Protein–RNA interactions for Protein: Q13472

TOP3A, DNA topoisomerase 3-alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3AQ13472 USP9YP13-201ENST00000417797 480 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
TOP3AQ13472 AL592078.1-201ENST00000421866 321 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
TOP3AQ13472 TXNDC8-204ENST00000423740 356 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
TOP3AQ13472 PRUNEP1-201ENST00000425846 705 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
TOP3AQ13472 AC093019.2-201ENST00000432294 384 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
TOP3AQ13472 LINC02532-206ENST00000433965 570 ntTSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
TOP3AQ13472 NDUFB4P8-201ENST00000435351 367 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
TOP3AQ13472 AL445928.1-201ENST00000435545 222 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
TOP3AQ13472 RPL7P36-201ENST00000444633 681 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
TOP3AQ13472 AC002383.1-201ENST00000448260 671 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
TOP3AQ13472 AL033528.1-201ENST00000453780 140 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
TOP3AQ13472 AC004129.2-201ENST00000457229 287 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
TOP3AQ13472 AC146507.1-201ENST00000468335 354 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
TOP3AQ13472 AC041039.1-201ENST00000485656 536 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
TOP3AQ13472 RPS27P23-201ENST00000487608 251 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
TOP3AQ13472 MSMO1-203ENST00000504317 1026 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
TOP3AQ13472 LINC02360-201ENST00000506195 657 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
TOP3AQ13472 AC092834.1-201ENST00000506514 442 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
TOP3AQ13472 AC018752.1-201ENST00000507813 206 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
TOP3AQ13472 AC105384.2-201ENST00000508433 640 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
TOP3AQ13472 AC093824.1-201ENST00000508796 343 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
TOP3AQ13472 AC117522.1-201ENST00000509821 380 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
TOP3AQ13472 AC098976.1-201ENST00000513014 541 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
TOP3AQ13472 LINC02061-201ENST00000514225 335 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
TOP3AQ13472 AC008695.1-201ENST00000514667 6393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
TOP3AQ13472 RN7SKP238-201ENST00000516483 249 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
TOP3AQ13472 PAICSP4-201ENST00000517543 1253 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
TOP3AQ13472 AC124067.3-201ENST00000522643 847 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
TOP3AQ13472 AP006259.1-201ENST00000528520 561 ntTSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
TOP3AQ13472 AC009120.4-201ENST00000564455 513 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
TOP3AQ13472 AC091563.1-202ENST00000574086 522 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
TOP3AQ13472 AC136618.2-201ENST00000575091 400 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
TOP3AQ13472 AC127024.5-201ENST00000580085 462 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
TOP3AQ13472 MIR4502-201ENST00000580432 81 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
TOP3AQ13472 AC005304.3-201ENST00000581533 511 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
TOP3AQ13472 MIR5010-201ENST00000582846 120 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
TOP3AQ13472 AC006504.3-201ENST00000586818 523 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
TOP3AQ13472 AC011477.2-201ENST00000590697 921 ntTSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
TOP3AQ13472 AC006272.2-201ENST00000594725 163 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
TOP3AQ13472 COX6CP7-201ENST00000597056 208 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
TOP3AQ13472 LINC02098-201ENST00000608492 475 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
TOP3AQ13472 Metazoa_SRP.35-201ENST00000611402 288 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
TOP3AQ13472 AL139089.1-201ENST00000620372 975 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
TOP3AQ13472 NEK3-211ENST00000629912 141 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
TOP3AQ13472 AC245088.3-201ENST00000634383 424 ntAPPRIS P1 BASIC5.29□□□□□ -1.56
TOP3AQ13472 VPS50-202ENST00000305866 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
TOP3AQ13472 TMEM68-209ENST00000521229 2400 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
TOP3AQ13472 OAZ3-204ENST00000479764 3789 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
TOP3AQ13472 TSPAN6-204ENST00000612152 3796 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
TOP3AQ13472 ANKRD46-204ENST00000519597 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
TOP3AQ13472 ADAMTS9-AS1-203ENST00000471990 1606 ntTSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
TOP3AQ13472 ZNF347-201ENST00000334197 7960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
TOP3AQ13472 P2RY12-201ENST00000302632 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
TOP3AQ13472 MAPRE2-202ENST00000413393 4173 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
TOP3AQ13472 MCM8-201ENST00000265187 3442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
TOP3AQ13472 CDC27P2-201ENST00000425026 1922 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
TOP3AQ13472 MTND4P29-201ENST00000503122 1372 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
TOP3AQ13472 RPGRIP1L-201ENST00000262135 8195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
TOP3AQ13472 LINC01923-203ENST00000456248 2528 ntTSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
TOP3AQ13472 RASSF8-201ENST00000282884 1994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
TOP3AQ13472 RAB18-209ENST00000621805 4894 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
TOP3AQ13472 ZNF415-203ENST00000500065 2496 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC5.28□□□□□ -1.56
TOP3AQ13472 Y_RNA.25-201ENST00000362528 102 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
TOP3AQ13472 SNORA72.1-201ENST00000363485 129 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
TOP3AQ13472 RNU5E-5P-201ENST00000365379 116 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
TOP3AQ13472 OR1A2-201ENST00000381951 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.28□□□□□ -1.56
TOP3AQ13472 SMARCA2-207ENST00000382186 955 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
TOP3AQ13472 RNU6-1122P-201ENST00000384449 107 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
TOP3AQ13472 TRGV10-201ENST00000390341 512 ntAPPRIS P1 BASIC5.28□□□□□ -1.56
TOP3AQ13472 TRGV5-201ENST00000390344 552 ntAPPRIS P1 BASIC5.28□□□□□ -1.56
TOP3AQ13472 AC025750.1-201ENST00000399891 379 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
TOP3AQ13472 CIR1P3-201ENST00000405137 479 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
TOP3AQ13472 AL354733.1-204ENST00000412069 424 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
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TOP3AQ13472 RPS4XP5-201ENST00000419038 768 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
TOP3AQ13472 RPS27AP14-201ENST00000422868 454 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
TOP3AQ13472 AC007742.1-201ENST00000425789 329 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
TOP3AQ13472 AL033504.1-201ENST00000427015 773 ntTSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
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TOP3AQ13472 LINC00189-202ENST00000431661 308 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
TOP3AQ13472 BMS1P19-201ENST00000433925 393 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
TOP3AQ13472 ELOCP26-201ENST00000436067 329 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
TOP3AQ13472 AL354863.1-204ENST00000436430 556 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
TOP3AQ13472 MTCO3P18-201ENST00000440206 761 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
TOP3AQ13472 AL354936.1-201ENST00000441521 649 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
TOP3AQ13472 NFU1P2-201ENST00000448700 469 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
TOP3AQ13472 MTND3P10-201ENST00000450967 341 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
TOP3AQ13472 RPL18AP17-201ENST00000455326 198 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
TOP3AQ13472 ARHGEF3-AS1-201ENST00000477246 489 ntTSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
TOP3AQ13472 LARP1BP2-201ENST00000486594 519 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
TOP3AQ13472 AC005823.2-201ENST00000505978 650 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
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TOP3AQ13472 AC090572.3-201ENST00000519041 804 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
TOP3AQ13472 AF181450.1-201ENST00000522980 410 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
TOP3AQ13472 AC103726.2-201ENST00000523318 411 ntTSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
TOP3AQ13472 AC027026.1-201ENST00000532323 742 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
TOP3AQ13472 UNC13C-202ENST00000539562 938 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
TOP3AQ13472 AC073651.3-201ENST00000545999 417 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
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