Protein–RNA interactions for Protein: B1AMM8

LINC00587, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00587, humanhuman

Predictions only

Length 73 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00587B1AMM8 EIF1P3-201ENST00000423841 334 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
LINC00587B1AMM8 AC069257.1-202ENST00000425275 422 ntTSL 3 BASIC3.01□□□□□ -1.93
LINC00587B1AMM8 FSIP2-AS1-201ENST00000429929 440 ntTSL 3 BASIC3.01□□□□□ -1.93
LINC00587B1AMM8 LINC01598-201ENST00000432067 460 ntTSL 3 BASIC3.01□□□□□ -1.93
LINC00587B1AMM8 AL353898.1-201ENST00000444055 238 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
LINC00587B1AMM8 NANOGP10-201ENST00000453325 895 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
LINC00587B1AMM8 AC079168.2-201ENST00000453977 416 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
LINC00587B1AMM8 RPS4XP2-201ENST00000458402 793 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
LINC00587B1AMM8 AC108693.1-201ENST00000496068 432 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
LINC00587B1AMM8 OR5H4P-201ENST00000510851 923 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
LINC00587B1AMM8 AC013644.1-202ENST00000523166 499 ntTSL 2 BASIC3.01□□□□□ -1.93
LINC00587B1AMM8 RGS5-219ENST00000528019 512 ntTSL 4 BASIC3.01□□□□□ -1.93
LINC00587B1AMM8 OR5AP1P-201ENST00000529730 940 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
LINC00587B1AMM8 TPPP2-208ENST00000530140 703 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.01□□□□□ -1.93
LINC00587B1AMM8 NRG3-205ENST00000537893 1174 ntTSL 1 (best) BASIC3.01□□□□□ -1.93
LINC00587B1AMM8 LINC02390-201ENST00000541404 560 ntTSL 4 BASIC3.01□□□□□ -1.93
LINC00587B1AMM8 LINC02300-201ENST00000549742 665 ntTSL 4 BASIC3.01□□□□□ -1.93
LINC00587B1AMM8 G2E3-AS1-204ENST00000552511 402 ntTSL 2 BASIC3.01□□□□□ -1.93
LINC00587B1AMM8 AC074052.2-201ENST00000562516 214 ntTSL 3 BASIC3.01□□□□□ -1.93
LINC00587B1AMM8 CNEP1R1-204ENST00000562576 656 ntTSL 5 BASIC3.01□□□□□ -1.93
LINC00587B1AMM8 AC009137.2-201ENST00000568179 641 ntTSL 3 BASIC3.01□□□□□ -1.93
LINC00587B1AMM8 AC011990.1-201ENST00000592809 734 ntTSL 3 BASIC3.01□□□□□ -1.93
LINC00587B1AMM8 AL139041.1-201ENST00000605480 610 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
LINC00587B1AMM8 PLSCR2-206ENST00000610787 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.01□□□□□ -1.93
LINC00587B1AMM8 AC126915.2-201ENST00000610957 190 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
LINC00587B1AMM8 AC091905.1-201ENST00000624400 311 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
LINC00587B1AMM8 AC019080.5-201ENST00000624891 757 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
LINC00587B1AMM8 AC008013.2-202ENST00000637965 364 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
LINC00587B1AMM8 RFC1-217ENST00000639695 867 ntTSL 5 BASIC3.01□□□□□ -1.93
LINC00587B1AMM8 LINC01094-203ENST00000504675 1985 ntTSL 2 BASIC3.01□□□□□ -1.93
LINC00587B1AMM8 XRN1-202ENST00000392981 5383 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.01□□□□□ -1.93
LINC00587B1AMM8 RMDN2-204ENST00000406384 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.01□□□□□ -1.93
LINC00587B1AMM8 AC073073.2-201ENST00000609827 2578 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
LINC00587B1AMM8 KIAA0586-215ENST00000619722 5597 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.01□□□□□ -1.93
LINC00587B1AMM8 AC092435.3-201ENST00000565538 3654 ntBASIC3□□□□□ -1.93
LINC00587B1AMM8 LINC02120-201ENST00000505518 2008 ntTSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
LINC00587B1AMM8 MIR133A1HG-202ENST00000581072 4226 ntTSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
LINC00587B1AMM8 CEP152-203ENST00000399334 5097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
LINC00587B1AMM8 MARCH7-202ENST00000409175 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3□□□□□ -1.93
LINC00587B1AMM8 AC008264.2-201ENST00000610193 3731 ntBASIC3□□□□□ -1.93
LINC00587B1AMM8 DMD-203ENST00000357033 13956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
LINC00587B1AMM8 C12orf50-203ENST00000550553 1525 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
LINC00587B1AMM8 CHD9-213ENST00000564845 11504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
LINC00587B1AMM8 IL5-201ENST00000231454 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
LINC00587B1AMM8 OR5K4-201ENST00000354924 966 ntAPPRIS P1 BASIC3□□□□□ -1.93
LINC00587B1AMM8 MIR30E-201ENST00000362104 92 ntBASIC3□□□□□ -1.93
LINC00587B1AMM8 RNA5SP366-201ENST00000365454 123 ntBASIC3□□□□□ -1.93
