Protein–RNA interactions for Protein: Q13115

DUSP4, Dual specificity protein phosphatase 4, humanhuman

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP4Q13115 AC011447.7-201ENST00000624228 1590 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
DUSP4Q13115 LRRN3-201ENST00000308478 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
DUSP4Q13115 MAP3K7-201ENST00000369320 3328 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
DUSP4Q13115 HAT1-201ENST00000264108 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
DUSP4Q13115 C4orf17-201ENST00000326581 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
DUSP4Q13115 POLK-210ENST00000508526 2019 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
DUSP4Q13115 SELE-204ENST00000367776 3576 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
DUSP4Q13115 SELE-205ENST00000367777 3576 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
DUSP4Q13115 AC020633.1-201ENST00000468439 2247 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
DUSP4Q13115 AASDH-203ENST00000502617 3004 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
DUSP4Q13115 OR13C4-201ENST00000277216 957 ntAPPRIS P1 BASIC5.93□□□□□ -1.46
DUSP4Q13115 CCNB3-202ENST00000348603 1201 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
DUSP4Q13115 RNU6-1090P-201ENST00000364065 94 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
DUSP4Q13115 S100A9-201ENST00000368738 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
DUSP4Q13115 ARGLU1-202ENST00000375926 821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
DUSP4Q13115 CCNB3-203ENST00000376038 1201 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
DUSP4Q13115 MIR217-201ENST00000384817 110 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
DUSP4Q13115 RNA5SP91-201ENST00000390902 119 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
DUSP4Q13115 MIR1284-201ENST00000408337 120 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
DUSP4Q13115 LSM5-205ENST00000409952 687 ntTSL 4 BASIC5.93□□□□□ -1.46
DUSP4Q13115 RNA5SP251-201ENST00000410614 137 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
DUSP4Q13115 AF015720.1-201ENST00000412240 349 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
DUSP4Q13115 ELOCP14-201ENST00000428070 331 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
DUSP4Q13115 BLOC1S2P1-201ENST00000428431 301 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
DUSP4Q13115 BRWD1P3-201ENST00000428816 390 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
DUSP4Q13115 DIAPH3-AS1-203ENST00000435636 467 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
DUSP4Q13115 UBE2FP3-201ENST00000436366 524 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
DUSP4Q13115 ELOCP7-201ENST00000439968 331 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
DUSP4Q13115 RPL7P36-201ENST00000444633 681 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
DUSP4Q13115 AP001604.1-201ENST00000447384 954 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
DUSP4Q13115 PSPHP1-201ENST00000450062 261 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
DUSP4Q13115 AC096666.1-201ENST00000454965 348 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
DUSP4Q13115 RPS27L-205ENST00000462430 681 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
DUSP4Q13115 RN7SL583P-201ENST00000475692 287 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
DUSP4Q13115 AHI1-208ENST00000488690 712 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
DUSP4Q13115 AC084117.1-201ENST00000496975 270 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
DUSP4Q13115 LINC02005-201ENST00000498832 782 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
DUSP4Q13115 AC108156.1-201ENST00000507849 481 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
DUSP4Q13115 AC096711.2-201ENST00000510592 454 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
DUSP4Q13115 AC026434.1-201ENST00000511474 454 ntTSL 3 BASIC5.93□□□□□ -1.46
DUSP4Q13115 snoU109.5-201ENST00000516231 132 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
DUSP4Q13115 AC246817.2-206ENST00000520570 582 ntTSL 4 BASIC5.93□□□□□ -1.46
DUSP4Q13115 AP003031.2-202ENST00000533590 572 ntTSL 4 BASIC5.93□□□□□ -1.46
DUSP4Q13115 AL138976.2-201ENST00000563989 694 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
DUSP4Q13115 MIR7515HG-239ENST00000591053 1113 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
DUSP4Q13115 ZNF649-AS1-201ENST00000600329 579 ntTSL 4 BASIC5.93□□□□□ -1.46
DUSP4Q13115 AL513327.3-201ENST00000602618 469 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
DUSP4Q13115 AC087045.1-201ENST00000605856 382 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
DUSP4Q13115 LINC00343-210ENST00000608220 806 ntTSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
