Protein–RNA interactions for Protein: P23470

PTPRG, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase gamma, humanhuman

Predictions only

Length 1,445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRGP23470 DPPA3-201ENST00000345088 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
PTPRGP23470 Y_RNA.500-201ENST00000384466 111 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
PTPRGP23470 CDKL4-202ENST00000395035 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
PTPRGP23470 NPM1P38-201ENST00000403835 865 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
PTPRGP23470 MIR1289-1-201ENST00000408836 144 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
PTPRGP23470 LINC02496-201ENST00000509559 584 ntTSL 3 BASIC5.97□□□□□ -1.45
PTPRGP23470 AC022118.1-201ENST00000512352 547 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
PTPRGP23470 RANP9-201ENST00000519957 271 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
PTPRGP23470 AC083923.2-203ENST00000520512 372 ntTSL 3 BASIC5.97□□□□□ -1.45
PTPRGP23470 AC108863.1-201ENST00000520863 650 ntTSL 3 BASIC5.97□□□□□ -1.45
PTPRGP23470 NACA-211ENST00000548563 827 ntTSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
PTPRGP23470 NCAPGP2-201ENST00000557911 754 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
PTPRGP23470 PDE6G-203ENST00000571224 526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
PTPRGP23470 OOSP1P2-201ENST00000579644 351 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
PTPRGP23470 AC135178.3-202ENST00000580537 579 ntTSL 3 BASIC5.97□□□□□ -1.45
PTPRGP23470 MIR3124-201ENST00000582636 67 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
PTPRGP23470 AC006077.1-201ENST00000604746 343 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
PTPRGP23470 SNORA62.6-201ENST00000606322 83 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
PTPRGP23470 5S_rRNA.16-201ENST00000612928 119 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
PTPRGP23470 SMIM2-AS1-204ENST00000619472 746 ntTSL 3 BASIC5.97□□□□□ -1.45
PTPRGP23470 CYP7A1-201ENST00000301645 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
PTPRGP23470 CD69-201ENST00000228434 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
PTPRGP23470 TNFSF18-201ENST00000404377 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
PTPRGP23470 AC090510.1-202ENST00000500850 2017 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
PTPRGP23470 AC139426.3-201ENST00000605648 2059 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
PTPRGP23470 CACNB4-243ENST00000637217 8188 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.45
PTPRGP23470 ZNF705D-202ENST00000400085 3377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
PTPRGP23470 RNASE6-201ENST00000304677 1061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
PTPRGP23470 AC005871.1-201ENST00000450247 475 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
PTPRGP23470 OR52Y1P-201ENST00000452418 828 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
PTPRGP23470 AC090993.1-201ENST00000522460 582 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
PTPRGP23470 AC021713.1-201ENST00000526554 510 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
PTPRGP23470 MFAP5-211ENST00000540087 492 ntTSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
PTPRGP23470 TIMM9-206ENST00000555593 796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
PTPRGP23470 AL358335.2-201ENST00000555693 487 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
PTPRGP23470 AC103987.2-201ENST00000583436 417 ntTSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
PTPRGP23470 TTN-AS1-213ENST00000584485 838 ntTSL 3 BASIC5.96□□□□□ -1.46
PTPRGP23470 AL121890.2-201ENST00000617644 465 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
PTPRGP23470 AC079684.1-201ENST00000621405 437 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
PTPRGP23470 LINC02086-205ENST00000628749 679 ntTSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
PTPRGP23470 KLRC1-201ENST00000347831 1332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
PTPRGP23470 RC3H1-202ENST00000367694 3775 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.96□□□□□ -1.46
PTPRGP23470 SLC15A5-201ENST00000344941 2923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.96□□□□□ -1.46
PTPRGP23470 MTCO1P46-201ENST00000451639 1491 ntBASIC5.96□□□□□ -1.46
PTPRGP23470 STAG2-204ENST00000371157 5991 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.96□□□□□ -1.46
PTPRGP23470 CSMD3-204ENST00000455883 12485 ntTSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
PTPRGP23470 NUTM2B-AS1-213ENST00000619625 7611 ntTSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
PTPRGP23470 ZMYM1-201ENST00000359858 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
PTPRGP23470 ZNF207-203ENST00000394670 13781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
