Protein–RNA interactions for Protein: Q15532

SS18, Protein SSXT, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SS18Q15532 ANGPTL1-202ENST00000367629 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
SS18Q15532 DICER1-203ENST00000526495 10331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
SS18Q15532 FAN1-202ENST00000561594 2738 ntTSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
SS18Q15532 SLITRK5-201ENST00000325089 21103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
SS18Q15532 FGD4-213ENST00000546442 3503 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
SS18Q15532 FAM3C2-201ENST00000312214 681 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SS18Q15532 SNORA60-201ENST00000362396 134 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SS18Q15532 HSPB11-202ENST00000371376 765 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
SS18Q15532 RNU1-89P-201ENST00000384592 164 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SS18Q15532 MIR129-1-201ENST00000384972 72 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SS18Q15532 RN7SKP182-201ENST00000410772 298 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SS18Q15532 AC098872.1-201ENST00000413304 543 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
SS18Q15532 AC119751.6-201ENST00000416712 186 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SS18Q15532 AL590006.1-201ENST00000417390 752 ntTSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
SS18Q15532 AL121885.1-201ENST00000417957 451 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
SS18Q15532 AL139095.3-201ENST00000419672 1203 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SS18Q15532 AL391807.1-202ENST00000419979 534 ntTSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
SS18Q15532 MFSD13B-201ENST00000420133 1290 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SS18Q15532 AC004837.2-201ENST00000435766 731 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
SS18Q15532 NUDT7-202ENST00000437314 930 ntTSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
SS18Q15532 AC016292.1-201ENST00000438344 235 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
SS18Q15532 AC122136.1-201ENST00000443971 478 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
SS18Q15532 LINC01376-204ENST00000449124 626 ntTSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
SS18Q15532 Z95152.1-201ENST00000453556 656 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SS18Q15532 RPL31P53-201ENST00000457065 348 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SS18Q15532 AC018742.1-202ENST00000457901 504 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
SS18Q15532 DCUN1D1-204ENST00000469954 970 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
SS18Q15532 AC104831.1-201ENST00000470024 444 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
SS18Q15532 AC007537.2-201ENST00000472093 511 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SS18Q15532 LARP7P4-201ENST00000481075 878 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SS18Q15532 AF213884.1-201ENST00000488102 463 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SS18Q15532 AC097372.3-201ENST00000503593 522 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
SS18Q15532 AK3P4-201ENST00000504283 583 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SS18Q15532 HAUS1P1-201ENST00000505275 832 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SS18Q15532 AC112198.3-201ENST00000505950 441 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
SS18Q15532 AC108043.1-201ENST00000512696 574 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SS18Q15532 SNORA26.10-201ENST00000516427 141 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SS18Q15532 LINC01030-201ENST00000517505 738 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
SS18Q15532 CDH12P4-201ENST00000517835 295 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SS18Q15532 CDH12P3-201ENST00000517935 295 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SS18Q15532 AC048387.1-201ENST00000518428 494 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
SS18Q15532 CDH12P1-201ENST00000518435 295 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SS18Q15532 AP003472.1-201ENST00000519844 644 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
SS18Q15532 AC104036.1-201ENST00000523550 611 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
SS18Q15532 AC021713.1-201ENST00000526554 510 ntTSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
SS18Q15532 AC027804.1-201ENST00000534653 529 ntTSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
SS18Q15532 AC026888.1-201ENST00000553348 559 ntTSL 4 BASIC2.81□□□□□ -1.96
SS18Q15532 ADAM3B-201ENST00000569937 840 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SS18Q15532 AC020915.5-201ENST00000596836 964 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SS18Q15532 ZNF616-203ENST00000597013 577 ntTSL 4 BASIC2.81□□□□□ -1.96
SS18Q15532 RPL12P25-202ENST00000598100 674 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SS18Q15532 MRPS35P3-201ENST00000603189 709 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SS18Q15532 AC138473.1-201ENST00000605717 526 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SS18Q15532 Z98949.1-212ENST00000609820 837 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
SS18Q15532 AC117490.2-201ENST00000610042 594 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SS18Q15532 MIR6820-201ENST00000611508 62 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SS18Q15532 CCL4L2-215ENST00000620055 537 ntTSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
SS18Q15532 CCL4-203ENST00000621626 552 ntTSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
SS18Q15532 AP003497.2-201ENST00000624220 967 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SS18Q15532 LYRM2-211ENST00000626778 696 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
SS18Q15532 AL589740.1-204ENST00000634677 630 ntTSL 4 BASIC2.81□□□□□ -1.96
SS18Q15532 AL773545.4-201ENST00000637262 310 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SS18Q15532 VGLL4-219ENST00000638314 93 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
SS18Q15532 OR5T1-201ENST00000641368 1118 ntAPPRIS P1 BASIC2.81□□□□□ -1.96
SS18Q15532 AL513478.4-201ENST00000641636 310 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SS18Q15532 OR5AC4P-202ENST00000642086 985 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SS18Q15532 CNTD1-205ENST00000588527 1308 ntTSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
SS18Q15532 AC017002.4-201ENST00000604721 1525 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SS18Q15532 AL158163.1-201ENST00000603915 1649 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SS18Q15532 CYP3A7-CYP3A51P-201ENST00000611620 1608 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
SS18Q15532 AL049830.3-201ENST00000555108 1991 ntTSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
SS18Q15532 ADGRL4-201ENST00000370742 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
SS18Q15532 KCNJ16-209ENST00000589377 3684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
SS18Q15532 AC093908.1-201ENST00000623125 8092 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
SS18Q15532 MCF2-201ENST00000338585 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
SS18Q15532 BAZ2B-204ENST00000392783 8289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
SS18Q15532 EFR3A-208ENST00000637848 2547 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
SS18Q15532 BDP1P-201ENST00000582658 1990 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SS18Q15532 TMEM71-202ENST00000377901 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
SS18Q15532 SLC39A10-202ENST00000409086 5432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
SS18Q15532 SULT1E1-201ENST00000226444 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
SS18Q15532 AC107953.2-201ENST00000518362 1408 ntTSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
SS18Q15532 CYP3A43-203ENST00000342499 1396 ntTSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
SS18Q15532 PSMD6-202ENST00000394431 1349 ntTSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
SS18Q15532 MANSC4-201ENST00000381273 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
SS18Q15532 SNORA37-201ENST00000384504 129 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SS18Q15532 Z98941.1-201ENST00000407764 100 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SS18Q15532 FAR2P2-201ENST00000413041 594 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SS18Q15532 AC011933.1-201ENST00000413334 321 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SS18Q15532 MTCYBP7-201ENST00000419540 1134 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SS18Q15532 FTH1P16-201ENST00000435241 552 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SS18Q15532 AL022310.1-201ENST00000436974 690 ntTSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
SS18Q15532 CCRL1P1-201ENST00000449542 1053 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SS18Q15532 AL513533.1-201ENST00000453728 415 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SS18Q15532 DNAJC19P1-201ENST00000455312 319 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SS18Q15532 AL392086.1-201ENST00000457632 299 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
SS18Q15532 CEACAMP4-201ENST00000457676 421 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SS18Q15532 RPL35AP28-201ENST00000459730 331 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SS18Q15532 AC116533.1-201ENST00000459748 321 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SS18Q15532 RPL7P1-201ENST00000468161 747 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.5 ms