Protein–RNA interactions for Protein: Q2M243

CCDC27, Coiled-coil domain-containing protein 27, humanhuman

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Length 656 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC27Q2M243 AC009302.1-201ENST00000417147 390 ntBASIC7□□□□□ -1.29
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CCDC27Q2M243 AC073335.1-201ENST00000427776 363 ntBASIC7□□□□□ -1.29
CCDC27Q2M243 AC092839.2-201ENST00000431130 377 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
CCDC27Q2M243 AL354863.1-204ENST00000436430 556 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
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CCDC27Q2M243 SAMSN1-AS1-201ENST00000449214 840 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
CCDC27Q2M243 CHRM3-AS2-203ENST00000458325 895 ntTSL 2 BASIC7□□□□□ -1.29
CCDC27Q2M243 RNU6-956P-201ENST00000458868 103 ntBASIC7□□□□□ -1.29
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CCDC27Q2M243 RN7SL809P-201ENST00000482040 297 ntBASIC7□□□□□ -1.29
CCDC27Q2M243 CEP170-216ENST00000490813 1070 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
CCDC27Q2M243 MSMO1-203ENST00000504317 1026 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
CCDC27Q2M243 MTCYBP43-201ENST00000513621 740 ntBASIC7□□□□□ -1.29
CCDC27Q2M243 LINC02117-201ENST00000513673 540 ntTSL 4 BASIC7□□□□□ -1.29
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CCDC27Q2M243 PTH-202ENST00000529816 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
CCDC27Q2M243 AL049629.1-201ENST00000534431 648 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
CCDC27Q2M243 AC087260.1-201ENST00000546118 401 ntTSL 5 BASIC7□□□□□ -1.29
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CCDC27Q2M243 AC093012.1-201ENST00000552999 446 ntTSL 3 BASIC7□□□□□ -1.29
CCDC27Q2M243 AC090515.3-201ENST00000560431 315 ntBASIC7□□□□□ -1.29
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CCDC27Q2M243 AC006362.1-201ENST00000567392 174 ntBASIC7□□□□□ -1.29
CCDC27Q2M243 NF1P5-201ENST00000588287 448 ntBASIC7□□□□□ -1.29
CCDC27Q2M243 RNU6-88P-201ENST00000606801 100 ntBASIC7□□□□□ -1.29
CCDC27Q2M243 AL031775.1-201ENST00000607014 887 ntBASIC7□□□□□ -1.29
CCDC27Q2M243 AP001521.1-201ENST00000609150 300 ntBASIC7□□□□□ -1.29
CCDC27Q2M243 AC012360.2-201ENST00000609349 391 ntBASIC7□□□□□ -1.29
CCDC27Q2M243 AP000254.1-201ENST00000609934 520 ntBASIC7□□□□□ -1.29
CCDC27Q2M243 AC123768.4-201ENST00000616244 701 ntBASIC7□□□□□ -1.29
CCDC27Q2M243 AC231657.1-201ENST00000624313 397 ntBASIC7□□□□□ -1.29
CCDC27Q2M243 AL392088.2-201ENST00000637607 285 ntBASIC7□□□□□ -1.29
CCDC27Q2M243 CASC19-264ENST00000641912 1184 ntBASIC7□□□□□ -1.29
CCDC27Q2M243 NPSR1-AS1-202ENST00000419766 4821 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
CCDC27Q2M243 NDUFA5-207ENST00000471770 5608 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
CCDC27Q2M243 ABCA10-201ENST00000269081 6362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
CCDC27Q2M243 ANXA1-201ENST00000257497 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
CCDC27Q2M243 CFAP47-202ENST00000313548 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
CCDC27Q2M243 SCAF11-212ENST00000549162 3934 ntTSL 1 (best) BASIC7□□□□□ -1.29
CCDC27Q2M243 AC107027.3-201ENST00000565095 3473 ntBASIC7□□□□□ -1.29
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CCDC27Q2M243 AL442125.2-201ENST00000619338 418 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
CCDC27Q2M243 SATB1-AS1-269ENST00000630766 591 ntTSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
CCDC27Q2M243 LINC01739-205ENST00000641890 573 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
CCDC27Q2M243 DOPEY1-201ENST00000237163 7995 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.99□□□□□ -1.29
CCDC27Q2M243 ATP8A2P3-201ENST00000426792 1536 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
CCDC27Q2M243 MTND5P24-201ENST00000438892 1767 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
CCDC27Q2M243 AL079343.1-201ENST00000572358 1771 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
CCDC27Q2M243 ZBTB8A-202ENST00000373510 7075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
CCDC27Q2M243 LINC02397-201ENST00000504409 10626 ntTSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
CCDC27Q2M243 AL445437.1-201ENST00000623157 3087 ntBASIC6.99□□□□□ -1.29
CCDC27Q2M243 ZNF534-202ENST00000332323 2086 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
CCDC27Q2M243 MMRN1-201ENST00000264790 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.99□□□□□ -1.29
CCDC27Q2M243 SV2B-201ENST00000330276 11202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
CCDC27Q2M243 C9orf72-202ENST00000379997 1873 ntTSL 2 BASIC6.98□□□□□ -1.29
CCDC27Q2M243 LINC02355-201ENST00000503100 2520 ntTSL 1 (best) BASIC6.98□□□□□ -1.29
CCDC27Q2M243 ARF4-206ENST00000489843 1360 ntTSL 3 BASIC6.98□□□□□ -1.29
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