DUSP4Q13115 AL356274.1-201ENST00000617064 410 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
DUSP4Q13115 AC009033.1-201ENST00000624279 431 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
DUSP4Q13115 OR52B4-201ENST00000624801 1124 ntAPPRIS P1 BASIC5.93□□□□□ -1.46
DUSP4Q13115 IFIT1-201ENST00000371804 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
DUSP4Q13115 AC006145.1-201ENST00000439234 2651 ntTSL 2 BASIC5.93□□□□□ -1.46
DUSP4Q13115 CEP128-202ENST00000281129 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
DUSP4Q13115 ATF2-212ENST00000426833 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
DUSP4Q13115 CTAGE5-204ENST00000341749 2912 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
DUSP4Q13115 HHLA2-211ENST00000619531 2548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.93□□□□□ -1.46
DUSP4Q13115 PALMD-203ENST00000605497 1942 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
DUSP4Q13115 TTF2-201ENST00000369466 9462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
DUSP4Q13115 HMMR-202ENST00000358715 2988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
DUSP4Q13115 STXBP4-202ENST00000398391 2160 ntTSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
DUSP4Q13115 AL034370.1-201ENST00000397254 1590 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
DUSP4Q13115 AL034546.1-201ENST00000623740 3693 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
DUSP4Q13115 AC068769.1-201ENST00000474767 2426 ntBASIC5.93□□□□□ -1.46
DUSP4Q13115 SERPINB7-202ENST00000398019 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
DUSP4Q13115 VCAM1-201ENST00000294728 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.93□□□□□ -1.46
DUSP4Q13115 PARD3B-214ENST00000622699 7442 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
DUSP4Q13115 LRRK2-201ENST00000298910 9158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
DUSP4Q13115 GTF2H2B-203ENST00000508065 1432 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
DUSP4Q13115 KCNJ1-206ENST00000440599 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
DUSP4Q13115 SETDB2-201ENST00000258672 2138 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
DUSP4Q13115 CDC27P2-201ENST00000425026 1922 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
DUSP4Q13115 AC131971.1-201ENST00000332881 1482 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
DUSP4Q13115 AC100871.1-201ENST00000507871 1456 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
DUSP4Q13115 CFHR3-206ENST00000617219 1462 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
DUSP4Q13115 LINC02401-201ENST00000550185 3059 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
DUSP4Q13115 FASTKD3-201ENST00000264669 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
DUSP4Q13115 TOX3-202ENST00000407228 3124 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
DUSP4Q13115 CFHR1-201ENST00000320493 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
DUSP4Q13115 IKZF3-202ENST00000346243 1296 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
DUSP4Q13115 Y_RNA.535-201ENST00000384612 99 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
DUSP4Q13115 RNU6-1009P-201ENST00000390996 107 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
DUSP4Q13115 CLEC7A-206ENST00000396484 1000 ntTSL 1 (best) BASIC5.92□□□□□ -1.46
DUSP4Q13115 RPL23AP47-201ENST00000408017 460 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
DUSP4Q13115 MIR1286-201ENST00000408112 78 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
DUSP4Q13115 AC002456.1-201ENST00000415965 317 ntTSL 5 BASIC5.92□□□□□ -1.46
DUSP4Q13115 AC011752.1-203ENST00000417609 582 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
DUSP4Q13115 AP000221.1-201ENST00000419694 1046 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
DUSP4Q13115 AL590999.1-205ENST00000420293 440 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
DUSP4Q13115 GAPDHP49-201ENST00000421421 961 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
DUSP4Q13115 AL109761.1-201ENST00000428689 422 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
DUSP4Q13115 RPL7P29-201ENST00000437151 728 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
DUSP4Q13115 CYCSP12-201ENST00000437729 300 ntBASIC5.92□□□□□ -1.46
DUSP4Q13115 AC092155.1-201ENST00000444672 573 ntTSL 4 BASIC5.92□□□□□ -1.46
DUSP4Q13115 AC073284.1-201ENST00000448086 404 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
DUSP4Q13115 LINC01474-202ENST00000449235 628 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
DUSP4Q13115 MAST4-AS1-201ENST00000451496 777 ntTSL 2 BASIC5.92□□□□□ -1.46
DUSP4Q13115 LINC00430-201ENST00000457672 597 ntTSL 3 BASIC5.92□□□□□ -1.46
DUSP4Q13115 VN1R5-201ENST00000472952 1239 ntAPPRIS P1 BASIC5.92□□□□□ -1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.4 ms