Protein–RNA interactions for Protein: Q15477

SKIV2L, Helicase SKI2W, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,246 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIV2LQ15477 ZNF440-201ENST00000304060 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
SKIV2LQ15477 CTNND1-218ENST00000528232 5745 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
SKIV2LQ15477 CHRM5-202ENST00000557872 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
SKIV2LQ15477 ARPP21-221ENST00000444190 3182 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
SKIV2LQ15477 NR5A2-206ENST00000544748 4775 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
SKIV2LQ15477 PLD1-202ENST00000351298 5604 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
SKIV2LQ15477 NFATC3-201ENST00000329524 6144 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
SKIV2LQ15477 RASSF9-201ENST00000361228 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
SKIV2LQ15477 FTO-204ENST00000463855 3056 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
SKIV2LQ15477 AC104162.1-201ENST00000430831 2382 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
SKIV2LQ15477 MKL2-201ENST00000318282 8608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
SKIV2LQ15477 TGFBR3-202ENST00000370399 4550 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
SKIV2LQ15477 NFIB-221ENST00000637742 2166 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
SKIV2LQ15477 SLC2A3P1-201ENST00000519666 1451 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
SKIV2LQ15477 NHEJ1-202ENST00000409720 1954 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
SKIV2LQ15477 MYB-239ENST00000534121 2238 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
SKIV2LQ15477 LINC02532-208ENST00000602621 2232 ntTSL 2 BASIC7.19□□□□□ -1.26
SKIV2LQ15477 PSMD6-AS2-201ENST00000472046 2456 ntTSL 2 BASIC7.19□□□□□ -1.26
SKIV2LQ15477 LCP1-201ENST00000323076 3787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
SKIV2LQ15477 OR51E2-201ENST00000396950 2781 ntAPPRIS P1 BASIC7.19□□□□□ -1.26
SKIV2LQ15477 AC011933.2-201ENST00000578539 2790 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
SKIV2LQ15477 BIN2P1-201ENST00000504996 1530 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
SKIV2LQ15477 RN7SKP107-201ENST00000364157 290 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
SKIV2LQ15477 AL390198.1-201ENST00000376445 320 ntTSL 2 BASIC7.19□□□□□ -1.26
SKIV2LQ15477 U3.52-201ENST00000384034 216 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
SKIV2LQ15477 RNU6-193P-201ENST00000410977 107 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
SKIV2LQ15477 AC069218.2-201ENST00000411665 344 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
SKIV2LQ15477 AC008154.2-201ENST00000420268 414 ntTSL 3 BASIC7.19□□□□□ -1.26
SKIV2LQ15477 HSPE1P1-201ENST00000421494 318 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
SKIV2LQ15477 AC092832.1-201ENST00000422934 400 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
SKIV2LQ15477 COX4I1P2-201ENST00000447446 547 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
SKIV2LQ15477 ENTPD3-AS1-204ENST00000452768 724 ntTSL 2 BASIC7.19□□□□□ -1.26
SKIV2LQ15477 RN7SL160P-201ENST00000468558 284 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
SKIV2LQ15477 AC008770.1-202ENST00000495324 516 ntTSL 2 BASIC7.19□□□□□ -1.26
SKIV2LQ15477 AC098587.1-201ENST00000508241 540 ntTSL 4 BASIC7.19□□□□□ -1.26
SKIV2LQ15477 MOCS2-206ENST00000510818 1251 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
SKIV2LQ15477 TTC39CP1-201ENST00000512513 755 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
SKIV2LQ15477 AC104057.1-201ENST00000515547 497 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
SKIV2LQ15477 AC109466.1-211ENST00000519327 496 ntTSL 3 BASIC7.19□□□□□ -1.26
SKIV2LQ15477 AC090692.1-202ENST00000525363 607 ntTSL 4 BASIC7.19□□□□□ -1.26
SKIV2LQ15477 AC006205.1-201ENST00000538067 389 ntTSL 2 BASIC7.19□□□□□ -1.26
SKIV2LQ15477 AL355076.2-202ENST00000553754 574 ntTSL 4 BASIC7.19□□□□□ -1.26
SKIV2LQ15477 AC048382.2-201ENST00000560239 492 ntTSL 2 BASIC7.19□□□□□ -1.26
SKIV2LQ15477 AC044873.1-201ENST00000580487 399 ntTSL 3 BASIC7.19□□□□□ -1.26
SKIV2LQ15477 LINC01198-204ENST00000594153 552 ntTSL 3 BASIC7.19□□□□□ -1.26
SKIV2LQ15477 AC114477.1-201ENST00000605097 605 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
SKIV2LQ15477 MIR6826-201ENST00000617808 98 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
SKIV2LQ15477 AC074140.1-201ENST00000621617 208 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
SKIV2LQ15477 AL450226.2-201ENST00000622913 439 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
SKIV2LQ15477 AC129915.3-201ENST00000634128 948 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
