Protein–RNA interactions for Protein: Q13099

IFT88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, humanhuman

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT88Q13099 USP50-205ENST00000616326 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.33□□□□□ -1.72
IFT88Q13099 MUCL1-201ENST00000308796 470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
IFT88Q13099 RNA5SP189-201ENST00000364920 115 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
IFT88Q13099 OR51F1-201ENST00000380383 960 ntAPPRIS P5 BASIC4.33□□□□□ -1.72
IFT88Q13099 RNU6-356P-201ENST00000384140 107 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
IFT88Q13099 RNA5SP87-201ENST00000384155 118 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
IFT88Q13099 SNORD66.1-201ENST00000391230 76 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
IFT88Q13099 RN7SKP106-201ENST00000410832 272 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
IFT88Q13099 AC004022.2-201ENST00000413824 193 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
IFT88Q13099 AC009237.5-201ENST00000414271 501 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
IFT88Q13099 AC098484.2-201ENST00000414339 601 ntTSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
IFT88Q13099 MTND4P11-201ENST00000417020 1058 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
IFT88Q13099 DNAJA1P1-201ENST00000425106 1187 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
IFT88Q13099 AL121578.1-201ENST00000428051 892 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
IFT88Q13099 AC008065.1-201ENST00000428525 348 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
IFT88Q13099 AL683807.1-202ENST00000432272 382 ntTSL 2 BASIC4.33□□□□□ -1.72
IFT88Q13099 LINC01826-201ENST00000432894 584 ntTSL 4 BASIC4.33□□□□□ -1.72
IFT88Q13099 AP000855.1-201ENST00000433210 636 ntTSL 2 BASIC4.33□□□□□ -1.72
IFT88Q13099 REG1CP-203ENST00000434852 460 ntTSL 4 BASIC4.33□□□□□ -1.72
IFT88Q13099 CBX1P4-201ENST00000439415 457 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
IFT88Q13099 AL162419.1-201ENST00000440674 873 ntTSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
IFT88Q13099 AC074327.1-202ENST00000443523 369 ntTSL 2 BASIC4.33□□□□□ -1.72
IFT88Q13099 AC009158.1-205ENST00000452511 895 ntTSL 3 BASIC4.33□□□□□ -1.72
IFT88Q13099 RN7SL610P-201ENST00000463845 291 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
IFT88Q13099 AC104629.2-201ENST00000468627 598 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
IFT88Q13099 RPL7L1P8-201ENST00000469911 741 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
IFT88Q13099 FTH1P24-201ENST00000503502 462 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
IFT88Q13099 LINC01088-203ENST00000507476 785 ntTSL 3 BASIC4.33□□□□□ -1.72
IFT88Q13099 SPINK9-202ENST00000511717 604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.33□□□□□ -1.72
IFT88Q13099 OR7H2P-201ENST00000513483 306 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
IFT88Q13099 LINC02459-201ENST00000551761 474 ntTSL 3 BASIC4.33□□□□□ -1.72
IFT88Q13099 DUXA-201ENST00000554048 1006 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.33□□□□□ -1.72
IFT88Q13099 C18orf32-202ENST00000582392 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.33□□□□□ -1.72
IFT88Q13099 AC007448.2-201ENST00000583452 380 ntTSL 3 BASIC4.33□□□□□ -1.72
IFT88Q13099 AC005899.1-201ENST00000584125 563 ntTSL 5 BASIC4.33□□□□□ -1.72
IFT88Q13099 MIR4527HG-203ENST00000600127 704 ntTSL 5 BASIC4.33□□□□□ -1.72
IFT88Q13099 C5orf63-207ENST00000606937 607 ntTSL 2 BASIC4.33□□□□□ -1.72
IFT88Q13099 AL162591.3-201ENST00000607963 681 ntTSL 3 BASIC4.33□□□□□ -1.72
IFT88Q13099 LINC02340-201ENST00000610335 626 ntTSL 3 BASIC4.33□□□□□ -1.72
IFT88Q13099 MIR486-1-201ENST00000612171 68 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
IFT88Q13099 AL391261.4-201ENST00000616012 481 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
IFT88Q13099 SMARCA2-231ENST00000634931 939 ntTSL 5 BASIC4.33□□□□□ -1.72
IFT88Q13099 U6.98-201ENST00000637157 84 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
IFT88Q13099 OR5H15-202ENST00000641450 1229 ntAPPRIS P1 BASIC4.33□□□□□ -1.72
IFT88Q13099 KCNJ1-202ENST00000324036 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
IFT88Q13099 MGA-201ENST00000219905 12042 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC4.33□□□□□ -1.72
IFT88Q13099 OSBPL6-201ENST00000190611 10513 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
IFT88Q13099 PDE1A-202ENST00000358139 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.33□□□□□ -1.72
IFT88Q13099 LINC00907-209ENST00000593234 3376 ntTSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
