Protein–RNA interactions for Protein: Q13111

CHAF1A, Chromatin assembly factor 1 subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1AQ13111 AC115085.1-201ENST00000588924 229 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
CHAF1AQ13111 LINC01791-201ENST00000589511 677 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
CHAF1AQ13111 IGKV2OR2-2-201ENST00000605025 300 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
CHAF1AQ13111 AL356218.2-201ENST00000605264 187 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
CHAF1AQ13111 AC010998.2-201ENST00000605549 625 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
CHAF1AQ13111 AC123768.3-201ENST00000613733 523 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
CHAF1AQ13111 UBE2NL-201ENST00000618570 1185 ntAPPRIS P1 BASIC5.67□□□□□ -1.5
CHAF1AQ13111 CDRT1-208ENST00000630868 794 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
CHAF1AQ13111 AC099654.8-201ENST00000637757 681 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
CHAF1AQ13111 OR2L1P-202ENST00000641567 1023 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
CHAF1AQ13111 OR52H1-202ENST00000641796 1061 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
CHAF1AQ13111 ZNF137P-201ENST00000456718 1920 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
CHAF1AQ13111 OR14L1P-202ENST00000641545 3009 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
CHAF1AQ13111 R3HDM1-203ENST00000409606 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
CHAF1AQ13111 PPP1R9A-201ENST00000289495 3983 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
CHAF1AQ13111 CYP19A1-201ENST00000396402 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
CHAF1AQ13111 BTAF1-204ENST00000544642 6938 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
CHAF1AQ13111 ALB-201ENST00000295897 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
CHAF1AQ13111 AC092162.3-201ENST00000624511 1624 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
CHAF1AQ13111 PUS7L-203ENST00000431332 1873 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
CHAF1AQ13111 CTXN2-201ENST00000417307 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
CHAF1AQ13111 OR10K1-203ENST00000641432 3775 ntAPPRIS P1 BASIC5.66□□□□□ -1.5
CHAF1AQ13111 AKAP11-201ENST00000025301 9920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
CHAF1AQ13111 VPS13C-201ENST00000249837 13300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
CHAF1AQ13111 RAD17P1-201ENST00000418130 2042 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
CHAF1AQ13111 API5-210ENST00000534600 1760 ntTSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
CHAF1AQ13111 IL6STP1-201ENST00000346911 1020 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
CHAF1AQ13111 SIRPD-201ENST00000381621 823 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
CHAF1AQ13111 GUCA1C-202ENST00000393963 900 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
CHAF1AQ13111 AL049693.1-201ENST00000402760 611 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
CHAF1AQ13111 RNU4-25P-201ENST00000410569 230 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
CHAF1AQ13111 LINC00867-202ENST00000415417 488 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
CHAF1AQ13111 AC246680.2-201ENST00000422106 389 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
CHAF1AQ13111 AL592293.2-201ENST00000422292 996 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
CHAF1AQ13111 AL139824.1-201ENST00000431983 453 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
CHAF1AQ13111 AC009226.1-201ENST00000432413 539 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
CHAF1AQ13111 AL353597.2-202ENST00000434901 373 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
CHAF1AQ13111 LIX1L-AS1-205ENST00000437797 536 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
CHAF1AQ13111 AP000943.1-201ENST00000438416 712 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
CHAF1AQ13111 CBX1P1-201ENST00000440184 427 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
CHAF1AQ13111 LINC00366-201ENST00000441430 435 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
CHAF1AQ13111 ARL4AP3-201ENST00000441452 574 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
CHAF1AQ13111 EIF2S2P2-201ENST00000447161 982 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
CHAF1AQ13111 AL162591.2-201ENST00000449634 317 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
CHAF1AQ13111 RPS6P2-201ENST00000454208 705 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
CHAF1AQ13111 AC104982.1-201ENST00000478775 574 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
CHAF1AQ13111 HPRT1P2-201ENST00000505250 544 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
CHAF1AQ13111 AL049544.1-201ENST00000511849 673 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
