Protein–RNA interactions for Protein: Q13326

SGCG, Gamma-sarcoglycan, humanhuman

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Length 291 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCGQ13326 ARID2-205ENST00000444670 7316 ntTSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
SGCGQ13326 ATP2C1-205ENST00000504381 3498 ntTSL 2 BASIC4.47□□□□□ -1.69
SGCGQ13326 OR8D1-202ENST00000641015 8286 ntAPPRIS P1 BASIC4.47□□□□□ -1.69
SGCGQ13326 OR8D1-203ENST00000641897 8285 ntAPPRIS P1 BASIC4.47□□□□□ -1.69
SGCGQ13326 MTND4P31-201ENST00000425607 1343 ntBASIC4.46□□□□□ -1.69
SGCGQ13326 DTNA-203ENST00000315456 1706 ntTSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.69
SGCGQ13326 CRISP1-202ENST00000335847 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.69
SGCGQ13326 MED12L-201ENST00000273432 6401 ntTSL 2 BASIC4.46□□□□□ -1.69
SGCGQ13326 PCDH15-212ENST00000395442 2970 ntTSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
SGCGQ13326 AC026951.1-201ENST00000559530 2459 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
SGCGQ13326 USH2A-202ENST00000366942 6320 ntTSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
SGCGQ13326 EIF2AP4-201ENST00000424793 1781 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
SGCGQ13326 AC006148.1-201ENST00000484322 4310 ntTSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
SGCGQ13326 RNA5SP502-201ENST00000362694 119 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
SGCGQ13326 U3.15-201ENST00000365398 212 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
SGCGQ13326 AC068538.1-201ENST00000376856 336 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
SGCGQ13326 ESCO2-202ENST00000397418 720 ntTSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
SGCGQ13326 VN1R42P-201ENST00000424651 344 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
SGCGQ13326 RPL23AP25-201ENST00000430973 463 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
SGCGQ13326 AL512637.2-201ENST00000431287 1256 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
SGCGQ13326 AL591178.1-201ENST00000439239 454 ntTSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
SGCGQ13326 RPS26P2-201ENST00000440331 348 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
SGCGQ13326 RPL7P33-201ENST00000444159 742 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
SGCGQ13326 RN7SL98P-201ENST00000462271 300 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
SGCGQ13326 AC053481.1-201ENST00000467217 306 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
SGCGQ13326 AC010618.1-201ENST00000469924 477 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
SGCGQ13326 AC022795.1-201ENST00000473808 480 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
SGCGQ13326 AC139718.2-201ENST00000506068 481 ntTSL 3 BASIC4.46□□□□□ -1.7
SGCGQ13326 AC025674.1-201ENST00000507074 324 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
SGCGQ13326 IGBP1P5-201ENST00000507524 1000 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
SGCGQ13326 CSN1S1-203ENST00000507763 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
SGCGQ13326 LINC01088-205ENST00000509088 756 ntTSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
SGCGQ13326 RNA5SP464-201ENST00000516251 108 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
SGCGQ13326 C8orf22-204ENST00000522267 739 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC4.46□□□□□ -1.7
SGCGQ13326 AC138701.1-201ENST00000524329 714 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
SGCGQ13326 AP003102.1-201ENST00000525638 661 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
SGCGQ13326 C1DP5-201ENST00000525775 383 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
SGCGQ13326 AP003557.1-202ENST00000528978 562 ntTSL 4 BASIC4.46□□□□□ -1.7
SGCGQ13326 TOMM20P2-201ENST00000540082 421 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
SGCGQ13326 AC087897.2-201ENST00000552639 678 ntTSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
SGCGQ13326 LINC00644-201ENST00000555156 295 ntTSL 2 BASIC4.46□□□□□ -1.7
SGCGQ13326 AL359237.1-202ENST00000556168 487 ntTSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
SGCGQ13326 AC015912.2-201ENST00000571053 181 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
SGCGQ13326 AC136624.4-201ENST00000573044 370 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
SGCGQ13326 AC129510.2-201ENST00000582774 345 ntTSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
SGCGQ13326 KPNA2P3-201ENST00000584190 848 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
SGCGQ13326 IPO5P1-202ENST00000600039 287 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
SGCGQ13326 AL590392.1-201ENST00000604960 446 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
SGCGQ13326 AC026741.1-201ENST00000605892 482 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