IFT88Q13099 FAM81B-201ENST00000283357 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
IFT88Q13099 AL353743.4-201ENST00000422653 1547 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
IFT88Q13099 ABCC9-201ENST00000261200 8293 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.32□□□□□ -1.72
IFT88Q13099 MME-201ENST00000360490 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
IFT88Q13099 KCNJ13-201ENST00000233826 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
IFT88Q13099 RNA5SP397-201ENST00000391323 118 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
IFT88Q13099 MIR937-201ENST00000401271 86 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
IFT88Q13099 OTUD6B-202ENST00000404789 1089 ntTSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
IFT88Q13099 HSPE1P26-201ENST00000405341 275 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
IFT88Q13099 CEBPZOS-205ENST00000406711 687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.32□□□□□ -1.72
IFT88Q13099 MTHFD2P2-201ENST00000407725 247 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
IFT88Q13099 Z98941.1-201ENST00000407764 100 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
IFT88Q13099 MTND2P15-201ENST00000418575 892 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
IFT88Q13099 LPP-AS1-201ENST00000434996 494 ntTSL 3 BASIC4.32□□□□□ -1.72
IFT88Q13099 AC068491.2-201ENST00000438897 617 ntTSL 2 BASIC4.32□□□□□ -1.72
IFT88Q13099 YWHAZP2-201ENST00000440317 728 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
IFT88Q13099 MTCYBP12-201ENST00000440559 1134 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
IFT88Q13099 AL162591.2-201ENST00000449634 317 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
IFT88Q13099 AC009963.2-201ENST00000453431 138 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
IFT88Q13099 LINC01878-202ENST00000453965 405 ntTSL 3 BASIC4.32□□□□□ -1.72
IFT88Q13099 AL136097.1-201ENST00000456945 913 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
IFT88Q13099 AC146507.1-201ENST00000468335 354 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
IFT88Q13099 MRPS33-209ENST00000496958 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.32□□□□□ -1.72
IFT88Q13099 AC069360.1-201ENST00000503469 431 ntTSL 2 BASIC4.32□□□□□ -1.72
IFT88Q13099 NDUFA5P12-201ENST00000503796 343 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
IFT88Q13099 AC108043.1-201ENST00000512696 574 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
IFT88Q13099 OSGEPL1-AS1-203ENST00000523895 567 ntTSL 4 BASIC4.32□□□□□ -1.72
IFT88Q13099 AL035078.3-201ENST00000525382 241 ntTSL 3 BASIC4.32□□□□□ -1.72
IFT88Q13099 AC021351.1-201ENST00000560886 652 ntTSL 5 BASIC4.32□□□□□ -1.72
IFT88Q13099 AC103808.1-201ENST00000579833 922 ntTSL 3 BASIC4.32□□□□□ -1.72
IFT88Q13099 AP005121.1-202ENST00000584414 555 ntTSL 2 BASIC4.32□□□□□ -1.72
IFT88Q13099 C8orf89-201ENST00000613105 495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
IFT88Q13099 NF1P10-201ENST00000613227 742 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
IFT88Q13099 AC243585.1-201ENST00000617867 607 ntTSL 3 BASIC4.32□□□□□ -1.72
IFT88Q13099 AC007342.8-201ENST00000623278 678 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
IFT88Q13099 AC084357.3-201ENST00000541353 2751 ntTSL 5 BASIC4.31□□□□□ -1.72
IFT88Q13099 TFPI-201ENST00000233156 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.31□□□□□ -1.72
IFT88Q13099 ERBIN-203ENST00000380938 4701 ntTSL 2 BASIC4.31□□□□□ -1.72
IFT88Q13099 GPR174-201ENST00000276077 1258 ntAPPRIS P1 BASIC4.31□□□□□ -1.72
IFT88Q13099 SNORA31-201ENST00000362607 130 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
IFT88Q13099 TRPM3-206ENST00000377097 554 ntTSL 2 BASIC4.31□□□□□ -1.72
IFT88Q13099 OR51I1-201ENST00000380211 945 ntAPPRIS P1 BASIC4.31□□□□□ -1.72
IFT88Q13099 RNU6ATAC5P-201ENST00000388104 126 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
IFT88Q13099 TAS2R31-201ENST00000390675 1021 ntAPPRIS P1 BASIC4.31□□□□□ -1.72
IFT88Q13099 MIR550A3-201ENST00000390735 95 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
IFT88Q13099 AL607077.1-201ENST00000401718 499 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
IFT88Q13099 AP000357.1-201ENST00000409926 1165 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
IFT88Q13099 GNG12-AS1-202ENST00000414904 796 ntTSL 3 BASIC4.31□□□□□ -1.72
IFT88Q13099 AC006455.6-201ENST00000426192 893 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
IFT88Q13099 NPM1P34-201ENST00000428821 893 ntBASIC4.31□□□□□ -1.72
IFT88Q13099 AC005828.1-201ENST00000431604 524 ntTSL 5 BASIC4.31□□□□□ -1.72
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