Protein–RNA interactions for Protein: Q15256

PTPRR, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase R, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRRQ15256 AC037198.2-201ENST00000478845 733 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
PTPRRQ15256 RN7SL826P-201ENST00000479724 288 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
PTPRRQ15256 NCOR1P1-202ENST00000486162 291 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
PTPRRQ15256 AC000372.1-201ENST00000488818 646 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
PTPRRQ15256 AC069304.1-201ENST00000491593 704 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
PTPRRQ15256 AC131211.1-201ENST00000497285 483 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
PTPRRQ15256 AC124242.1-202ENST00000499554 1052 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
PTPRRQ15256 GYPB-202ENST00000502664 521 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
PTPRRQ15256 AC005178.1-201ENST00000508392 440 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
PTPRRQ15256 AC107463.1-203ENST00000509713 284 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
PTPRRQ15256 HMGB3P13-201ENST00000511263 607 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
PTPRRQ15256 Y_RNA.695-201ENST00000516715 107 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
PTPRRQ15256 NRG1-IT3-201ENST00000519023 505 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
PTPRRQ15256 AC079209.1-201ENST00000519412 820 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
PTPRRQ15256 AP003472.1-201ENST00000519844 644 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
PTPRRQ15256 AC246817.2-206ENST00000520570 582 ntTSL 4 BASIC5.07□□□□□ -1.6
PTPRRQ15256 AC105999.2-201ENST00000521363 881 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
PTPRRQ15256 AC034102.2-201ENST00000548861 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
PTPRRQ15256 NOP10-202ENST00000557912 436 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
PTPRRQ15256 LINC01859-201ENST00000565584 1024 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
PTPRRQ15256 AC010546.1-201ENST00000569391 485 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
PTPRRQ15256 MEMO1P5-201ENST00000604810 406 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
PTPRRQ15256 AP002799.1-201ENST00000623552 423 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
PTPRRQ15256 LEUTX-202ENST00000638280 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
PTPRRQ15256 CLCN5-202ENST00000376088 10108 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
PTPRRQ15256 TPTE2-202ENST00000382978 1677 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
PTPRRQ15256 AC026523.2-201ENST00000625039 7739 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
PTPRRQ15256 ERI2-202ENST00000357967 3499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
PTPRRQ15256 OFD1P9Y-201ENST00000417699 1491 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
PTPRRQ15256 CEP162-207ENST00000617909 5095 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
PTPRRQ15256 GTF2H2B-203ENST00000508065 1432 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
PTPRRQ15256 NDUFA5-207ENST00000471770 5608 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
PTPRRQ15256 AC096656.1-201ENST00000623826 1364 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
PTPRRQ15256 RXFP1-206ENST00000460056 2735 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
PTPRRQ15256 ZNF285-204ENST00000591679 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC5.06□□□□□ -1.6
PTPRRQ15256 PPEF1-202ENST00000361511 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
PTPRRQ15256 OR8J2-201ENST00000641465 2883 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
PTPRRQ15256 SPA17-201ENST00000227135 853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
PTPRRQ15256 RNA5SP305-201ENST00000362665 119 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
PTPRRQ15256 DFNB59-201ENST00000375129 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
PTPRRQ15256 RNU6-1263P-201ENST00000384601 106 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
PTPRRQ15256 SNORA48.4-201ENST00000391089 134 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
PTPRRQ15256 AL109941.1-201ENST00000401925 229 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
PTPRRQ15256 C1D-204ENST00000410067 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
PTPRRQ15256 AC092745.2-202ENST00000411880 369 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
PTPRRQ15256 CEACAMP8-201ENST00000413902 580 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
PTPRRQ15256 LINC02528-201ENST00000417800 381 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
PTPRRQ15256 AC007435.1-201ENST00000421086 415 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
PTPRRQ15256 CDY14P-201ENST00000431260 1014 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
