Protein–RNA interactions for Protein: Q15836

VAMP3, Vesicle-associated membrane protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3Q15836 CDY13P-201ENST00000445813 1015 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
VAMP3Q15836 LINC01344-202ENST00000449842 571 ntTSL 3 BASIC3.15□□□□□ -1.91
VAMP3Q15836 CDY23P-201ENST00000451661 1014 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
VAMP3Q15836 KCNMB2-AS1-205ENST00000451742 844 ntTSL 4 BASIC3.15□□□□□ -1.91
VAMP3Q15836 RN7SL329P-201ENST00000467740 299 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
VAMP3Q15836 APOPT1-204ENST00000473127 739 ntTSL 3 BASIC3.15□□□□□ -1.91
VAMP3Q15836 IGLV2-34-201ENST00000490007 283 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
VAMP3Q15836 AL024509.2-201ENST00000493462 493 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
VAMP3Q15836 AC093903.1-201ENST00000507220 405 ntTSL 3 BASIC3.15□□□□□ -1.91
VAMP3Q15836 AL133372.2-203ENST00000508469 922 ntTSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.91
VAMP3Q15836 AC008885.2-201ENST00000509506 930 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
VAMP3Q15836 OR5H7P-201ENST00000514084 930 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
VAMP3Q15836 RN7SKP116-201ENST00000516902 319 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
VAMP3Q15836 RNU6-709P-201ENST00000517257 104 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
VAMP3Q15836 AC040914.1-201ENST00000518674 318 ntTSL 3 BASIC3.15□□□□□ -1.91
VAMP3Q15836 AC011363.1-201ENST00000524198 458 ntTSL 5 BASIC3.15□□□□□ -1.91
VAMP3Q15836 SPAG11B-207ENST00000528168 481 ntTSL 5 BASIC3.15□□□□□ -1.91
VAMP3Q15836 AP004607.5-201ENST00000532034 217 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
VAMP3Q15836 FBXO3-AS1-202ENST00000533046 386 ntTSL 3 BASIC3.15□□□□□ -1.91
VAMP3Q15836 SDHAF2-205ENST00000537782 559 ntTSL 4 BASIC3.15□□□□□ -1.91
VAMP3Q15836 AP000593.3-201ENST00000546065 578 ntTSL 2 BASIC3.15□□□□□ -1.91
VAMP3Q15836 AC126178.1-201ENST00000548722 926 ntTSL 2 BASIC3.15□□□□□ -1.91
VAMP3Q15836 LINC01580-201ENST00000555255 561 ntTSL 4 BASIC3.15□□□□□ -1.91
VAMP3Q15836 AC131532.1-201ENST00000555596 519 ntTSL 4 BASIC3.15□□□□□ -1.91
VAMP3Q15836 AC025580.2-202ENST00000558536 715 ntTSL 3 BASIC3.15□□□□□ -1.91
VAMP3Q15836 AC027176.2-201ENST00000559166 746 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
VAMP3Q15836 ZNF667-AS1-207ENST00000592146 668 ntTSL 5 BASIC3.15□□□□□ -1.91
VAMP3Q15836 AL109653.1-201ENST00000603091 248 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
VAMP3Q15836 AC008121.2-201ENST00000614647 523 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
VAMP3Q15836 AC018926.3-201ENST00000618841 406 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
VAMP3Q15836 AC004943.1-201ENST00000620814 561 ntTSL 5 BASIC3.15□□□□□ -1.91
VAMP3Q15836 CNBD1-207ENST00000620844 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.15□□□□□ -1.91
VAMP3Q15836 LGALS13-204ENST00000621475 494 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.15□□□□□ -1.91
VAMP3Q15836 AC093495.1-217ENST00000627385 428 ntTSL 5 BASIC3.15□□□□□ -1.91
VAMP3Q15836 DLG1-210ENST00000422288 2854 ntTSL 5 BASIC3.15□□□□□ -1.91
VAMP3Q15836 ACTR3BP2-202ENST00000623630 1338 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
VAMP3Q15836 EYA4-202ENST00000355286 4317 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.91
VAMP3Q15836 MAPK10-263ENST00000641052 4307 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
VAMP3Q15836 LINC01733-201ENST00000449316 4604 ntTSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.91
VAMP3Q15836 RMDN2-205ENST00000407257 2280 ntTSL 5 BASIC3.14□□□□□ -1.91
VAMP3Q15836 C12orf60-201ENST00000330828 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
VAMP3Q15836 RIOK3P1-201ENST00000418778 1528 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
VAMP3Q15836 ADGRG4-203ENST00000394143 9931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
VAMP3Q15836 AC004852.2-204ENST00000614137 1370 ntTSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
VAMP3Q15836 LBR-202ENST00000338179 3812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.14□□□□□ -1.91
VAMP3Q15836 STEAP4-201ENST00000301959 2321 ntTSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
VAMP3Q15836 ZRANB2-201ENST00000254821 2821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
VAMP3Q15836 AC106872.5-201ENST00000508856 1416 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
VAMP3Q15836 OR5M3-202ENST00000641993 1400 ntAPPRIS P1 BASIC3.14□□□□□ -1.91
