Protein–RNA interactions for Protein: Q13115

DUSP4, Dual specificity protein phosphatase 4, humanhuman

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP4Q13115 COPS8P2-201ENST00000473228 627 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
DUSP4Q13115 RN7SL799P-201ENST00000475891 298 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
DUSP4Q13115 RPL7P24-201ENST00000493052 752 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
DUSP4Q13115 AC008517.1-201ENST00000502383 585 ntTSL 4 BASIC5.92□□□□□ -1.46
DUSP4Q13115 PTGES3P3-201ENST00000511479 482 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
DUSP4Q13115 AC006296.1-201ENST00000514401 591 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
DUSP4Q13115 AF117829.1-203ENST00000520306 421 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
DUSP4Q13115 AP005639.2-201ENST00000527592 928 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
DUSP4Q13115 TAS2R46-201ENST00000533467 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.92□□□□□ -1.46
DUSP4Q13115 AC009039.1-201ENST00000568711 471 ntTSL 4 BASIC5.92□□□□□ -1.46
DUSP4Q13115 AL163952.1-202ENST00000569625 600 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
DUSP4Q13115 BPTFP1-201ENST00000579209 492 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
DUSP4Q13115 MIR4311-201ENST00000580794 100 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
DUSP4Q13115 AC022098.3-201ENST00000590715 315 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
DUSP4Q13115 AC063944.1-210ENST00000593837 519 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
DUSP4Q13115 AC012616.1-201ENST00000600294 197 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
DUSP4Q13115 AC073254.1-207ENST00000600482 714 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
DUSP4Q13115 AC233280.2-201ENST00000603917 1070 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
DUSP4Q13115 AL133481.2-203ENST00000607558 139 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
DUSP4Q13115 AL354760.1-201ENST00000608357 643 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
DUSP4Q13115 IL33-205ENST00000611532 757 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
DUSP4Q13115 AC025574.2-201ENST00000615621 514 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
DUSP4Q13115 MIR6837-201ENST00000620884 64 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
DUSP4Q13115 AP002505.2-201ENST00000623585 696 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
DUSP4Q13115 AC120349.2-201ENST00000625002 298 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
DUSP4Q13115 CCT5-215ENST00000625723 135 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
DUSP4Q13115 MIR6863-201ENST00000636112 90 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
DUSP4Q13115 CASP1-208ENST00000527979 1521 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
DUSP4Q13115 DSC2-201ENST00000251081 4826 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
DUSP4Q13115 PTPRT-201ENST00000356100 12480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
DUSP4Q13115 PTPRT-202ENST00000373184 12483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
DUSP4Q13115 PTPRT-203ENST00000373187 12453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
DUSP4Q13115 PUM2-202ENST00000338086 6112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
DUSP4Q13115 ESRRG-224ENST00000616180 5194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
DUSP4Q13115 LRRC49-201ENST00000260382 2784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
DUSP4Q13115 AC011933.2-201ENST00000578539 2790 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
DUSP4Q13115 GVINP1-201ENST00000526769 8438 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
DUSP4Q13115 AMY1C-201ENST00000370079 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
DUSP4Q13115 RAPGEF4-203ENST00000397087 4120 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
DUSP4Q13115 CLVS1-203ENST00000518592 2880 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
DUSP4Q13115 RNF20-202ENST00000389120 3940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
DUSP4Q13115 INPP4B-214ENST00000508116 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
DUSP4Q13115 ENPP2-208ENST00000522826 2667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
DUSP4Q13115 ENPP2-201ENST00000075322 2651 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
DUSP4Q13115 LCA5L-201ENST00000288350 2416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
DUSP4Q13115 NXF3-201ENST00000395065 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
DUSP4Q13115 CCT8P1-201ENST00000413611 1657 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
DUSP4Q13115 KRT222-202ENST00000394052 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
DUSP4Q13115 CHST9-203ENST00000618847 11388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
