Protein–RNA interactions for Protein: Q13111

CHAF1A, Chromatin assembly factor 1 subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1AQ13111 TTN-AS1-232ENST00000589487 1077 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
CHAF1AQ13111 AC233280.2-201ENST00000603917 1070 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
CHAF1AQ13111 LINC02098-202ENST00000609260 554 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
CHAF1AQ13111 AL591926.2-202ENST00000615199 719 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
CHAF1AQ13111 U3.53-201ENST00000628922 216 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
CHAF1AQ13111 CARF-203ENST00000414439 2099 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
CHAF1AQ13111 NUDCD1-202ENST00000427660 2098 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
CHAF1AQ13111 AC064875.1-201ENST00000425974 1942 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
CHAF1AQ13111 ADAMTS9-AS1-203ENST00000471990 1606 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
CHAF1AQ13111 AL118496.1-201ENST00000440201 1812 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
CHAF1AQ13111 AMY2B-201ENST00000361355 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
CHAF1AQ13111 NSRP1P1-201ENST00000444067 1693 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
CHAF1AQ13111 OR4E2-202ENST00000641524 2855 ntAPPRIS P1 BASIC5.69□□□□□ -1.5
CHAF1AQ13111 AC092447.5-201ENST00000429367 2741 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
CHAF1AQ13111 KTN1-223ENST00000555573 1712 ntTSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
CHAF1AQ13111 CASC19-204ENST00000641001 2055 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
CHAF1AQ13111 CLCA1-201ENST00000234701 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
CHAF1AQ13111 ENPP3-201ENST00000357639 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
CHAF1AQ13111 ADGRL2-201ENST00000319517 5479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
CHAF1AQ13111 AL672167.1-205ENST00000641112 3080 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
CHAF1AQ13111 KIF3A-203ENST00000403231 2181 ntTSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
CHAF1AQ13111 TATDN1-201ENST00000276692 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
CHAF1AQ13111 SNORA71.2-201ENST00000364941 134 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
CHAF1AQ13111 AL590762.2-201ENST00000395798 571 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
CHAF1AQ13111 VN1R51P-201ENST00000411675 945 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
CHAF1AQ13111 AL354726.1-201ENST00000411981 402 ntTSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
CHAF1AQ13111 ZNF736P7Y-201ENST00000425158 820 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
CHAF1AQ13111 RPS26P47-201ENST00000427219 348 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
CHAF1AQ13111 AC009263.1-201ENST00000441193 1239 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
CHAF1AQ13111 RPS7P5-201ENST00000441482 581 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
CHAF1AQ13111 MTOR-AS1-202ENST00000445982 705 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
CHAF1AQ13111 GHRL-209ENST00000446937 217 ntTSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
CHAF1AQ13111 AL050341.1-201ENST00000447743 313 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
CHAF1AQ13111 AL021393.1-201ENST00000456740 539 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
CHAF1AQ13111 RPL37P3-201ENST00000456825 293 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
CHAF1AQ13111 FTH1P2-201ENST00000466086 412 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
CHAF1AQ13111 AC104763.1-201ENST00000475274 360 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
CHAF1AQ13111 NDUFB2-213ENST00000476470 482 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
CHAF1AQ13111 LINC02000-201ENST00000483245 640 ntTSL 2 BASIC5.68□□□□□ -1.5
CHAF1AQ13111 TBCA-203ENST00000517679 545 ntTSL 3 BASIC5.68□□□□□ -1.5
CHAF1AQ13111 OR5M1-201ENST00000526538 948 ntAPPRIS P1 BASIC5.68□□□□□ -1.5
CHAF1AQ13111 AP002518.2-201ENST00000544925 393 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
CHAF1AQ13111 RAD51AP1-213ENST00000544927 787 ntTSL 4 BASIC5.68□□□□□ -1.5
CHAF1AQ13111 ZFAND6-204ENST00000558087 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
CHAF1AQ13111 CSNK1A1P1-202ENST00000563423 981 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
CHAF1AQ13111 AC090312.2-201ENST00000582687 378 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
CHAF1AQ13111 VN1R87P-201ENST00000596706 487 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
CHAF1AQ13111 AC100781.1-203ENST00000598549 399 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
CHAF1AQ13111 AL133338.2-201ENST00000604292 736 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