VAMP3Q15836 LINC02384-201ENST00000360485 471 ntTSL 5 BASIC3.14□□□□□ -1.91
VAMP3Q15836 RNA5SP428-201ENST00000365129 132 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
VAMP3Q15836 SSX5-203ENST00000376923 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.14□□□□□ -1.91
VAMP3Q15836 Y_RNA.493-201ENST00000384422 102 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
VAMP3Q15836 SNORA70.10-201ENST00000384515 134 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
VAMP3Q15836 AL354719.1-201ENST00000406535 843 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
VAMP3Q15836 RPL30P2-201ENST00000414021 291 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
VAMP3Q15836 AC098820.3-201ENST00000414135 976 ntTSL 3 BASIC3.14□□□□□ -1.91
VAMP3Q15836 AC005162.1-201ENST00000416513 389 ntTSL 5 BASIC3.14□□□□□ -1.91
VAMP3Q15836 ODF2-AS1-201ENST00000420801 407 ntTSL 3 BASIC3.14□□□□□ -1.91
VAMP3Q15836 AL355994.1-201ENST00000424379 260 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
VAMP3Q15836 BX323845.3-201ENST00000428215 527 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
VAMP3Q15836 AL591719.2-201ENST00000437400 386 ntTSL 3 BASIC3.14□□□□□ -1.91
VAMP3Q15836 AC083863.1-201ENST00000438811 231 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
VAMP3Q15836 TRIM31-AS1-204ENST00000440874 549 ntTSL 3 BASIC3.14□□□□□ -1.91
VAMP3Q15836 RPL7P59-201ENST00000447700 943 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
VAMP3Q15836 AC073850.1-201ENST00000449243 255 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
VAMP3Q15836 AL137802.1-201ENST00000452795 327 ntTSL 5 BASIC3.14□□□□□ -1.91
VAMP3Q15836 AC104308.1-201ENST00000454621 333 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
VAMP3Q15836 AC004801.2-202ENST00000463559 283 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
VAMP3Q15836 AC026353.1-201ENST00000470523 558 ntTSL 2 BASIC3.14□□□□□ -1.91
VAMP3Q15836 SNRPCP11-201ENST00000492453 205 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
VAMP3Q15836 STK26-205ENST00000496850 1186 ntTSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
VAMP3Q15836 HMGB1P22-201ENST00000505315 124 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
VAMP3Q15836 GLRX-203ENST00000505427 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.14□□□□□ -1.91
VAMP3Q15836 AC008957.1-203ENST00000508745 589 ntTSL 3 BASIC3.14□□□□□ -1.91
VAMP3Q15836 AC008565.1-201ENST00000509046 885 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
VAMP3Q15836 RPL7L1P4-201ENST00000513004 707 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
VAMP3Q15836 AC090193.1-201ENST00000518633 543 ntTSL 4 BASIC3.14□□□□□ -1.91
VAMP3Q15836 AC008575.1-201ENST00000520401 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.14□□□□□ -1.91
VAMP3Q15836 AC021242.2-201ENST00000522765 454 ntTSL 3 BASIC3.14□□□□□ -1.91
VAMP3Q15836 RGS4-207ENST00000527809 817 ntTSL 4 BASIC3.14□□□□□ -1.91
VAMP3Q15836 AP003557.1-202ENST00000528978 562 ntTSL 4 BASIC3.14□□□□□ -1.91
VAMP3Q15836 SNHG1-208ENST00000538266 347 ntTSL 3 BASIC3.14□□□□□ -1.91
VAMP3Q15836 AC079905.1-201ENST00000549280 475 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
VAMP3Q15836 ATP5G2-205ENST00000549748 728 ntTSL 2 BASIC3.14□□□□□ -1.91
VAMP3Q15836 AL049870.3-201ENST00000555157 360 ntTSL 2 BASIC3.14□□□□□ -1.91
VAMP3Q15836 AC016134.1-201ENST00000565259 701 ntTSL 3 BASIC3.14□□□□□ -1.91
VAMP3Q15836 AC104996.1-201ENST00000583250 591 ntTSL 5 BASIC3.14□□□□□ -1.91
VAMP3Q15836 AC103810.2-203ENST00000584959 631 ntTSL 5 BASIC3.14□□□□□ -1.91
VAMP3Q15836 AC091132.5-204ENST00000586348 630 ntTSL 3 BASIC3.14□□□□□ -1.91
VAMP3Q15836 PRKCQ-AS1-207ENST00000607996 531 ntTSL 5 BASIC3.14□□□□□ -1.91
VAMP3Q15836 AC092653.1-201ENST00000608509 531 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
VAMP3Q15836 AC009032.1-201ENST00000617574 431 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
VAMP3Q15836 AC092628.2-201ENST00000622492 339 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
VAMP3Q15836 AC007546.2-201ENST00000623996 360 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
VAMP3Q15836 LYRM2-211ENST00000626778 696 ntTSL 5 BASIC3.14□□□□□ -1.91
VAMP3Q15836 LAMTOR5-AS1-244ENST00000629484 780 ntTSL 5 BASIC3.14□□□□□ -1.91
VAMP3Q15836 AC245427.9-201ENST00000633713 53 ntAPPRIS P1 BASIC3.14□□□□□ -1.91
VAMP3Q15836 UBE4A-202ENST00000431736 6061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
VAMP3Q15836 ZBTB20-201ENST00000357258 27125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
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