Protein–RNA interactions for Protein: Q13098

GPS1, COP9 signalosome complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPS1Q13098 AP003461.1-201ENST00000528866 78 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
GPS1Q13098 AL035078.2-201ENST00000533832 326 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
GPS1Q13098 RERGL-202ENST00000536890 367 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
GPS1Q13098 DUXAP1-201ENST00000556632 463 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
GPS1Q13098 AC109630.1-202ENST00000560552 579 ntTSL 4 BASIC5.02□□□□□ -1.61
GPS1Q13098 AC131274.1-201ENST00000582507 254 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
GPS1Q13098 AC004223.2-201ENST00000590309 544 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
GPS1Q13098 MAPKAPK5-AS1-205ENST00000590479 543 ntTSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
GPS1Q13098 AC067968.2-201ENST00000592583 566 ntTSL 4 BASIC5.02□□□□□ -1.61
GPS1Q13098 Z98949.1-211ENST00000596813 773 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
GPS1Q13098 IMMP1LP3-201ENST00000604197 224 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
GPS1Q13098 AC010998.2-201ENST00000605549 625 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
GPS1Q13098 AL356056.1-205ENST00000608904 651 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
GPS1Q13098 AC018793.1-201ENST00000638166 585 ntAPPRIS P1 BASIC5.02□□□□□ -1.61
GPS1Q13098 PARP11-201ENST00000228820 4424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
GPS1Q13098 PARP11-203ENST00000427057 4406 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
GPS1Q13098 PTPN13-201ENST00000316707 7546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
GPS1Q13098 AGTR1-205ENST00000461609 1545 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
GPS1Q13098 AJ009632.2-202ENST00000634644 1513 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
GPS1Q13098 ERGIC2-201ENST00000360150 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
GPS1Q13098 AL359922.3-201ENST00000624779 1670 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
GPS1Q13098 TEX11-201ENST00000344304 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
GPS1Q13098 HELLS-204ENST00000371332 2675 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
GPS1Q13098 TPTE2-205ENST00000400230 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
GPS1Q13098 AP3B1-204ENST00000519295 3986 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
GPS1Q13098 AC005332.5-201ENST00000591222 2919 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
GPS1Q13098 C11orf74-202ENST00000347206 633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
GPS1Q13098 RNU6-839P-201ENST00000363347 108 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
GPS1Q13098 OR14A2-201ENST00000366485 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.01□□□□□ -1.61
GPS1Q13098 RSL24D1P4-201ENST00000400938 484 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
GPS1Q13098 AL391361.1-201ENST00000405580 489 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
GPS1Q13098 U3.35-201ENST00000408405 208 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
GPS1Q13098 ARSD-AS1-201ENST00000414053 816 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
GPS1Q13098 AC073521.1-201ENST00000418679 625 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
GPS1Q13098 AC006960.1-201ENST00000419980 153 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
GPS1Q13098 RPL7P44-201ENST00000424827 742 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
GPS1Q13098 AL159174.1-202ENST00000425588 442 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
GPS1Q13098 FABP7P2-201ENST00000429946 379 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
GPS1Q13098 LINC02257-202ENST00000433576 720 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
GPS1Q13098 AC004938.1-201ENST00000438468 308 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
GPS1Q13098 AC004824.1-201ENST00000439577 311 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
GPS1Q13098 MRPL48P1-201ENST00000445390 636 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
GPS1Q13098 COX6CP18-201ENST00000448769 222 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
GPS1Q13098 FAR2P1-206ENST00000449736 709 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
GPS1Q13098 Z99714.1-201ENST00000450463 807 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
GPS1Q13098 RPL21P134-201ENST00000453468 483 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
GPS1Q13098 AL389915.2-201ENST00000454576 441 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
GPS1Q13098 RPL37P3-201ENST00000456825 293 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
