Protein–RNA interactions for Protein: Q13523

PRPF4B, Serine/threonine-protein kinase PRP4 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,007 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF4BQ13523 C12orf45-204ENST00000552951 23529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
PRPF4BQ13523 HERC4-204ENST00000395198 4445 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
PRPF4BQ13523 USP9YP4-201ENST00000424401 1745 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
PRPF4BQ13523 PNPLA8-204ENST00000426128 4268 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
PRPF4BQ13523 MARCH1-201ENST00000274056 5367 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.91□□□□□ -1.62
PRPF4BQ13523 ZC3H7A-202ENST00000396516 3845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
PRPF4BQ13523 RIMS1-204ENST00000401910 3542 ntTSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
PRPF4BQ13523 ITCH-202ENST00000374864 6401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
PRPF4BQ13523 LCOR-204ENST00000371103 10342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
PRPF4BQ13523 CTXN2-201ENST00000417307 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
PRPF4BQ13523 OR6K3-202ENST00000368146 996 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
PRPF4BQ13523 MTATP6P31-201ENST00000406985 692 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
PRPF4BQ13523 AC098872.1-201ENST00000413304 543 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
PRPF4BQ13523 SNRPFP1-201ENST00000414761 252 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
PRPF4BQ13523 AL592293.2-201ENST00000422292 996 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
PRPF4BQ13523 AC068599.1-201ENST00000422558 567 ntTSL 4 BASIC4.91□□□□□ -1.62
PRPF4BQ13523 AC073310.1-201ENST00000423226 1033 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
PRPF4BQ13523 NIPA2P1-201ENST00000426223 976 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
PRPF4BQ13523 RWDD4P2-201ENST00000426392 563 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
PRPF4BQ13523 MTCO1P43-201ENST00000431831 488 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
PRPF4BQ13523 AC011998.1-201ENST00000433403 117 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
PRPF4BQ13523 CEACAMP1-201ENST00000434624 1035 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
PRPF4BQ13523 AC073143.1-201ENST00000436316 395 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
PRPF4BQ13523 DOCK9-AS1-201ENST00000439367 392 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
PRPF4BQ13523 ARL4AP3-201ENST00000441452 574 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
PRPF4BQ13523 AC009987.1-201ENST00000446888 806 ntTSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
PRPF4BQ13523 AC005008.1-201ENST00000456151 612 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
PRPF4BQ13523 RPL23AP24-201ENST00000458203 385 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
PRPF4BQ13523 AC011276.1-201ENST00000469688 323 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
PRPF4BQ13523 MTND6P6-201ENST00000478031 263 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
PRPF4BQ13523 SETP6-201ENST00000479329 568 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
PRPF4BQ13523 RWDD4P1-201ENST00000488019 565 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
PRPF4BQ13523 DEFB109F-201ENST00000491870 277 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
PRPF4BQ13523 F11-205ENST00000492972 1204 ntTSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
PRPF4BQ13523 MTCO2P9-201ENST00000503214 694 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
PRPF4BQ13523 AC025674.1-201ENST00000507074 324 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
PRPF4BQ13523 LINC01088-203ENST00000507476 785 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
PRPF4BQ13523 AC106806.2-201ENST00000509365 500 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
PRPF4BQ13523 AC121161.1-201ENST00000510606 652 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
PRPF4BQ13523 AC021146.3-201ENST00000511911 260 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
PRPF4BQ13523 AC083923.1-201ENST00000523708 376 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
PRPF4BQ13523 CYCSP28-201ENST00000534284 321 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
PRPF4BQ13523 AC004801.3-201ENST00000547602 962 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
PRPF4BQ13523 RAB3IP-214ENST00000550847 670 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
PRPF4BQ13523 AL359237.1-202ENST00000556168 487 ntTSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
PRPF4BQ13523 AC027104.1-201ENST00000563702 681 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
PRPF4BQ13523 NUFIP2-202ENST00000579665 559 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
PRPF4BQ13523 AC015911.5-201ENST00000587076 451 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
PRPF4BQ13523 AC008966.2-201ENST00000606157 453 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