LINC00587B1AMM8 RN7SKP187-201ENST00000365536 330 ntBASIC3□□□□□ -1.93
LINC00587B1AMM8 KRTAP27-1-201ENST00000382835 682 ntAPPRIS P1 BASIC3□□□□□ -1.93
LINC00587B1AMM8 RNU1-82P-201ENST00000390851 165 ntBASIC3□□□□□ -1.93
LINC00587B1AMM8 RPS26P8-201ENST00000393490 348 ntBASIC3□□□□□ -1.93
LINC00587B1AMM8 MRM2-202ENST00000407040 582 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
LINC00587B1AMM8 U3.36-201ENST00000408418 213 ntBASIC3□□□□□ -1.93
LINC00587B1AMM8 TTTY17A-201ENST00000416110 166 ntTSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
LINC00587B1AMM8 AL360093.1-201ENST00000420237 1126 ntTSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
LINC00587B1AMM8 TTTY17C-201ENST00000421387 166 ntTSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
LINC00587B1AMM8 AC005828.1-201ENST00000431604 524 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
LINC00587B1AMM8 AC092162.2-201ENST00000438143 532 ntTSL 4 BASIC3□□□□□ -1.93
LINC00587B1AMM8 TTTY17B-201ENST00000441906 166 ntTSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
LINC00587B1AMM8 AC092637.1-201ENST00000444745 510 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
LINC00587B1AMM8 AC012671.1-201ENST00000451912 203 ntBASIC3□□□□□ -1.93
LINC00587B1AMM8 AL365318.1-201ENST00000453128 705 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
LINC00587B1AMM8 AC005229.2-201ENST00000456995 399 ntBASIC3□□□□□ -1.93
LINC00587B1AMM8 AC084754.1-201ENST00000463466 464 ntBASIC3□□□□□ -1.93
LINC00587B1AMM8 AC104763.1-201ENST00000475274 360 ntBASIC3□□□□□ -1.93
LINC00587B1AMM8 AL138787.2-202ENST00000479395 385 ntTSL 2 BASIC3□□□□□ -1.93
LINC00587B1AMM8 AL161747.1-201ENST00000480068 358 ntBASIC3□□□□□ -1.93
LINC00587B1AMM8 RN7SL184P-201ENST00000488308 297 ntBASIC3□□□□□ -1.93
LINC00587B1AMM8 THAP6-212ENST00000508105 1103 ntTSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
LINC00587B1AMM8 RN7SKP282-201ENST00000516824 299 ntBASIC3□□□□□ -1.93
LINC00587B1AMM8 SEC11B-201ENST00000518383 499 ntBASIC3□□□□□ -1.93
LINC00587B1AMM8 AC004825.1-201ENST00000555068 586 ntBASIC3□□□□□ -1.93
LINC00587B1AMM8 AC135626.1-201ENST00000556983 435 ntBASIC3□□□□□ -1.93
LINC00587B1AMM8 AL157394.1-201ENST00000562983 1224 ntBASIC3□□□□□ -1.93
LINC00587B1AMM8 AC092140.1-201ENST00000563090 549 ntTSL 3 BASIC3□□□□□ -1.93
LINC00587B1AMM8 AC099313.1-201ENST00000568437 452 ntTSL 2 BASIC3□□□□□ -1.93
LINC00587B1AMM8 RN7SL652P-201ENST00000577769 300 ntBASIC3□□□□□ -1.93
LINC00587B1AMM8 AC006557.5-201ENST00000603126 811 ntBASIC3□□□□□ -1.93
LINC00587B1AMM8 AL133393.1-201ENST00000603277 287 ntBASIC3□□□□□ -1.93
LINC00587B1AMM8 AC104662.1-201ENST00000604448 511 ntBASIC3□□□□□ -1.93
LINC00587B1AMM8 LINC00904-201ENST00000604453 471 ntTSL 2 BASIC3□□□□□ -1.93
LINC00587B1AMM8 MKKS-203ENST00000609375 882 ntTSL 2 BASIC3□□□□□ -1.93
LINC00587B1AMM8 AC136428.4-201ENST00000634254 1155 ntBASIC3□□□□□ -1.93
LINC00587B1AMM8 AL392088.2-201ENST00000637607 285 ntBASIC3□□□□□ -1.93
LINC00587B1AMM8 BX088723.1-201ENST00000637785 708 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
LINC00587B1AMM8 ESCO1-204ENST00000622333 1850 ntTSL 2 BASIC3□□□□□ -1.93
LINC00587B1AMM8 ZNF415-201ENST00000243643 2270 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
LINC00587B1AMM8 SERPINA7-201ENST00000327674 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
LINC00587B1AMM8 LRRTM4-201ENST00000409088 3616 ntTSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
LINC00587B1AMM8 PPHLN1-208ENST00000449194 1583 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
LINC00587B1AMM8 ZNF137P-201ENST00000456718 1920 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
LINC00587B1AMM8 PHF3-202ENST00000393387 6947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
LINC00587B1AMM8 FTO-203ENST00000460382 1517 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
LINC00587B1AMM8 WDFY3-AS2-202ENST00000451762 5814 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
LINC00587B1AMM8 NEB-204ENST00000409198 20637 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
LINC00587B1AMM8 LCA5L-201ENST00000288350 2416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
LINC00587B1AMM8 CASC1-204ENST00000395990 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
LINC00587B1AMM8 SLC27A2-203ENST00000544960 2025 ntTSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
LINC00587B1AMM8 GYPA-201ENST00000324022 751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
LINC00587B1AMM8 OR52E6-201ENST00000329322 970 ntAPPRIS P1 BASIC2.99□□□□□ -1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78 ms