DUSP4Q13115 SENP7-204ENST00000394085 1483 ntTSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
DUSP4Q13115 AL592429.1-201ENST00000403909 1473 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
DUSP4Q13115 LINC02261-201ENST00000512873 2802 ntTSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
DUSP4Q13115 PCDH18-202ENST00000412923 5102 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
DUSP4Q13115 ZNF227-208ENST00000589005 2943 ntTSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
DUSP4Q13115 STARD6-201ENST00000307844 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
DUSP4Q13115 GAPDHP24-201ENST00000328713 983 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
DUSP4Q13115 IL1RAPL2-201ENST00000344799 1290 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
DUSP4Q13115 U3.7-201ENST00000363668 216 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
DUSP4Q13115 DEC1-201ENST00000374016 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
DUSP4Q13115 TXNDC8-202ENST00000374510 455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
DUSP4Q13115 DEFB125-201ENST00000382410 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
DUSP4Q13115 RNU6-98P-201ENST00000384173 107 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
DUSP4Q13115 SNORA11C-201ENST00000408532 129 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
DUSP4Q13115 AP000534.2-201ENST00000412729 568 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
DUSP4Q13115 AC007463.1-201ENST00000416534 734 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
DUSP4Q13115 AC009158.1-206ENST00000417476 454 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
DUSP4Q13115 PLCE1-AS2-201ENST00000419353 459 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
DUSP4Q13115 AL162726.4-201ENST00000422010 673 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
DUSP4Q13115 AL389915.1-201ENST00000422463 466 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
DUSP4Q13115 AL009174.1-201ENST00000426577 416 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
DUSP4Q13115 Z93242.1-201ENST00000427102 353 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
DUSP4Q13115 AL512649.1-201ENST00000428997 581 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
DUSP4Q13115 AC073464.1-201ENST00000429823 534 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
DUSP4Q13115 AC007556.1-201ENST00000432133 307 ntTSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
DUSP4Q13115 OR6D1P-201ENST00000436165 939 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
DUSP4Q13115 CACYBPP1-201ENST00000438592 684 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
DUSP4Q13115 AP1S3-208ENST00000446015 499 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.91□□□□□ -1.46
DUSP4Q13115 AC068707.1-201ENST00000451438 391 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
DUSP4Q13115 AC079896.1-201ENST00000455845 488 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
DUSP4Q13115 SNRPCP3-201ENST00000474888 476 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
DUSP4Q13115 SNX5P1-201ENST00000505757 1041 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
DUSP4Q13115 ARL4AP2-201ENST00000507378 601 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
DUSP4Q13115 RPS3A-210ENST00000512690 845 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
DUSP4Q13115 AC091435.2-201ENST00000514586 565 ntTSL 4 BASIC5.91□□□□□ -1.46
DUSP4Q13115 RN7SKP99-201ENST00000517028 307 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
DUSP4Q13115 OSBPL9P2-201ENST00000526582 1228 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
DUSP4Q13115 AP001972.1-201ENST00000529215 506 ntTSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
DUSP4Q13115 AC087276.1-201ENST00000529659 480 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
DUSP4Q13115 OR4A45P-201ENST00000529954 901 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
DUSP4Q13115 RRAS2-210ENST00000534746 993 ntTSL 2 BASIC5.91□□□□□ -1.46
DUSP4Q13115 HNF1A-AS1-203ENST00000537361 659 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
DUSP4Q13115 AK6P1-201ENST00000540219 478 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
DUSP4Q13115 AC008083.2-201ENST00000546707 476 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
DUSP4Q13115 LINC01580-201ENST00000555255 561 ntTSL 4 BASIC5.91□□□□□ -1.46
DUSP4Q13115 AL137129.1-201ENST00000555937 720 ntTSL 4 BASIC5.91□□□□□ -1.46
DUSP4Q13115 AP005242.1-201ENST00000583946 467 ntTSL 3 BASIC5.91□□□□□ -1.46
DUSP4Q13115 AL118522.2-201ENST00000616045 615 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
DUSP4Q13115 FER-210ENST00000628534 558 ntTSL 5 BASIC5.91□□□□□ -1.46
DUSP4Q13115 OR2AT4-202ENST00000641504 8661 ntAPPRIS P1 BASIC5.91□□□□□ -1.46
DUSP4Q13115 AC087516.1-201ENST00000561236 2428 ntBASIC5.91□□□□□ -1.46
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