Protein–RNA interactions for Protein: Q13077

TRAF1, TNF receptor-associated factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF1Q13077 AC104012.1-201ENST00000517848 719 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
TRAF1Q13077 DDHD2-219ENST00000529845 945 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
TRAF1Q13077 VBP1-203ENST00000535916 944 ntTSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
TRAF1Q13077 AL133304.2-201ENST00000546376 886 ntTSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
TRAF1Q13077 AC063947.1-201ENST00000549036 557 ntTSL 4 BASIC5.11□□□□□ -1.59
TRAF1Q13077 AC068831.4-201ENST00000556118 109 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
TRAF1Q13077 AC217774.1-201ENST00000578936 517 ntTSL 4 BASIC5.11□□□□□ -1.59
TRAF1Q13077 AC114684.1-201ENST00000587659 352 ntTSL 3 BASIC5.11□□□□□ -1.59
TRAF1Q13077 AC006504.5-201ENST00000588122 655 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
TRAF1Q13077 LINC01533-202ENST00000588694 632 ntTSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
TRAF1Q13077 AL157938.2-204ENST00000589667 826 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
TRAF1Q13077 AC113403.1-201ENST00000604910 193 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
TRAF1Q13077 AC093424.1-201ENST00000604999 338 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
TRAF1Q13077 AC025175.1-201ENST00000606482 759 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
TRAF1Q13077 MIR378J-201ENST00000611988 109 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
TRAF1Q13077 ATXN3-251ENST00000617719 1074 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
TRAF1Q13077 RMST_5.1-201ENST00000618704 126 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
TRAF1Q13077 AL161616.2-201ENST00000622001 565 ntTSL 4 BASIC5.11□□□□□ -1.59
TRAF1Q13077 TRIM77-201ENST00000398290 1353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
TRAF1Q13077 CFAP221-215ENST00000598644 1532 ntTSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
TRAF1Q13077 GABRG2-210ENST00000638772 7669 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
TRAF1Q13077 UBA6-AS1-203ENST00000500538 3352 ntTSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
TRAF1Q13077 SYTL2-217ENST00000528231 3536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
TRAF1Q13077 AC093909.5-201ENST00000621839 1799 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
TRAF1Q13077 TCHHL1-201ENST00000368806 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
TRAF1Q13077 ZNF480-202ENST00000335090 2722 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
TRAF1Q13077 RAP1GDS1-205ENST00000408927 3681 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
TRAF1Q13077 RNF133-201ENST00000340112 1445 ntAPPRIS P1 BASIC5.1□□□□□ -1.59
TRAF1Q13077 RNA5SP502-201ENST00000362694 119 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
TRAF1Q13077 ADIG-201ENST00000373348 430 ntTSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
TRAF1Q13077 AC003035.1-201ENST00000391359 544 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
TRAF1Q13077 PRKACB-208ENST00000394839 4200 ntTSL 2 BASIC5.1□□□□□ -1.59
TRAF1Q13077 AL356317.1-201ENST00000396110 1436 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
TRAF1Q13077 GALNT3-202ENST00000409882 2107 ntTSL 1 (best) BASIC5.1□□□□□ -1.59
TRAF1Q13077 ZNF736P7Y-201ENST00000425158 820 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
TRAF1Q13077 AL160175.1-201ENST00000428124 247 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
TRAF1Q13077 BX119904.1-201ENST00000432026 348 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
TRAF1Q13077 ACTR3P2-201ENST00000439585 1257 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
TRAF1Q13077 NAMPTP1-201ENST00000440465 2514 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
TRAF1Q13077 RPL6P5-201ENST00000445678 828 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
TRAF1Q13077 AL009048.1-201ENST00000450437 298 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
TRAF1Q13077 AL162388.1-201ENST00000450912 352 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
TRAF1Q13077 DDX39BP2-208ENST00000453923 258 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
TRAF1Q13077 AC010469.1-201ENST00000463864 576 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
TRAF1Q13077 AC107015.1-201ENST00000466902 747 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
TRAF1Q13077 LARP7P4-201ENST00000481075 878 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
TRAF1Q13077 SSBP1-211ENST00000484178 676 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
TRAF1Q13077 BOLA3P3-201ENST00000505182 232 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
TRAF1Q13077 MYL12AP1-201ENST00000518490 515 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
TRAF1Q13077 AC090017.1-201ENST00000548612 1779 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