PTPRGP23470 SMC6-203ENST00000402989 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.95□□□□□ -1.46
PTPRGP23470 TPH1-201ENST00000250018 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.95□□□□□ -1.46
PTPRGP23470 RN7SKP97-201ENST00000410966 333 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
PTPRGP23470 AC017083.1-201ENST00000428093 483 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
PTPRGP23470 ATP5JP1-201ENST00000431631 322 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
PTPRGP23470 AC068790.5-201ENST00000602741 355 ntBASIC5.95□□□□□ -1.46
PTPRGP23470 AL683887.1-201ENST00000603401 287 ntTSL 3 BASIC5.95□□□□□ -1.46
PTPRGP23470 AC084816.1-212ENST00000625240 1114 ntTSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
PTPRGP23470 ADAM7-202ENST00000380789 3358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.95□□□□□ -1.46
PTPRGP23470 MLH3-212ENST00000556740 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
PTPRGP23470 KANSL1L-209ENST00000457374 2264 ntTSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
PTPRGP23470 PLS1-211ENST00000497002 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
PTPRGP23470 MTHFD2L-201ENST00000325278 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
PTPRGP23470 AL133383.2-201ENST00000622958 2336 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
PTPRGP23470 LIX1L-AS1-201ENST00000366105 377 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
PTPRGP23470 TXN-201ENST00000374515 635 ntTSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
PTPRGP23470 AC003035.1-201ENST00000391359 544 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
PTPRGP23470 LINC01048-201ENST00000414480 511 ntTSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
PTPRGP23470 EIF1AX-AS1-201ENST00000424026 378 ntTSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
PTPRGP23470 UBE2DNL-203ENST00000474922 222 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
PTPRGP23470 RNU2-27P-201ENST00000516185 142 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
PTPRGP23470 AC090150.2-201ENST00000521869 815 ntTSL 3 BASIC5.94□□□□□ -1.46
PTPRGP23470 AC015922.4-201ENST00000612568 690 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
PTPRGP23470 AC015722.2-201ENST00000622210 551 ntBASIC5.94□□□□□ -1.46
PTPRGP23470 AL499616.1-201ENST00000415437 2633 ntTSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
PTPRGP23470 MLIP-213ENST00000514921 5743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
PTPRGP23470 MTRNR2L10-201ENST00000545075 1530 ntAPPRIS P1 BASIC5.94□□□□□ -1.46
PTPRGP23470 POSTN-203ENST00000379747 3373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
PTPRGP23470 PRUNE2-208ENST00000443509 12356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.94□□□□□ -1.46
PTPRGP23470 AC110760.2-201ENST00000508031 2546 ntTSL 2 BASIC5.94□□□□□ -1.46
PTPRGP23470 SPAG17-201ENST00000336338 6924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.94□□□□□ -1.46
PTPRGP23470 MFSD8-236ENST00000641509 4050 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
PTPRGP23470 MAP2-205ENST00000392194 5303 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
PTPRGP23470 SLC24A2-202ENST00000341998 10749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
PTPRGP23470 FAR2-203ENST00000547116 1787 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
PTPRGP23470 SNORA48.5-201ENST00000391143 135 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
PTPRGP23470 RPL7P44-201ENST00000424827 742 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
PTPRGP23470 MTCO1P45-201ENST00000431457 267 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
PTPRGP23470 RPL21P110-201ENST00000433345 446 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
PTPRGP23470 AC005019.1-201ENST00000436455 431 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
PTPRGP23470 RPS17P13-201ENST00000448974 407 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
PTPRGP23470 RPL7P23-201ENST00000493874 747 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
PTPRGP23470 BTG4P1-201ENST00000510421 183 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
PTPRGP23470 RAC1P2-201ENST00000511164 579 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
PTPRGP23470 LINC01339-203ENST00000519336 561 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
PTPRGP23470 AC087362.1-201ENST00000527912 434 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
PTPRGP23470 STX3-204ENST00000530221 534 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
PTPRGP23470 AC008056.1-201ENST00000553322 394 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
PTPRGP23470 SETP1-201ENST00000556014 845 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
PTPRGP23470 AC022146.1-201ENST00000595307 847 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
PTPRGP23470 AC072062.1-210ENST00000628464 1315 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78 ms