Protein–RNA interactions for Protein: P42166

TMPO, Lamina-associated polypeptide 2, isoform alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 694 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPOP42166 AC016550.1-201ENST00000505348 785 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
TMPOP42166 AC010460.1-201ENST00000507087 466 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
TMPOP42166 AC119751.4-201ENST00000507498 357 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
TMPOP42166 FABP5P6-201ENST00000510588 409 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
TMPOP42166 C1GALT1P2-201ENST00000510813 1104 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
TMPOP42166 AF181450.1-201ENST00000522980 410 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
TMPOP42166 OR4V1P-201ENST00000525394 1140 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
TMPOP42166 AC021393.1-201ENST00000531077 433 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
TMPOP42166 KLHL23-207ENST00000602521 630 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
TMPOP42166 IGKV1OR2-118-201ENST00000603238 347 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
TMPOP42166 AL592436.1-201ENST00000605135 558 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
TMPOP42166 AL356515.1-201ENST00000611081 415 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
TMPOP42166 CR589904.2-201ENST00000612533 440 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
TMPOP42166 AL049777.1-201ENST00000622740 518 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
TMPOP42166 AC124312.6-202ENST00000623624 418 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
TMPOP42166 RAPH1-203ENST00000374493 3909 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
TMPOP42166 AKAP4-201ENST00000358526 2881 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
TMPOP42166 MTND4P9-201ENST00000507819 1346 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
TMPOP42166 LINS1-201ENST00000314742 4821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.58
TMPOP42166 MYCBP2-211ENST00000544440 14664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
TMPOP42166 CHL1-216ENST00000620033 7311 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
TMPOP42166 NAMPTP1-201ENST00000440465 2514 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
TMPOP42166 C12orf45-204ENST00000552951 23529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
TMPOP42166 AC093909.5-201ENST00000621839 1799 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
TMPOP42166 PTER-201ENST00000298942 3448 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
TMPOP42166 AC011503.2-201ENST00000594230 1500 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
TMPOP42166 ICA1L-206ENST00000418208 602 ntTSL 4 BASIC5.2□□□□□ -1.58
TMPOP42166 AC007557.4-201ENST00000421907 430 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
TMPOP42166 RNF2P1-201ENST00000442955 1010 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
TMPOP42166 AL355601.1-201ENST00000444701 427 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
TMPOP42166 BX119904.2-201ENST00000446495 512 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
TMPOP42166 EIF2S2P5-201ENST00000457635 968 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
TMPOP42166 CDKN3-205ENST00000458126 845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
TMPOP42166 NADK2-AS1-201ENST00000501794 720 ntTSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
TMPOP42166 AC010468.3-201ENST00000508225 458 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
TMPOP42166 AC026402.1-201ENST00000513642 170 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
TMPOP42166 VTA1P2-201ENST00000520205 911 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
TMPOP42166 AP001330.2-201ENST00000523121 979 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
TMPOP42166 AC113192.3-201ENST00000529152 742 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
TMPOP42166 UBTFL9-201ENST00000534504 1148 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
TMPOP42166 LINC02277-201ENST00000553386 453 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
TMPOP42166 LINC2194-201ENST00000567127 454 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
TMPOP42166 AC120057.2-201ENST00000571520 271 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
TMPOP42166 AC005899.4-201ENST00000581915 514 ntTSL 4 BASIC5.2□□□□□ -1.58
TMPOP42166 AP005262.1-201ENST00000582646 997 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
TMPOP42166 PSMD5-AS1-203ENST00000589026 525 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
TMPOP42166 AC022916.3-201ENST00000592961 742 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
TMPOP42166 ZNF92P2-201ENST00000600543 1059 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
TMPOP42166 AL606490.9-201ENST00000603331 271 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
TMPOP42166 AC099676.1-201ENST00000608886 657 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
TMPOP42166 AP001002.2-201ENST00000625137 386 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
TMPOP42166 CDRT1-208ENST00000630868 794 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
TMPOP42166 BX088723.1-201ENST00000637785 708 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
TMPOP42166 SMC2-AS1-201ENST00000603487 7020 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
TMPOP42166 CSMD3-201ENST00000297405 13212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
TMPOP42166 ZNF962P-201ENST00000443465 3140 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
TMPOP42166 TBC1D31-210ENST00000521676 3256 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
TMPOP42166 KLF12-201ENST00000377669 10637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
TMPOP42166 IFI44L-201ENST00000370751 5874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
TMPOP42166 KIAA0586-202ENST00000354386 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
TMPOP42166 IPO11-202ENST00000409296 3564 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
TMPOP42166 MAP3K21-201ENST00000366622 4005 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
TMPOP42166 MTFR1-203ENST00000458689 2500 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
TMPOP42166 SNORA63.3-201ENST00000362682 132 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
TMPOP42166 Y_RNA.126-201ENST00000363382 111 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
TMPOP42166 SNORD115-48-201ENST00000364764 76 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
TMPOP42166 AKAP14-204ENST00000371431 977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
TMPOP42166 MIR620-201ENST00000385232 95 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
TMPOP42166 AL450992.3-201ENST00000413192 568 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
TMPOP42166 CYP3A43-205ENST00000415413 990 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
TMPOP42166 CBLL1-202ENST00000415884 804 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
TMPOP42166 MTCO1P51-201ENST00000427672 1060 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
TMPOP42166 ZNF965P-201ENST00000432501 817 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
TMPOP42166 ST7-AS2-203ENST00000434993 918 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
TMPOP42166 ELOCP8-201ENST00000439309 332 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
TMPOP42166 ELOCP15-201ENST00000442090 332 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
TMPOP42166 AC007000.2-201ENST00000442564 487 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
TMPOP42166 AL353633.1-201ENST00000458480 382 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
TMPOP42166 CABYRP1-201ENST00000465493 1045 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
TMPOP42166 AC078857.1-201ENST00000469870 667 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
TMPOP42166 RPL23AP73-201ENST00000492507 471 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
TMPOP42166 RPL7P24-201ENST00000493052 752 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
TMPOP42166 MTATP6P9-201ENST00000515039 680 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
TMPOP42166 RNU6-415P-201ENST00000516252 97 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
TMPOP42166 RNU6-352P-201ENST00000516908 107 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
TMPOP42166 AC067904.2-201ENST00000517322 1283 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
TMPOP42166 AC079209.2-201ENST00000519107 431 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
TMPOP42166 AC013565.1-201ENST00000565938 597 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
TMPOP42166 MIR4286-201ENST00000580651 93 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
TMPOP42166 AC018645.2-201ENST00000609151 472 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
TMPOP42166 AC025016.1-201ENST00000616746 682 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
TMPOP42166 AC016957.2-201ENST00000616998 848 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
TMPOP42166 AC097460.3-201ENST00000623099 442 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
TMPOP42166 AC073530.2-201ENST00000623987 261 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
TMPOP42166 NRDE2-210ENST00000628832 132 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
TMPOP42166 CASC15-208ENST00000636388 1174 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
TMPOP42166 AC022893.2-201ENST00000564832 3296 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
TMPOP42166 DOCK7-218ENST00000635123 6297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
TMPOP42166 QSER1-201ENST00000399302 9335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
TMPOP42166 UNC13C-201ENST00000260323 12946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.7 ms