PRPF4BQ13523 AC245100.7-201ENST00000609678 442 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
PRPF4BQ13523 PLSCR2-206ENST00000610787 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
PRPF4BQ13523 VN1R9P-201ENST00000614184 867 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
PRPF4BQ13523 MIR6758-201ENST00000620653 63 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
PRPF4BQ13523 AC067852.7-201ENST00000623270 535 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
PRPF4BQ13523 SATB1-AS1-237ENST00000626982 735 ntTSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
PRPF4BQ13523 OR4A15-202ENST00000641526 945 ntAPPRIS P1 BASIC4.91□□□□□ -1.62
PRPF4BQ13523 EOGT-210ENST00000615922 1931 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
PRPF4BQ13523 KC6-201ENST00000592302 1713 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
PRPF4BQ13523 FSBP-203ENST00000611249 2181 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
PRPF4BQ13523 APC-207ENST00000508376 10619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
PRPF4BQ13523 AL365214.2-201ENST00000433684 1365 ntTSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
PRPF4BQ13523 AP5M1-201ENST00000261558 11737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
PRPF4BQ13523 RBMS1-202ENST00000392753 3781 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.62
PRPF4BQ13523 ARHGAP21-218ENST00000636789 4210 ntTSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.62
PRPF4BQ13523 THOC2-202ENST00000355725 4930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.62
PRPF4BQ13523 AJ009632.2-204ENST00000635621 1401 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.62
PRPF4BQ13523 AL133412.1-201ENST00000380194 2992 ntBASIC4.9□□□□□ -1.62
PRPF4BQ13523 UGT2B7-201ENST00000305231 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
PRPF4BQ13523 NABP1-205ENST00000425611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
PRPF4BQ13523 AC139769.1-204ENST00000472297 1931 ntBASIC4.9□□□□□ -1.62
PRPF4BQ13523 MPDZ-215ENST00000541718 7603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
PRPF4BQ13523 DTNA-203ENST00000315456 1706 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.62
PRPF4BQ13523 C2orf76-201ENST00000334816 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
PRPF4BQ13523 IL1RAPL2-201ENST00000344799 1290 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
PRPF4BQ13523 IL6STP1-201ENST00000346911 1020 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
PRPF4BQ13523 LINC01967-201ENST00000356047 755 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
PRPF4BQ13523 RNA5SP27-201ENST00000363839 119 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
PRPF4BQ13523 RNU1-130P-201ENST00000363930 160 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
PRPF4BQ13523 SPINK13-201ENST00000398450 509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
PRPF4BQ13523 CEACAMP8-201ENST00000413902 580 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
PRPF4BQ13523 AC009237.10-201ENST00000414112 510 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
PRPF4BQ13523 UBE2V1P6-201ENST00000430840 422 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
PRPF4BQ13523 AC015971.1-202ENST00000439077 514 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
PRPF4BQ13523 MOB1AP2-201ENST00000446060 614 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
PRPF4BQ13523 AC068135.1-201ENST00000446164 246 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
PRPF4BQ13523 RPL37P3-201ENST00000456825 293 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
PRPF4BQ13523 ATP5G1P3-201ENST00000463301 410 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
PRPF4BQ13523 RPS27AP17-201ENST00000463344 455 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
PRPF4BQ13523 AC092905.1-201ENST00000467527 949 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
PRPF4BQ13523 RPL23AP71-201ENST00000470966 469 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
PRPF4BQ13523 RN7SL860P-201ENST00000473738 223 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
PRPF4BQ13523 TRBV8-2-201ENST00000475637 270 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
PRPF4BQ13523 TFEC-208ENST00000484212 1245 ntTSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.63
PRPF4BQ13523 MTND1P36-201ENST00000522384 936 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
PRPF4BQ13523 AC104248.1-202ENST00000524134 486 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
PRPF4BQ13523 OR8G5-201ENST00000524943 1041 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
PRPF4BQ13523 LINC02326-201ENST00000552028 540 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
PRPF4BQ13523 OR4U1P-201ENST00000554958 912 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
PRPF4BQ13523 AC084757.1-201ENST00000559987 490 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
PRPF4BQ13523 AC007496.1-201ENST00000565641 739 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
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