Protein–RNA interactions for Protein: Q13472

TOP3A, DNA topoisomerase 3-alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3AQ13472 LSM3P2-201ENST00000551246 273 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
TOP3AQ13472 AC004217.3-201ENST00000551552 878 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
TOP3AQ13472 AL358333.1-201ENST00000555115 467 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
TOP3AQ13472 MIR3154-201ENST00000577829 84 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
TOP3AQ13472 AC024267.4-202ENST00000582631 436 ntTSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
TOP3AQ13472 APOC2-205ENST00000592257 444 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
TOP3AQ13472 AC068768.2-201ENST00000602352 343 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
TOP3AQ13472 AL355512.1-201ENST00000609514 488 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
TOP3AQ13472 AC055764.2-201ENST00000610089 670 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
TOP3AQ13472 AC079395.2-201ENST00000610982 737 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
TOP3AQ13472 CCL23-201ENST00000612516 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
TOP3AQ13472 OR8G7P-201ENST00000616658 848 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
TOP3AQ13472 AL158209.2-201ENST00000619266 216 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
TOP3AQ13472 AC120349.2-201ENST00000625002 298 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
TOP3AQ13472 MIR3688-2-201ENST00000636963 87 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
TOP3AQ13472 TAX1BP1-203ENST00000409980 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
TOP3AQ13472 CYP1D1P-201ENST00000416662 1433 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
TOP3AQ13472 GLRA2-202ENST00000355020 1730 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
TOP3AQ13472 MROH9-202ENST00000367759 3165 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
TOP3AQ13472 ELF1-204ENST00000625359 2032 ntTSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
TOP3AQ13472 ZNF37BP-203ENST00000452306 1352 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
TOP3AQ13472 ZNF780A-204ENST00000455521 3600 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
TOP3AQ13472 AC138409.2-201ENST00000514048 5001 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
TOP3AQ13472 TEX9-209ENST00000561221 2297 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
TOP3AQ13472 DCAF13P1-201ENST00000495256 1330 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
TOP3AQ13472 IPCEF1-210ENST00000519344 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
TOP3AQ13472 USP28-213ENST00000544967 3498 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
TOP3AQ13472 AC018557.1-201ENST00000569274 1790 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
TOP3AQ13472 KLHL13-206ENST00000469946 2353 ntTSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
TOP3AQ13472 PCDH15-215ENST00000409834 5401 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
TOP3AQ13472 PRR4-201ENST00000228811 563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
TOP3AQ13472 PRIM2-201ENST00000274891 864 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
TOP3AQ13472 BCLAF1-201ENST00000353331 7110 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
TOP3AQ13472 AL121886.1-201ENST00000358609 435 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
TOP3AQ13472 Y_RNA.9-201ENST00000362354 101 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
TOP3AQ13472 TAS2R19-201ENST00000390673 1002 ntAPPRIS P1 BASIC5.27□□□□□ -1.57
TOP3AQ13472 OR5H8-201ENST00000394191 1045 ntAPPRIS P1 BASIC5.27□□□□□ -1.57
TOP3AQ13472 AL590290.1-201ENST00000405336 380 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
TOP3AQ13472 AL136131.1-201ENST00000406079 803 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
TOP3AQ13472 RN7SKP86-201ENST00000410454 332 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
TOP3AQ13472 RNU6-248P-201ENST00000410720 107 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
TOP3AQ13472 GAS5-202ENST00000414075 413 ntTSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
TOP3AQ13472 TMEM196-203ENST00000422233 775 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
TOP3AQ13472 AC068599.1-201ENST00000422558 567 ntTSL 4 BASIC5.27□□□□□ -1.57
TOP3AQ13472 LINC01731-201ENST00000428035 420 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
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TOP3AQ13472 ENOX1-AS2-201ENST00000434273 609 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
TOP3AQ13472 RPS12P17-201ENST00000438591 377 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
TOP3AQ13472 FAM170B-AS1-203ENST00000442525 2000 ntTSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
TOP3AQ13472 AC023141.8-201ENST00000442554 208 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
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TOP3AQ13472 LINC02215-201ENST00000503320 543 ntTSL 4 BASIC5.27□□□□□ -1.57
TOP3AQ13472 AC022272.1-201ENST00000503478 777 ntTSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
TOP3AQ13472 AC017091.1-202ENST00000510941 504 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
TOP3AQ13472 AC091133.4-201ENST00000511142 308 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
TOP3AQ13472 ARL2BPP6-201ENST00000512757 439 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
TOP3AQ13472 IGHVIII-76-1-201ENST00000523776 286 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
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TOP3AQ13472 AC069208.1-201ENST00000540811 676 ntTSL 4 BASIC5.27□□□□□ -1.57
TOP3AQ13472 PRR4-212ENST00000544994 326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
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TOP3AQ13472 U95743.1-201ENST00000573369 1001 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
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TOP3AQ13472 MIR7973-1-201ENST00000614683 76 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
TOP3AQ13472 MALAT1-210ENST00000617489 318 ntTSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
TOP3AQ13472 AC006338.1-201ENST00000618453 749 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
TOP3AQ13472 AC099654.5-201ENST00000636479 350 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
TOP3AQ13472 AC099654.10-201ENST00000640395 161 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
TOP3AQ13472 A1CF-207ENST00000395495 9400 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
TOP3AQ13472 TNFSF4-202ENST00000367718 3429 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
TOP3AQ13472 LIMA1-215ENST00000552823 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
TOP3AQ13472 AC003973.3-201ENST00000624863 2822 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
TOP3AQ13472 SULT1C2-205ENST00000437390 1359 ntTSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
TOP3AQ13472 AC079097.1-201ENST00000512187 1399 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
TOP3AQ13472 OR8J3-204ENST00000642058 3806 ntAPPRIS P1 BASIC5.27□□□□□ -1.57
TOP3AQ13472 FOXP1-IT1-201ENST00000498714 3539 ntTSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
TOP3AQ13472 AC006206.1-201ENST00000544842 3387 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
TOP3AQ13472 ADAM29-203ENST00000445694 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
TOP3AQ13472 RALGAPA1-204ENST00000553892 6271 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
TOP3AQ13472 GSTM2-206ENST00000442650 1478 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
TOP3AQ13472 PLEKHS1-204ENST00000369310 2046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
TOP3AQ13472 FCHSD2-205ENST00000409853 1867 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
TOP3AQ13472 PCDH15-201ENST00000320301 6845 ntTSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
TOP3AQ13472 NOSTRIN-206ENST00000444448 2537 ntTSL 5 BASIC5.26□□□□□ -1.57
TOP3AQ13472 PDE10A-203ENST00000539869 4401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.26□□□□□ -1.57
TOP3AQ13472 OR6B1-202ENST00000641698 5153 ntAPPRIS P1 BASIC5.26□□□□□ -1.57
TOP3AQ13472 SELENOWP1-201ENST00000322792 252 ntBASIC5.26□□□□□ -1.57
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