Protein–RNA interactions for Protein: Q16778

HIST2H2BE, Histone H2B type 2-E, humanhuman

Predictions only

Length 126 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIST2H2BEQ16778 FAN1-202ENST00000561594 2738 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
HIST2H2BEQ16778 SYT14P1-202ENST00000600441 1448 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
HIST2H2BEQ16778 IL18R1-202ENST00000334376 537 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
HIST2H2BEQ16778 RNU6-666P-201ENST00000363499 107 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
HIST2H2BEQ16778 RNU1-130P-201ENST00000363930 160 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
HIST2H2BEQ16778 TRPM3-206ENST00000377097 554 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
HIST2H2BEQ16778 ADPRM-201ENST00000379774 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
HIST2H2BEQ16778 ITGA9-AS1-202ENST00000420870 581 ntTSL 4 BASIC2.88□□□□□ -1.95
HIST2H2BEQ16778 FAR2P4-202ENST00000425399 584 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
HIST2H2BEQ16778 AL157831.1-201ENST00000426134 473 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
HIST2H2BEQ16778 AC093581.1-202ENST00000430890 391 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
HIST2H2BEQ16778 RPL23AP69-201ENST00000431134 458 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
HIST2H2BEQ16778 AC009487.1-201ENST00000444164 403 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
HIST2H2BEQ16778 RPS3AP46-201ENST00000448352 682 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
HIST2H2BEQ16778 RPL31P20-201ENST00000449593 360 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
HIST2H2BEQ16778 SEC22A-207ENST00000481965 673 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
HIST2H2BEQ16778 HMGB1P21-201ENST00000502313 581 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
HIST2H2BEQ16778 MTATP6P22-201ENST00000507369 598 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
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HIST2H2BEQ16778 AC010265.1-201ENST00000513509 211 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
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HIST2H2BEQ16778 NRG1-IT1-201ENST00000520444 758 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
HIST2H2BEQ16778 AC023202.1-201ENST00000521681 491 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
HIST2H2BEQ16778 OR5M10-201ENST00000526812 1052 ntAPPRIS P1 BASIC2.88□□□□□ -1.95
HIST2H2BEQ16778 AC103681.1-202ENST00000534342 449 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
HIST2H2BEQ16778 AP001880.2-201ENST00000538233 448 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
HIST2H2BEQ16778 LINC02406-201ENST00000553029 546 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
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HIST2H2BEQ16778 AL132800.1-201ENST00000555109 698 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
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HIST2H2BEQ16778 AC027281.1-201ENST00000574178 758 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
HIST2H2BEQ16778 AMZ2-204ENST00000577273 895 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
HIST2H2BEQ16778 AL136311.1-213ENST00000586466 520 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
HIST2H2BEQ16778 LINC01028-202ENST00000588782 458 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
HIST2H2BEQ16778 AC006557.3-201ENST00000592926 517 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
HIST2H2BEQ16778 AP001160.4-201ENST00000596971 382 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
HIST2H2BEQ16778 AL157392.3-211ENST00000599378 509 ntTSL 4 BASIC2.88□□□□□ -1.95
HIST2H2BEQ16778 AP003117.2-201ENST00000606010 545 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
HIST2H2BEQ16778 C8orf89-201ENST00000613105 495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
HIST2H2BEQ16778 GPR34-203ENST00000620846 1282 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
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HIST2H2BEQ16778 ZBTB20-201ENST00000357258 27125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
HIST2H2BEQ16778 SEPT7P7-201ENST00000420492 1301 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
HIST2H2BEQ16778 FAM111A-207ENST00000531147 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
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HIST2H2BEQ16778 CNTN6-201ENST00000350110 3814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
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HIST2H2BEQ16778 MIR6726-201ENST00000613751 61 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
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HIST2H2BEQ16778 Xist_exon1.1-201ENST00000618930 85 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
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HIST2H2BEQ16778 RASSF8-210ENST00000541490 5505 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
HIST2H2BEQ16778 GNAI3-201ENST00000369851 27174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
HIST2H2BEQ16778 AL353743.4-201ENST00000422653 1547 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
HIST2H2BEQ16778 FER-202ENST00000438717 1531 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
HIST2H2BEQ16778 C8orf34-202ENST00000337103 3652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
HIST2H2BEQ16778 ZNF99-201ENST00000397104 3114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
HIST2H2BEQ16778 LRRTM2-201ENST00000274711 6017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
HIST2H2BEQ16778 AC021755.1-201ENST00000559747 1447 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
HIST2H2BEQ16778 TAS2R14-202ENST00000537503 1858 ntAPPRIS P1 BASIC2.86□□□□□ -1.95
HIST2H2BEQ16778 LRMP-221ENST00000636465 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
HIST2H2BEQ16778 GPR18-203ENST00000397473 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
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