Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z7E8

UBE2Q1, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 Q1, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2Q1Q7Z7E8 AL049839.1-201ENST00000556151 657 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
UBE2Q1Q7Z7E8 AL110505.1-201ENST00000557062 522 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
UBE2Q1Q7Z7E8 AC066612.1-202ENST00000561094 518 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
UBE2Q1Q7Z7E8 RN7SL652P-201ENST00000577769 300 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
UBE2Q1Q7Z7E8 MIR3936-201ENST00000584304 110 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
UBE2Q1Q7Z7E8 AC010618.3-202ENST00000598141 476 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
UBE2Q1Q7Z7E8 BNIP3P11-201ENST00000603878 563 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
UBE2Q1Q7Z7E8 PDCD6IPP1-201ENST00000615124 579 ntTSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
UBE2Q1Q7Z7E8 AC021755.4-201ENST00000616620 456 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
UBE2Q1Q7Z7E8 MIR3653-201ENST00000625572 110 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
UBE2Q1Q7Z7E8 ERI2-202ENST00000357967 3499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
UBE2Q1Q7Z7E8 ZNF93-201ENST00000343769 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
UBE2Q1Q7Z7E8 ANKRD30A-201ENST00000361713 4405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
UBE2Q1Q7Z7E8 NCOA1-206ENST00000407230 4745 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
UBE2Q1Q7Z7E8 ATP1B4-201ENST00000218008 3868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
UBE2Q1Q7Z7E8 UGT2B7-201ENST00000305231 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
UBE2Q1Q7Z7E8 ARHGEF3-203ENST00000413728 3992 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
UBE2Q1Q7Z7E8 MKKS-202ENST00000399054 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
UBE2Q1Q7Z7E8 ZBED6-202ENST00000550078 12481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
UBE2Q1Q7Z7E8 ZNF705E-201ENST00000525199 3442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
UBE2Q1Q7Z7E8 ZNF284-201ENST00000421176 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
UBE2Q1Q7Z7E8 Z94721.2-201ENST00000609590 5310 ntTSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
UBE2Q1Q7Z7E8 LANCL1-204ENST00000441020 4503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
UBE2Q1Q7Z7E8 AC008758.3-201ENST00000507003 1829 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
UBE2Q1Q7Z7E8 OR4E1-202ENST00000641792 3742 ntAPPRIS P5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
UBE2Q1Q7Z7E8 KLHL13-201ENST00000262820 3972 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
UBE2Q1Q7Z7E8 OR51H2P-202ENST00000641424 3046 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
UBE2Q1Q7Z7E8 LINC00989-201ENST00000508174 2080 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
UBE2Q1Q7Z7E8 LRMP-201ENST00000354454 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
UBE2Q1Q7Z7E8 AHCTF1-201ENST00000326225 8633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
UBE2Q1Q7Z7E8 CTNNAL1-203ENST00000374594 824 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
UBE2Q1Q7Z7E8 DEFB119-203ENST00000376321 457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
UBE2Q1Q7Z7E8 AL034370.1-201ENST00000397254 1590 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
UBE2Q1Q7Z7E8 AP002784.2-201ENST00000397300 549 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
UBE2Q1Q7Z7E8 AL022722.2-201ENST00000402519 180 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
UBE2Q1Q7Z7E8 RPL26P37-201ENST00000411983 438 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
UBE2Q1Q7Z7E8 AC008173.1-201ENST00000418901 264 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
UBE2Q1Q7Z7E8 AC092920.1-201ENST00000428516 678 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
UBE2Q1Q7Z7E8 RPS7P2-201ENST00000435134 607 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
UBE2Q1Q7Z7E8 ACTR3P2-201ENST00000439585 1257 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
UBE2Q1Q7Z7E8 AC006333.1-202ENST00000440504 555 ntTSL 4 BASIC5.27□□□□□ -1.57
UBE2Q1Q7Z7E8 OR10R1P-201ENST00000441524 1141 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
UBE2Q1Q7Z7E8 VN1R25P-201ENST00000443385 738 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
UBE2Q1Q7Z7E8 AC007179.2-204ENST00000444001 765 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
UBE2Q1Q7Z7E8 AC016772.1-201ENST00000444170 1261 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
UBE2Q1Q7Z7E8 AC108463.1-201ENST00000450258 347 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
UBE2Q1Q7Z7E8 SCARNA10-201ENST00000459255 330 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
UBE2Q1Q7Z7E8 UQCRHP4-201ENST00000471686 272 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
UBE2Q1Q7Z7E8 AC018816.1-205ENST00000489771 509 ntTSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
