TRAPPC9Q96Q05 RNA5SP135-201ENST00000517019 125 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
TRAPPC9Q96Q05 AP001574.1-201ENST00000519566 546 ntTSL 4 BASIC4.94□□□□□ -1.62
TRAPPC9Q96Q05 SMARCE1P4-201ENST00000523647 241 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
TRAPPC9Q96Q05 OSGEPL1-AS1-203ENST00000523895 567 ntTSL 4 BASIC4.94□□□□□ -1.62
TRAPPC9Q96Q05 AP001922.4-201ENST00000526967 290 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
TRAPPC9Q96Q05 HIGD1AP5-201ENST00000529959 259 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
TRAPPC9Q96Q05 FAM222A-AS1-202ENST00000541460 751 ntTSL 4 BASIC4.94□□□□□ -1.62
TRAPPC9Q96Q05 GSTP1P1-201ENST00000548078 319 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
TRAPPC9Q96Q05 AC020891.3-201ENST00000560011 363 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
TRAPPC9Q96Q05 AADACP1-206ENST00000561502 1193 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
TRAPPC9Q96Q05 NF1P5-201ENST00000588287 448 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
TRAPPC9Q96Q05 AC007673.1-201ENST00000590604 1100 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
TRAPPC9Q96Q05 AC245036.5-201ENST00000596330 847 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
TRAPPC9Q96Q05 AC010618.3-202ENST00000598141 476 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
TRAPPC9Q96Q05 AL390816.3-201ENST00000604527 1066 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
TRAPPC9Q96Q05 MIR4500HG-205ENST00000606590 579 ntTSL 4 BASIC4.94□□□□□ -1.62
TRAPPC9Q96Q05 AC091979.2-201ENST00000607514 214 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
TRAPPC9Q96Q05 AC093799.2-201ENST00000610062 578 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
TRAPPC9Q96Q05 AC092106.3-201ENST00000611308 722 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
TRAPPC9Q96Q05 DEC1-204ENST00000614246 210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
TRAPPC9Q96Q05 SNX18P1Y-201ENST00000616231 511 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
TRAPPC9Q96Q05 NEAT1-205ENST00000616315 483 ntTSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
TRAPPC9Q96Q05 AL355493.4-201ENST00000618530 292 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
TRAPPC9Q96Q05 AC124312.6-202ENST00000623624 418 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
TRAPPC9Q96Q05 AC008703.1-201ENST00000637629 1174 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
TRAPPC9Q96Q05 HHLA2-210ENST00000491820 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
TRAPPC9Q96Q05 MYBPC1-204ENST00000452455 3861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
TRAPPC9Q96Q05 PAK3-213ENST00000620137 2130 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
TRAPPC9Q96Q05 STEAP2-203ENST00000394622 6612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
TRAPPC9Q96Q05 AC108751.5-201ENST00000492880 1336 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
TRAPPC9Q96Q05 EMSY-205ENST00000524767 4116 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
TRAPPC9Q96Q05 ZNF876P-202ENST00000398732 1485 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
TRAPPC9Q96Q05 AC139713.2-215ENST00000641428 5037 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
TRAPPC9Q96Q05 DLX6-AS1-201ENST00000430027 15364 ntTSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
TRAPPC9Q96Q05 MTUS1-203ENST00000381861 3996 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
TRAPPC9Q96Q05 DNTTIP2-202ENST00000436063 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
TRAPPC9Q96Q05 LINC01289-201ENST00000519550 3712 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
TRAPPC9Q96Q05 FCHO2-207ENST00000512348 2700 ntTSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
TRAPPC9Q96Q05 CKS1B-201ENST00000308987 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
TRAPPC9Q96Q05 CRISP1-201ENST00000329411 1709 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
TRAPPC9Q96Q05 GSTA1-201ENST00000334575 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
TRAPPC9Q96Q05 IKZF3-202ENST00000346243 1296 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.5 ms