CHAF1AQ13111 AC018754.1-201ENST00000607486 925 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
CHAF1AQ13111 AC023509.5-201ENST00000617434 807 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
CHAF1AQ13111 CR392039.4-201ENST00000624968 501 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
CHAF1AQ13111 ATE1-AS1-202ENST00000636460 506 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
CHAF1AQ13111 SLAIN2-205ENST00000512093 4219 ntTSL 5 BASIC5.68□□□□□ -1.5
CHAF1AQ13111 C17orf78-204ENST00000615133 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
CHAF1AQ13111 AL645568.2-201ENST00000432815 1337 ntBASIC5.68□□□□□ -1.5
CHAF1AQ13111 TRIM69-201ENST00000329464 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.68□□□□□ -1.5
CHAF1AQ13111 MTCO1P6-201ENST00000481192 1384 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
CHAF1AQ13111 AC108467.2-201ENST00000617640 1597 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
CHAF1AQ13111 AC022031.1-201ENST00000585985 2593 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
CHAF1AQ13111 PMP2-201ENST00000256103 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
CHAF1AQ13111 CXCL11-201ENST00000306621 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
CHAF1AQ13111 ING3-201ENST00000315870 3777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
CHAF1AQ13111 PSMD1-213ENST00000619128 3161 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
CHAF1AQ13111 MAPK10-208ENST00000395169 4049 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
CHAF1AQ13111 CP-201ENST00000264613 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
CHAF1AQ13111 IFNA21-201ENST00000380225 1024 ntAPPRIS P1 BASIC5.67□□□□□ -1.5
CHAF1AQ13111 MIR525-201ENST00000384978 85 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
CHAF1AQ13111 MIR122-201ENST00000385044 85 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
CHAF1AQ13111 AP000580.1-201ENST00000404439 358 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
CHAF1AQ13111 FBXO11-203ENST00000405808 299 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
CHAF1AQ13111 ELOCP19-201ENST00000411919 318 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
CHAF1AQ13111 OR51B3P-201ENST00000412287 913 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
CHAF1AQ13111 EFCAB14-AS1-201ENST00000418985 491 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
CHAF1AQ13111 TCEA1P2-201ENST00000420496 906 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
CHAF1AQ13111 NLGN1-AS1-201ENST00000423873 815 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
CHAF1AQ13111 AP001324.1-201ENST00000428553 399 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
CHAF1AQ13111 RPL12P28-201ENST00000430852 489 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
CHAF1AQ13111 MIR4435-2HG-206ENST00000432818 572 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
CHAF1AQ13111 AL139327.2-202ENST00000437057 400 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
CHAF1AQ13111 NUDT7-202ENST00000437314 930 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
CHAF1AQ13111 LINC02013-201ENST00000438156 526 ntTSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
CHAF1AQ13111 TMSB4X-204ENST00000451311 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
CHAF1AQ13111 LINC01768-201ENST00000453347 476 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
CHAF1AQ13111 MME-AS1-201ENST00000484721 828 ntTSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
CHAF1AQ13111 AC083829.1-201ENST00000503756 657 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
CHAF1AQ13111 SUMO2P5-201ENST00000506790 245 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
CHAF1AQ13111 LINC02201-203ENST00000514657 674 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
CHAF1AQ13111 AC097535.1-201ENST00000515263 332 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
CHAF1AQ13111 CARD8-211ENST00000519332 500 ntTSL 1 (best) BASIC5.67□□□□□ -1.5
CHAF1AQ13111 RPL23AP53-201ENST00000521854 457 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
CHAF1AQ13111 AC022882.1-201ENST00000532142 501 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
CHAF1AQ13111 G2E3-AS1-201ENST00000548631 579 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
CHAF1AQ13111 AC126178.1-201ENST00000548722 926 ntTSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
CHAF1AQ13111 AC073525.1-201ENST00000549762 543 ntTSL 3 BASIC5.67□□□□□ -1.5
CHAF1AQ13111 AC020612.3-201ENST00000550644 570 ntTSL 2 BASIC5.67□□□□□ -1.5
CHAF1AQ13111 AL355075.3-201ENST00000554678 492 ntTSL 5 BASIC5.67□□□□□ -1.5
CHAF1AQ13111 AL583810.3-201ENST00000555713 584 ntTSL 4 BASIC5.67□□□□□ -1.5
CHAF1AQ13111 AC087477.6-201ENST00000559595 843 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
CHAF1AQ13111 AC084783.1-201ENST00000565846 910 ntBASIC5.67□□□□□ -1.5
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