Protein–RNA interactions for Protein: Q13232

NME3, Nucleoside diphosphate kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME3Q13232 GABRA2-202ENST00000381620 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
NME3Q13232 AC021086.1-201ENST00000499025 1569 ntTSL 3 BASIC4.35□□□□□ -1.71
NME3Q13232 STON1-GTF2A1L-203ENST00000402114 3790 ntTSL 2 BASIC4.35□□□□□ -1.71
NME3Q13232 DLG1-217ENST00000452595 3053 ntTSL 2 BASIC4.35□□□□□ -1.71
NME3Q13232 AC007681.1-201ENST00000604271 3438 ntTSL 4 BASIC4.34□□□□□ -1.71
NME3Q13232 MBNL1-224ENST00000545754 5147 ntTSL 5 BASIC4.34□□□□□ -1.71
NME3Q13232 LRRC63-203ENST00000595396 2327 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.34□□□□□ -1.71
NME3Q13232 F8-202ENST00000360256 9059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
NME3Q13232 IQGAP2-203ENST00000396234 3376 ntTSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
NME3Q13232 SNORA62.2-201ENST00000364672 152 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
NME3Q13232 AC068538.1-201ENST00000376856 336 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
NME3Q13232 SEC61A2-203ENST00000379017 600 ntTSL 5 BASIC4.34□□□□□ -1.71
NME3Q13232 AC013404.1-201ENST00000413068 249 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
NME3Q13232 AC004552.1-201ENST00000419089 348 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
NME3Q13232 BX119904.1-201ENST00000432026 348 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
NME3Q13232 HLA-N-201ENST00000437516 135 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
NME3Q13232 AC092013.1-201ENST00000438795 332 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
NME3Q13232 LARS2-AS1-201ENST00000442534 575 ntTSL 4 BASIC4.34□□□□□ -1.71
NME3Q13232 LINC01034-201ENST00000448806 277 ntTSL 3 BASIC4.34□□□□□ -1.71
NME3Q13232 RPL23AP12-201ENST00000467573 473 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
NME3Q13232 RPS26P3-201ENST00000470205 348 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
NME3Q13232 RPL29-203ENST00000475248 551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.34□□□□□ -1.71
NME3Q13232 SYT14P1-201ENST00000481459 721 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
NME3Q13232 AC090543.2-201ENST00000483963 348 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
NME3Q13232 AC004057.1-201ENST00000485827 348 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
NME3Q13232 SETP12-201ENST00000514068 805 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
NME3Q13232 MYLK-AS2-202ENST00000515464 754 ntTSL 2 BASIC4.34□□□□□ -1.71
NME3Q13232 KIRREL3-AS2-201ENST00000532988 492 ntTSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
NME3Q13232 AC103681.1-202ENST00000534342 449 ntTSL 3 BASIC4.34□□□□□ -1.71
NME3Q13232 FAXC-204ENST00000538471 941 ntTSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
NME3Q13232 LINC00520-201ENST00000554186 831 ntTSL 5 BASIC4.34□□□□□ -1.71
NME3Q13232 CYP4A43P-201ENST00000568156 121 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
NME3Q13232 TTN-AS1-217ENST00000585625 945 ntTSL 5 BASIC4.34□□□□□ -1.71
NME3Q13232 AC116447.1-201ENST00000613153 453 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
NME3Q13232 AC139769.3-201ENST00000618383 175 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
NME3Q13232 CCL14-203ENST00000620991 426 ntTSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
NME3Q13232 COA1-220ENST00000640232 192 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.34□□□□□ -1.71
NME3Q13232 AFTPH-205ENST00000422803 1525 ntTSL 5 BASIC4.34□□□□□ -1.71
NME3Q13232 MTX3-203ENST00000512560 4799 ntTSL 2 BASIC4.34□□□□□ -1.71
NME3Q13232 AC096751.1-201ENST00000515178 2202 ntTSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.72
NME3Q13232 AC018529.3-201ENST00000624212 2254 ntBASIC4.34□□□□□ -1.72
NME3Q13232 SENP7-202ENST00000348610 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.72
NME3Q13232 SLC17A4-203ENST00000439485 3699 ntTSL 5 BASIC4.34□□□□□ -1.72
NME3Q13232 USP34-201ENST00000398571 11357 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.34□□□□□ -1.72
NME3Q13232 MAP3K21-201ENST00000366622 4005 ntTSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.72
NME3Q13232 GPR180-201ENST00000376958 8822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.72
NME3Q13232 ADGRL3-216ENST00000514157 4789 ntTSL 5 BASIC4.33□□□□□ -1.72
NME3Q13232 PRKACB-202ENST00000370682 4288 ntTSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