SGCGQ13326 AC005962.2-201ENST00000611427 652 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
SGCGQ13326 AP004607.9-201ENST00000618202 316 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
SGCGQ13326 AC004943.3-201ENST00000624116 600 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
SGCGQ13326 EXTL2-201ENST00000370113 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
SGCGQ13326 PLAG1-201ENST00000316981 7322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
SGCGQ13326 PPP1R9A-205ENST00000424654 4058 ntTSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
SGCGQ13326 ASB5-201ENST00000296525 3031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
SGCGQ13326 C12orf45-204ENST00000552951 23529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
SGCGQ13326 AC092821.1-204ENST00000518709 3552 ntTSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
SGCGQ13326 ZNF90P1-201ENST00000480493 1951 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
SGCGQ13326 NUDT12-202ENST00000507423 1781 ntTSL 2 BASIC4.45□□□□□ -1.7
SGCGQ13326 ZSCAN26-204ENST00000614088 2321 ntTSL 3 BASIC4.45□□□□□ -1.7
SGCGQ13326 SCN1A-210ENST00000635776 10107 ntTSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
SGCGQ13326 OR6K3-201ENST00000368145 1844 ntAPPRIS P1 BASIC4.45□□□□□ -1.7
SGCGQ13326 RAG2-209ENST00000618712 2818 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.45□□□□□ -1.7
SGCGQ13326 OR5P1P-201ENST00000299512 925 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
SGCGQ13326 FAM3C2-201ENST00000312214 681 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
SGCGQ13326 RNU1-83P-201ENST00000363426 164 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
SGCGQ13326 C1orf105-201ENST00000367725 888 ntTSL 2 BASIC4.45□□□□□ -1.7
SGCGQ13326 STON1-GTF2A1L-204ENST00000405008 3821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
SGCGQ13326 ATF1P1-201ENST00000406040 927 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
SGCGQ13326 AC069282.1-201ENST00000411911 526 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
SGCGQ13326 AL158825.1-201ENST00000414735 521 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
SGCGQ13326 AL078581.1-201ENST00000419134 340 ntTSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
SGCGQ13326 AL360093.1-201ENST00000420237 1126 ntTSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
SGCGQ13326 AL157378.1-201ENST00000424506 265 ntTSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
SGCGQ13326 LINC01473-202ENST00000427108 695 ntTSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
SGCGQ13326 LINC00266-4P-201ENST00000427373 842 ntTSL 3 BASIC4.45□□□□□ -1.7
SGCGQ13326 RPL34P6-201ENST00000432390 345 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
SGCGQ13326 MOB1AP2-201ENST00000446060 614 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
SGCGQ13326 RNA5SP103-201ENST00000459503 118 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
SGCGQ13326 AC006148.2-201ENST00000467017 650 ntTSL 2 BASIC4.45□□□□□ -1.7
SGCGQ13326 IGKV2-30-201ENST00000468494 390 ntAPPRIS P1 BASIC4.45□□□□□ -1.7
SGCGQ13326 AC133963.2-201ENST00000513686 578 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
SGCGQ13326 MAL2-205ENST00000521048 575 ntTSL 4 BASIC4.45□□□□□ -1.7
SGCGQ13326 PARPBP-212ENST00000543784 992 ntTSL 2 BASIC4.45□□□□□ -1.7
SGCGQ13326 AL355922.5-201ENST00000553534 351 ntTSL 3 BASIC4.45□□□□□ -1.7
SGCGQ13326 OR4U1P-201ENST00000554958 912 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
SGCGQ13326 AL356022.1-202ENST00000555433 379 ntTSL 2 BASIC4.45□□□□□ -1.7
SGCGQ13326 GLRXP2-201ENST00000555594 321 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
SGCGQ13326 CSNK1A1P1-202ENST00000563423 981 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
SGCGQ13326 MIR3939-201ENST00000582614 106 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
SGCGQ13326 LINC01791-201ENST00000589511 677 ntTSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
SGCGQ13326 LINC01539-206ENST00000593282 678 ntTSL 4 BASIC4.45□□□□□ -1.7
SGCGQ13326 OR7A5-202ENST00000594432 1029 ntAPPRIS P1 BASIC4.45□□□□□ -1.7
SGCGQ13326 DNAJC19P3-201ENST00000594491 331 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
SGCGQ13326 BNIP3P31-201ENST00000604515 566 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
SGCGQ13326 STARD13-AS-235ENST00000609335 855 ntTSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
SGCGQ13326 AP001033.2-201ENST00000609701 1003 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
SGCGQ13326 MIR6716-201ENST00000613413 80 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
SGCGQ13326 AC114781.5-201ENST00000615297 108 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
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