PTPRRQ15256 AC017048.2-201ENST00000431455 822 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
PTPRRQ15256 KCNIP1-205ENST00000434108 726 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
PTPRRQ15256 AC004824.1-201ENST00000439577 311 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
PTPRRQ15256 AL359378.1-201ENST00000439891 400 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
PTPRRQ15256 KNOP1P3-201ENST00000446933 426 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
PTPRRQ15256 AL034380.1-201ENST00000448791 306 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
PTPRRQ15256 CDY23P-201ENST00000451661 1014 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
PTPRRQ15256 SUN3-208ENST00000453192 801 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
PTPRRQ15256 AC002553.2-201ENST00000453217 340 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
PTPRRQ15256 CBX1P2-201ENST00000453841 458 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
PTPRRQ15256 TTTY19-201ENST00000453955 269 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
PTPRRQ15256 AC245028.2-201ENST00000458673 253 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
PTPRRQ15256 AC005674.1-201ENST00000503493 459 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
PTPRRQ15256 WBP1LP4-201ENST00000505043 344 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
PTPRRQ15256 LINC02118-201ENST00000505899 407 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
PTPRRQ15256 AC010587.2-201ENST00000511727 448 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
PTPRRQ15256 AC106894.1-201ENST00000511735 451 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
PTPRRQ15256 LINC02201-203ENST00000514657 674 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
PTPRRQ15256 AC103957.1-202ENST00000519814 735 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
PTPRRQ15256 OR5AZ1P-201ENST00000527448 943 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
PTPRRQ15256 AP005436.3-201ENST00000532849 572 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
PTPRRQ15256 AP002373.1-201ENST00000544347 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
PTPRRQ15256 GLYCAM1-202ENST00000546607 553 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
PTPRRQ15256 HAGLR-211ENST00000549329 609 ntTSL 4 BASIC5.06□□□□□ -1.6
PTPRRQ15256 AL359219.2-201ENST00000555184 348 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
PTPRRQ15256 AL031600.2-201ENST00000563223 307 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
PTPRRQ15256 AC092378.2-202ENST00000569328 445 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
PTPRRQ15256 AC116003.2-201ENST00000579278 748 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
PTPRRQ15256 LAMTOR5-AS1-203ENST00000585330 463 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
PTPRRQ15256 AC009303.2-201ENST00000585381 1083 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
PTPRRQ15256 AP005131.3-201ENST00000590042 665 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
PTPRRQ15256 AC006270.3-201ENST00000605967 1036 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
PTPRRQ15256 AL008729.1-201ENST00000606627 553 ntTSL 4 BASIC5.06□□□□□ -1.6
PTPRRQ15256 USP32P2-207ENST00000608376 253 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
PTPRRQ15256 AC005332.10-201ENST00000612725 619 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
PTPRRQ15256 AC008083.4-201ENST00000615076 444 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
PTPRRQ15256 AC011472.4-201ENST00000615848 491 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
PTPRRQ15256 AC008443.7-201ENST00000622195 246 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
PTPRRQ15256 PCDHB2-203ENST00000624874 565 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
PTPRRQ15256 AC116618.1-201ENST00000634617 774 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
PTPRRQ15256 PRUNE2-207ENST00000428286 12437 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
PTPRRQ15256 R3HCC1L-202ENST00000314594 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
PTPRRQ15256 PDE4B-201ENST00000329654 3998 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
PTPRRQ15256 MTND5P29-201ENST00000458676 1807 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
PTPRRQ15256 RNF217-201ENST00000359704 1784 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
PTPRRQ15256 AC005539.1-201ENST00000443768 1479 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
PTPRRQ15256 KTN1-202ENST00000395308 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
PTPRRQ15256 PTPRD-213ENST00000537002 8224 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
PTPRRQ15256 AC104260.2-201ENST00000623551 3497 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
PTPRRQ15256 INPP4B-201ENST00000262992 3741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
PTPRRQ15256 AL022322.2-201ENST00000624072 20397 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.1 ms