SKIV2LQ15477 AP000550.3-201ENST00000637734 379 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
SKIV2LQ15477 ZNF675-201ENST00000359788 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
SKIV2LQ15477 AL512329.1-201ENST00000404600 1592 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
SKIV2LQ15477 ADAM3A-207ENST00000490268 2627 ntTSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
SKIV2LQ15477 CASC19-246ENST00000641625 1606 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
SKIV2LQ15477 LEO1-201ENST00000299601 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
SKIV2LQ15477 DOCK4-216ENST00000494651 3282 ntTSL 5 BASIC7.19□□□□□ -1.26
SKIV2LQ15477 OR4D10-201ENST00000530162 2482 ntAPPRIS P1 BASIC7.19□□□□□ -1.26
SKIV2LQ15477 SNX25-202ENST00000504273 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
SKIV2LQ15477 AL355377.1-201ENST00000621125 1653 ntBASIC7.19□□□□□ -1.26
SKIV2LQ15477 CSMD2-206ENST00000373388 13118 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.19□□□□□ -1.26
SKIV2LQ15477 ZNF211-202ENST00000254182 1959 ntTSL 2 BASIC7.19□□□□□ -1.26
SKIV2LQ15477 IL5RA-207ENST00000438560 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.18□□□□□ -1.26
SKIV2LQ15477 BCO2-203ENST00000438022 2598 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
SKIV2LQ15477 SEC31A-207ENST00000443462 4042 ntTSL 2 BASIC7.18□□□□□ -1.26
SKIV2LQ15477 AP004289.2-201ENST00000444413 1457 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
SKIV2LQ15477 SCFD1-207ENST00000544052 2058 ntTSL 2 BASIC7.18□□□□□ -1.26
SKIV2LQ15477 NBPF26-204ENST00000615145 2656 ntTSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
SKIV2LQ15477 NCAPH-205ENST00000455200 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
SKIV2LQ15477 TPTE2P2-202ENST00000605924 2113 ntTSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
SKIV2LQ15477 FANCD2-203ENST00000419585 5185 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
SKIV2LQ15477 NPFFR2-203ENST00000358749 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
SKIV2LQ15477 PSMC6-219ENST00000612399 1590 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
SKIV2LQ15477 OR1S2-201ENST00000302592 978 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
SKIV2LQ15477 AC067945.1-201ENST00000342609 618 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
SKIV2LQ15477 RNA5SP321-201ENST00000362722 111 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
SKIV2LQ15477 RNA5SP258-201ENST00000362750 119 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
SKIV2LQ15477 RNU5E-8P-201ENST00000363502 116 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
SKIV2LQ15477 Y_RNA.234-201ENST00000364409 97 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
SKIV2LQ15477 Y_RNA.373-201ENST00000365600 103 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
SKIV2LQ15477 RGS10-201ENST00000369101 738 ntTSL 1 (best) BASIC7.18□□□□□ -1.26
SKIV2LQ15477 RNU6-831P-201ENST00000384548 107 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
SKIV2LQ15477 MRPS21P5-201ENST00000417885 231 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
SKIV2LQ15477 AL358394.1-201ENST00000422807 535 ntTSL 2 BASIC7.18□□□□□ -1.26
SKIV2LQ15477 CHIAP3-201ENST00000423668 1133 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
SKIV2LQ15477 KRTAP3-4P-201ENST00000430780 280 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
SKIV2LQ15477 VTCN1-204ENST00000430871 569 ntTSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
SKIV2LQ15477 TIMM9P1-201ENST00000436122 256 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
SKIV2LQ15477 AC073109.1-201ENST00000445066 978 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
SKIV2LQ15477 Z80107.2-201ENST00000445127 392 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
SKIV2LQ15477 Y_RNA.631-201ENST00000459607 101 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
SKIV2LQ15477 RN7SL180P-201ENST00000466769 294 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
SKIV2LQ15477 GLYCTK-AS1-202ENST00000472761 109 ntTSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
SKIV2LQ15477 RPL21P99-201ENST00000480369 423 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
SKIV2LQ15477 AC090096.1-201ENST00000489168 390 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
SKIV2LQ15477 AC091849.1-201ENST00000509920 121 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
SKIV2LQ15477 OR5M1-201ENST00000526538 948 ntAPPRIS P1 BASIC7.18□□□□□ -1.26
SKIV2LQ15477 AP000755.2-201ENST00000526777 571 ntTSL 5 BASIC7.18□□□□□ -1.26
SKIV2LQ15477 AC011979.2-201ENST00000527568 352 ntBASIC7.18□□□□□ -1.26
SKIV2LQ15477 AL352979.2-201ENST00000556988 366 ntTSL 3 BASIC7.18□□□□□ -1.26
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