NME3Q13232 N4BP2L2-202ENST00000357505 2917 ntTSL 2 BASIC4.33□□□□□ -1.72
NME3Q13232 OR9H1P-201ENST00000446393 4888 ntAPPRIS P1 BASIC4.33□□□□□ -1.72
NME3Q13232 PLCZ1-206ENST00000538330 1612 ntTSL 2 BASIC4.33□□□□□ -1.72
NME3Q13232 AC092162.3-201ENST00000624511 1624 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
NME3Q13232 MTUS1-216ENST00000519263 4089 ntTSL 2 BASIC4.33□□□□□ -1.72
NME3Q13232 SPINK9-201ENST00000377906 453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
NME3Q13232 MIR93-201ENST00000385024 80 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
NME3Q13232 MIR513A2-201ENST00000385249 127 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
NME3Q13232 TRAV9-2-201ENST00000390441 394 ntAPPRIS P1 BASIC4.33□□□□□ -1.72
NME3Q13232 TAF9BP2-201ENST00000400856 499 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
NME3Q13232 AC112721.2-201ENST00000409910 541 ntTSL 4 BASIC4.33□□□□□ -1.72
NME3Q13232 SLC8A1-AS1-201ENST00000413479 800 ntTSL 5 BASIC4.33□□□□□ -1.72
NME3Q13232 LINC01881-201ENST00000416103 412 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
NME3Q13232 MTCO3P4-201ENST00000419236 787 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
NME3Q13232 AC092484.1-201ENST00000420548 833 ntTSL 5 BASIC4.33□□□□□ -1.72
NME3Q13232 DYNLL1P7-201ENST00000429273 258 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
NME3Q13232 AL358972.1-201ENST00000434356 466 ntTSL 2 BASIC4.33□□□□□ -1.72
NME3Q13232 AC006037.1-201ENST00000437967 287 ntTSL 5 BASIC4.33□□□□□ -1.72
NME3Q13232 MTND6P18-201ENST00000439477 513 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
NME3Q13232 AC016903.1-201ENST00000444017 588 ntTSL 4 BASIC4.33□□□□□ -1.72
NME3Q13232 RPL34P26-201ENST00000445636 354 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
NME3Q13232 AC010235.1-201ENST00000450613 547 ntTSL 3 BASIC4.33□□□□□ -1.72
NME3Q13232 RPS27AP13-201ENST00000498403 237 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
NME3Q13232 AC095056.1-201ENST00000503918 425 ntTSL 3 BASIC4.33□□□□□ -1.72
NME3Q13232 LINC01017-201ENST00000508823 768 ntTSL 3 BASIC4.33□□□□□ -1.72
NME3Q13232 AC021192.1-201ENST00000510169 791 ntTSL 3 BASIC4.33□□□□□ -1.72
NME3Q13232 SNORA31.13-201ENST00000516624 135 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
NME3Q13232 LINC01603-201ENST00000517343 1134 ntTSL 2 BASIC4.33□□□□□ -1.72
NME3Q13232 AC079209.2-201ENST00000519107 431 ntTSL 3 BASIC4.33□□□□□ -1.72
NME3Q13232 C11orf65-206ENST00000529391 973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.33□□□□□ -1.72
NME3Q13232 NR1H4-204ENST00000546380 565 ntTSL 3 BASIC4.33□□□□□ -1.72
NME3Q13232 LINC02394-201ENST00000549140 543 ntTSL 4 BASIC4.33□□□□□ -1.72
NME3Q13232 AC107032.2-201ENST00000551082 386 ntTSL 3 BASIC4.33□□□□□ -1.72
NME3Q13232 ZFAND6-204ENST00000558087 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.33□□□□□ -1.72
NME3Q13232 LINC00557-201ENST00000563184 1279 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
NME3Q13232 AC011524.1-201ENST00000590167 240 ntTSL 3 BASIC4.33□□□□□ -1.72
NME3Q13232 AL590392.1-201ENST00000604960 446 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
NME3Q13232 AC064801.1-201ENST00000612025 407 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
NME3Q13232 AC123768.3-201ENST00000613733 523 ntTSL 3 BASIC4.33□□□□□ -1.72
NME3Q13232 AL023881.1-201ENST00000621088 301 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
NME3Q13232 MIR6810-201ENST00000622701 70 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
NME3Q13232 AC091948.2-201ENST00000636510 279 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
NME3Q13232 OR8B2-202ENST00000641451 1056 ntAPPRIS P1 BASIC4.33□□□□□ -1.72
NME3Q13232 OR10K1-203ENST00000641432 3775 ntAPPRIS P1 BASIC4.33□□□□□ -1.72
NME3Q13232 RANBP2-201ENST00000283195 11711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
NME3Q13232 CCDC91-201ENST00000381259 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
NME3Q13232 GABRG2-210ENST00000638772 7669 ntTSL 5 BASIC4.33□□□□□ -1.72
NME3Q13232 ANKRD36C-202ENST00000456556 5428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.32□□□□□ -1.72
NME3Q13232 CCDC102B-201ENST00000360242 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
NME3Q13232 FAN1-202ENST00000561594 2738 ntTSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
NME3Q13232 TMEM30A-202ENST00000370050 3775 ntTSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
NME3Q13232 UBA6-201ENST00000322244 9564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.4 ms