TRAF1Q13077 AC023825.1-201ENST00000566704 1030 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
TRAF1Q13077 AC074237.1-201ENST00000577674 471 ntTSL 3 BASIC5.1□□□□□ -1.59
TRAF1Q13077 IMMP1LP1-201ENST00000605170 488 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
TRAF1Q13077 AC020634.1-201ENST00000608701 549 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
TRAF1Q13077 AC008432.1-201ENST00000615912 1320 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
TRAF1Q13077 AL121890.3-201ENST00000618494 516 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
TRAF1Q13077 MIR6891-201ENST00000618788 93 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
TRAF1Q13077 AC105105.5-201ENST00000622635 1294 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
TRAF1Q13077 AC009951.1-201ENST00000623674 2614 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
TRAF1Q13077 AP002967.1-201ENST00000624203 539 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
TRAF1Q13077 OR2L1P-202ENST00000641567 1023 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
TRAF1Q13077 OR5AC4P-202ENST00000642086 985 ntBASIC5.1□□□□□ -1.59
TRAF1Q13077 AL360270.1-201ENST00000440689 2359 ntTSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
TRAF1Q13077 KCNJ16-211ENST00000615244 4190 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.09□□□□□ -1.59
TRAF1Q13077 AP001803.2-201ENST00000532274 2034 ntTSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
TRAF1Q13077 EIF2AP4-201ENST00000424793 1781 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
TRAF1Q13077 LMNTD1-202ENST00000413632 1520 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
TRAF1Q13077 MS4A14-203ENST00000395005 2813 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
TRAF1Q13077 RNA5SP307-201ENST00000362863 116 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
TRAF1Q13077 RNU1-63P-201ENST00000383902 164 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
TRAF1Q13077 RNU6-298P-201ENST00000390888 96 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
TRAF1Q13077 GSTA12P-201ENST00000402398 508 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
TRAF1Q13077 RNU4-25P-201ENST00000410569 230 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
TRAF1Q13077 SNORA74C-2-201ENST00000411179 201 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
TRAF1Q13077 CEACAMP8-201ENST00000413902 580 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
TRAF1Q13077 AC004594.1-217ENST00000422260 325 ntTSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
TRAF1Q13077 EIF1P3-201ENST00000423841 334 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
TRAF1Q13077 NIPA2P1-201ENST00000426223 976 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
TRAF1Q13077 MTND2P5-201ENST00000432656 1006 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
TRAF1Q13077 AL035246.1-201ENST00000433554 1255 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
TRAF1Q13077 CBX1P1-201ENST00000440184 427 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
TRAF1Q13077 AC099063.2-201ENST00000446360 662 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
TRAF1Q13077 AC017067.1-201ENST00000448570 447 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
TRAF1Q13077 HMGB1P38-201ENST00000490557 577 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
TRAF1Q13077 AC025674.1-201ENST00000507074 324 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
TRAF1Q13077 AC097478.1-202ENST00000508021 567 ntTSL 4 BASIC5.09□□□□□ -1.59
TRAF1Q13077 IGKV1OR2-1-201ENST00000514060 354 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
TRAF1Q13077 TMPRSS11BNL-205ENST00000514295 1262 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
TRAF1Q13077 LINC02465-204ENST00000514892 481 ntTSL 2 BASIC5.09□□□□□ -1.59
TRAF1Q13077 AC090281.1-201ENST00000523019 276 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
TRAF1Q13077 CYCSP28-201ENST00000534284 321 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
TRAF1Q13077 TRDN-204ENST00000542443 1294 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.59
TRAF1Q13077 AC007688.2-201ENST00000545158 369 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
TRAF1Q13077 AC104229.1-201ENST00000561364 255 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
TRAF1Q13077 AC007014.1-201ENST00000572828 610 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
TRAF1Q13077 AC091588.1-201ENST00000578504 359 ntTSL 3 BASIC5.09□□□□□ -1.59
TRAF1Q13077 ZRANB2-AS2-212ENST00000590186 686 ntTSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.59
TRAF1Q13077 AC004223.2-201ENST00000590309 544 ntBASIC5.09□□□□□ -1.59
TRAF1Q13077 AC115522.1-201ENST00000595680 556 ntTSL 4 BASIC5.09□□□□□ -1.59
TRAF1Q13077 THRA1/BTR-203ENST00000604191 571 ntTSL 4 BASIC5.09□□□□□ -1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 113.4 ms