CHAF1AQ13111 AC007016.1-201ENST00000512110 244 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
CHAF1AQ13111 PRELID3BP4-201ENST00000515476 571 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
CHAF1AQ13111 AC008562.1-201ENST00000521763 330 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
CHAF1AQ13111 AC118942.1-201ENST00000529674 1035 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
CHAF1AQ13111 MS4A7-208ENST00000530234 730 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
CHAF1AQ13111 AP001775.2-201ENST00000531710 334 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
CHAF1AQ13111 RAB3IP-214ENST00000550847 670 ntTSL 3 BASIC5.66□□□□□ -1.5
CHAF1AQ13111 AC068831.4-201ENST00000556118 109 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
CHAF1AQ13111 AC134312.3-201ENST00000566155 213 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
CHAF1AQ13111 GOLGA8M-203ENST00000568033 557 ntTSL 4 BASIC5.66□□□□□ -1.5
CHAF1AQ13111 MAPKAPK5-AS1-205ENST00000590479 543 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
CHAF1AQ13111 ZNF682-204ENST00000593468 581 ntTSL 4 BASIC5.66□□□□□ -1.5
CHAF1AQ13111 AL133243.1-201ENST00000614487 366 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
CHAF1AQ13111 MLECP1-201ENST00000615893 709 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
CHAF1AQ13111 AC022960.3-201ENST00000619794 441 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
CHAF1AQ13111 AC017104.5-201ENST00000637647 639 ntBASIC5.66□□□□□ -1.5
CHAF1AQ13111 BCLAF1-207ENST00000527759 4373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
CHAF1AQ13111 SLC5A12-202ENST00000396005 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
CHAF1AQ13111 TDRD3-204ENST00000377894 2484 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
CHAF1AQ13111 TRIM77-201ENST00000398290 1353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.66□□□□□ -1.5
CHAF1AQ13111 RXFP1-204ENST00000423548 3930 ntTSL 2 BASIC5.66□□□□□ -1.5
CHAF1AQ13111 UBA6-AS1-203ENST00000500538 3352 ntTSL 1 (best) BASIC5.66□□□□□ -1.5
CHAF1AQ13111 ZNF345-213ENST00000589046 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
CHAF1AQ13111 C2CD6-204ENST00000450242 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
CHAF1AQ13111 GHR-213ENST00000622294 4312 ntTSL 5 BASIC5.65□□□□□ -1.5
CHAF1AQ13111 OR51H2P-202ENST00000641424 3046 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
CHAF1AQ13111 BCAP29-203ENST00000379119 5773 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
CHAF1AQ13111 OR6K3-201ENST00000368145 1844 ntAPPRIS P1 BASIC5.65□□□□□ -1.5
CHAF1AQ13111 LRRTM4-203ENST00000409282 2451 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
CHAF1AQ13111 OR56B2P-202ENST00000641377 2453 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
CHAF1AQ13111 AC046144.1-201ENST00000478559 1853 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
CHAF1AQ13111 AC021146.4-201ENST00000309229 279 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
CHAF1AQ13111 MIR659-201ENST00000384963 97 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
CHAF1AQ13111 RNU6ATAC5P-201ENST00000388104 126 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
CHAF1AQ13111 LINC01198-201ENST00000416521 500 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
CHAF1AQ13111 AL020993.1-201ENST00000420172 297 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
CHAF1AQ13111 E2F6P2-201ENST00000420708 748 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
CHAF1AQ13111 RPL7AP25-201ENST00000423357 805 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
CHAF1AQ13111 CASP12-204ENST00000433738 709 ntTSL 1 (best) BASIC5.65□□□□□ -1.5
CHAF1AQ13111 AL592437.1-201ENST00000443781 492 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
CHAF1AQ13111 YWHAQP9-201ENST00000445891 512 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
CHAF1AQ13111 LINC01075-201ENST00000455977 370 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
CHAF1AQ13111 RNU6ATAC28P-201ENST00000459249 118 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
CHAF1AQ13111 AC090142.1-201ENST00000465776 462 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
CHAF1AQ13111 RPL21P126-201ENST00000470049 478 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
CHAF1AQ13111 IGLVIV-65-201ENST00000517313 360 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
CHAF1AQ13111 AC120193.1-201ENST00000518988 741 ntTSL 2 BASIC5.65□□□□□ -1.5
CHAF1AQ13111 AF181450.1-201ENST00000522980 410 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
CHAF1AQ13111 AF117829.1-210ENST00000523859 696 ntTSL 3 BASIC5.65□□□□□ -1.5
CHAF1AQ13111 AC124293.1-201ENST00000530034 493 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
CHAF1AQ13111 PARP1P2-201ENST00000556806 195 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
CHAF1AQ13111 ATP5J2P6-201ENST00000565203 266 ntBASIC5.65□□□□□ -1.5
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