GPS1Q13098 AL359915.2-203ENST00000457043 540 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
GPS1Q13098 AC108751.2-201ENST00000469993 231 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
GPS1Q13098 AC108734.3-201ENST00000481241 1165 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
GPS1Q13098 RN7SL244P-201ENST00000493405 297 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
GPS1Q13098 GYPA-204ENST00000504786 357 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
GPS1Q13098 ZNF131-215ENST00000509931 970 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
GPS1Q13098 LINC02265-201ENST00000510551 957 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
GPS1Q13098 LINC02201-203ENST00000514657 674 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
GPS1Q13098 TATDN1-202ENST00000517678 815 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
GPS1Q13098 KCTD21-AS1-206ENST00000532831 856 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
GPS1Q13098 AC107918.3-201ENST00000533272 382 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
GPS1Q13098 AP000619.3-201ENST00000535634 1127 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
GPS1Q13098 LINC02443-204ENST00000544717 754 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
GPS1Q13098 AL442163.2-201ENST00000553912 710 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
GPS1Q13098 OR11J2P-201ENST00000555298 907 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
GPS1Q13098 AL355076.2-201ENST00000555736 544 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
GPS1Q13098 AC026462.4-202ENST00000564331 532 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
GPS1Q13098 AC087399.1-201ENST00000579769 573 ntTSL 4 BASIC5.01□□□□□ -1.61
GPS1Q13098 AC005324.5-201ENST00000584540 571 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
GPS1Q13098 AC024592.1-202ENST00000590441 341 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
GPS1Q13098 AC092683.1-203ENST00000594050 654 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
GPS1Q13098 RNF138P2-201ENST00000603490 592 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
GPS1Q13098 AL512329.2-201ENST00000607350 548 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
GPS1Q13098 AC022467.1-201ENST00000614738 749 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
GPS1Q13098 AC044839.1-205ENST00000614989 542 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
GPS1Q13098 AC015804.1-201ENST00000622935 435 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
GPS1Q13098 TTN-AS1-267ENST00000628826 662 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
GPS1Q13098 DUXB-201ENST00000633875 1079 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
GPS1Q13098 PLCE1-202ENST00000371380 12024 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
GPS1Q13098 TLR8-201ENST00000218032 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
GPS1Q13098 AC008758.3-201ENST00000507003 1829 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
GPS1Q13098 OR10K1-203ENST00000641432 3775 ntAPPRIS P1 BASIC5.01□□□□□ -1.61
GPS1Q13098 MLIP-213ENST00000514921 5743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
GPS1Q13098 TPTE2-202ENST00000382978 1677 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
GPS1Q13098 VDAC3-201ENST00000022615 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
GPS1Q13098 YWHAZ-219ENST00000522542 1394 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
GPS1Q13098 BTBD10P1-201ENST00000549824 1352 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
GPS1Q13098 OTOGL-204ENST00000547103 8032 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
GPS1Q13098 FAM184A-204ENST00000368475 3392 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
GPS1Q13098 PCDH11X-207ENST00000406881 4156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
GPS1Q13098 LINC02240-201ENST00000564199 1336 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
GPS1Q13098 ZNF207-203ENST00000394670 13781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
GPS1Q13098 CSMD3-201ENST00000297405 13212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
GPS1Q13098 RAP1B-201ENST00000250559 13438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
GPS1Q13098 OR8B3-202ENST00000641139 2170 ntAPPRIS P1 BASIC5□□□□□ -1.61
GPS1Q13098 SNURFL-201ENST00000309296 343 ntBASIC5□□□□□ -1.61
GPS1Q13098 OR2AE1-201ENST00000316368 1071 ntAPPRIS P1 BASIC5□□□□□ -1.61
GPS1Q13098 RNU6-178P-201ENST00000384631 104 ntBASIC5□□□□□ -1.61
GPS1Q13098 MIR217-201ENST00000384817 110 ntBASIC5□□□□□ -1.61
GPS1Q13098 IGLJ6-201ENST00000390328 70 ntAPPRIS P1 BASIC5□□□□□ -1.61
GPS1Q13098 C2orf73-203ENST00000405749 576 ntTSL 4 BASIC5□□□□□ -1.61
GPS1Q13098 RNA5SP80-201ENST00000410475 111 ntBASIC5□□□□□ -1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105.6 ms