UBE2Q1Q7Z7E8 NUDT6-203ENST00000502270 678 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
UBE2Q1Q7Z7E8 AC097515.1-201ENST00000512370 435 ntTSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
UBE2Q1Q7Z7E8 RNA5SP230-201ENST00000517039 122 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
UBE2Q1Q7Z7E8 NECAB1-202ENST00000521366 2908 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
UBE2Q1Q7Z7E8 CARD16-203ENST00000525374 503 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
UBE2Q1Q7Z7E8 AC022874.1-201ENST00000526382 550 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
UBE2Q1Q7Z7E8 AP003110.1-201ENST00000526976 717 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
UBE2Q1Q7Z7E8 MTATP6P15-201ENST00000527233 835 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
UBE2Q1Q7Z7E8 TEX12-202ENST00000530752 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
UBE2Q1Q7Z7E8 AP000857.2-201ENST00000532123 419 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
UBE2Q1Q7Z7E8 CASP1-216ENST00000534497 825 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
UBE2Q1Q7Z7E8 LINC01489-201ENST00000542689 605 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
UBE2Q1Q7Z7E8 AC090503.1-201ENST00000548029 729 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
UBE2Q1Q7Z7E8 AC107958.2-201ENST00000555396 592 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
UBE2Q1Q7Z7E8 AC009562.1-202ENST00000558755 565 ntTSL 4 BASIC5.27□□□□□ -1.57
UBE2Q1Q7Z7E8 AC051619.4-201ENST00000560034 292 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
UBE2Q1Q7Z7E8 AC009097.3-201ENST00000563557 1018 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
UBE2Q1Q7Z7E8 AC145350.1-201ENST00000567426 208 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
UBE2Q1Q7Z7E8 AC092132.1-201ENST00000570859 352 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
UBE2Q1Q7Z7E8 PCNAP1-202ENST00000595299 752 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
UBE2Q1Q7Z7E8 AC013444.2-201ENST00000603317 787 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
UBE2Q1Q7Z7E8 PLCE1-AS2-211ENST00000613585 542 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
UBE2Q1Q7Z7E8 VN1R9P-201ENST00000614184 867 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
UBE2Q1Q7Z7E8 AL133243.1-201ENST00000614487 366 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
UBE2Q1Q7Z7E8 AL161616.2-201ENST00000622001 565 ntTSL 4 BASIC5.27□□□□□ -1.57
UBE2Q1Q7Z7E8 OBSCN-210ENST00000570156 26925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
UBE2Q1Q7Z7E8 MTND5P31-201ENST00000419366 1374 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
UBE2Q1Q7Z7E8 LINC00690-201ENST00000429949 1365 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
UBE2Q1Q7Z7E8 MTUS1-228ENST00000544260 3650 ntTSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
UBE2Q1Q7Z7E8 AL445623.2-201ENST00000640307 4805 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
UBE2Q1Q7Z7E8 SPATA2P1-201ENST00000431223 2055 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
UBE2Q1Q7Z7E8 CACNB4-273ENST00000638091 4061 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
UBE2Q1Q7Z7E8 BX088651.2-201ENST00000425493 3614 ntTSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
UBE2Q1Q7Z7E8 AL355578.1-201ENST00000607405 1328 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
UBE2Q1Q7Z7E8 AC008432.1-201ENST00000615912 1320 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
UBE2Q1Q7Z7E8 MBNL3-201ENST00000370839 1575 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
UBE2Q1Q7Z7E8 RIMS1-212ENST00000517827 3065 ntTSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
UBE2Q1Q7Z7E8 OR10J6P-201ENST00000289731 930 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
UBE2Q1Q7Z7E8 RPL9-201ENST00000295955 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
UBE2Q1Q7Z7E8 RNA5SP366-201ENST00000365454 123 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
UBE2Q1Q7Z7E8 LINC00161-201ENST00000412526 870 ntTSL 2 BASIC5.26□□□□□ -1.57
UBE2Q1Q7Z7E8 RPL23AP26-201ENST00000412728 464 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
UBE2Q1Q7Z7E8 TRGV6-201ENST00000417928 299 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
UBE2Q1Q7Z7E8 MTCO3P4-201ENST00000419236 787 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
UBE2Q1Q7Z7E8 AC064875.1-202ENST00000421112 561 ntTSL 4 BASIC5.26□□□□□ -1.57
UBE2Q1Q7Z7E8 OR2X1P-201ENST00000421144 687 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
UBE2Q1Q7Z7E8 AL160175.1-201ENST00000428124 247 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
UBE2Q1Q7Z7E8 AL132765.1-201ENST00000434165 553 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
UBE2Q1Q7Z7E8 FTH1P16-201ENST00000435241 552 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
UBE2Q1Q7Z7E8 PRSS3P4-201ENST00000453323 162 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
UBE2Q1Q7Z7E8 AL122008.1-201ENST00000456078 452 ntTSL 3 BASIC5.26□□□□□ -1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 117.8 ms