Protein–RNA interactions for Protein: Q13002

GRIK2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, humanhuman

Predictions only

Length 908 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK2Q13002 E2F6P2-201ENST00000420708 748 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
GRIK2Q13002 AL158166.2-201ENST00000420845 748 ntTSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
GRIK2Q13002 AL391069.1-201ENST00000422153 358 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
GRIK2Q13002 AL451139.1-201ENST00000434718 346 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
GRIK2Q13002 RPL7P29-201ENST00000437151 728 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
GRIK2Q13002 AC239367.2-201ENST00000447309 705 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
GRIK2Q13002 TPTE2P6-203ENST00000450973 649 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
GRIK2Q13002 OFD1P3Y-201ENST00000453312 783 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
GRIK2Q13002 RPS6P2-201ENST00000454208 705 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
GRIK2Q13002 AL122008.1-201ENST00000456078 452 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
GRIK2Q13002 RPL7P32-201ENST00000457119 744 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
GRIK2Q13002 RPL7AP52-201ENST00000458096 790 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
GRIK2Q13002 RPL7AP28-201ENST00000464513 571 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
GRIK2Q13002 IGKV2D-30-201ENST00000474213 395 ntAPPRIS P1 BASIC4.69□□□□□ -1.66
GRIK2Q13002 RPL21P6-201ENST00000479171 504 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
GRIK2Q13002 RPL7AP10-201ENST00000481016 791 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
GRIK2Q13002 AC104687.1-201ENST00000485829 412 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
GRIK2Q13002 LNCSRLR-201ENST00000490375 709 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
GRIK2Q13002 AL136537.1-202ENST00000501725 430 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
GRIK2Q13002 AC093752.1-206ENST00000511823 336 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
GRIK2Q13002 AC026402.1-201ENST00000513642 170 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
GRIK2Q13002 HMGB1P19-201ENST00000517578 577 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
GRIK2Q13002 AC027419.2-201ENST00000518439 497 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
GRIK2Q13002 AC002428.2-201ENST00000522973 414 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
GRIK2Q13002 AC078906.1-201ENST00000523602 798 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
GRIK2Q13002 AC083923.1-201ENST00000523708 376 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
GRIK2Q13002 VNN2-207ENST00000525289 900 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
GRIK2Q13002 AP001781.1-201ENST00000530977 207 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
GRIK2Q13002 AL133304.2-201ENST00000546376 886 ntTSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
GRIK2Q13002 AL158801.3-201ENST00000555514 363 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
GRIK2Q13002 AL136501.1-201ENST00000555913 790 ntTSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
GRIK2Q13002 RPL21P7-201ENST00000557463 483 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
GRIK2Q13002 MTCYBP23-201ENST00000558717 1102 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
GRIK2Q13002 AC090607.1-201ENST00000560057 449 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
GRIK2Q13002 ALOX12P2-208ENST00000574183 519 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
GRIK2Q13002 LINC02186-201ENST00000575767 885 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
GRIK2Q13002 AC090371.2-203ENST00000578782 473 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
GRIK2Q13002 SNORA74C-1-201ENST00000580726 201 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
GRIK2Q13002 AC007993.3-202ENST00000585329 725 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
GRIK2Q13002 AC092316.1-201ENST00000598703 297 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
GRIK2Q13002 AL365400.2-201ENST00000605604 902 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
GRIK2Q13002 AC010857.1-201ENST00000606398 594 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
GRIK2Q13002 AC013468.1-201ENST00000608680 598 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
GRIK2Q13002 AC100847.1-201ENST00000611316 481 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
GRIK2Q13002 AC140113.4-201ENST00000622087 222 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
GRIK2Q13002 AC068787.1-201ENST00000623908 691 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
GRIK2Q13002 AC011944.2-201ENST00000624440 683 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
GRIK2Q13002 AC008993.2-201ENST00000631744 806 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
GRIK2Q13002 AC009951.2-201ENST00000634873 644 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
GRIK2Q13002 LINC01808-202ENST00000641680 1116 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
GRIK2Q13002 TECRL-201ENST00000381210 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
GRIK2Q13002 TRIM69-201ENST00000329464 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
GRIK2Q13002 U2SURP-214ENST00000493598 3491 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
GRIK2Q13002 PMCHL2-201ENST00000415808 1841 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
GRIK2Q13002 AKAP4-201ENST00000358526 2881 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
GRIK2Q13002 IFI16-203ENST00000359709 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
GRIK2Q13002 PTPN22-201ENST00000359785 3654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
GRIK2Q13002 GRAMD2B-210ENST00000511134 1577 ntTSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
GRIK2Q13002 FOXP2-220ENST00000634411 4065 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
GRIK2Q13002 CTNNA3-203ENST00000433211 10675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
GRIK2Q13002 ZFX-203ENST00000379177 7558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
GRIK2Q13002 NEAT1-202ENST00000501122 22743 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
GRIK2Q13002 GPR85-201ENST00000297146 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
GRIK2Q13002 MED12L-201ENST00000273432 6401 ntTSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
GRIK2Q13002 EXOC1-202ENST00000349598 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC4.68□□□□□ -1.66
GRIK2Q13002 MMRN1-204ENST00000508372 3234 ntTSL 2 BASIC4.68□□□□□ -1.66
GRIK2Q13002 OR2L5-201ENST00000355281 2429 ntAPPRIS P1 BASIC4.68□□□□□ -1.66
GRIK2Q13002 CDH17-201ENST00000027335 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
GRIK2Q13002 SCN1A-220ENST00000641603 12506 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
GRIK2Q13002 CTSS-201ENST00000368985 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
GRIK2Q13002 AP001273.1-201ENST00000624493 3152 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
GRIK2Q13002 AC005332.5-201ENST00000591222 2919 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
GRIK2Q13002 TLR8-201ENST00000218032 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
GRIK2Q13002 MS4A14-203ENST00000395005 2813 ntTSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
GRIK2Q13002 RNA5SP509-201ENST00000364577 119 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
GRIK2Q13002 UBE2U-201ENST00000371076 1136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
GRIK2Q13002 RNU1-82P-201ENST00000390851 165 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
GRIK2Q13002 ARL4A-204ENST00000396664 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
GRIK2Q13002 MIR921-201ENST00000401133 56 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
GRIK2Q13002 DNAJC19P6-201ENST00000401853 280 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
GRIK2Q13002 RPL7P27-201ENST00000403775 720 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
GRIK2Q13002 FBXO11-203ENST00000405808 299 ntTSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
GRIK2Q13002 ZNF602P-201ENST00000405929 924 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
GRIK2Q13002 RPS3AP25-201ENST00000411660 793 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
GRIK2Q13002 AL590385.1-201ENST00000419446 462 ntTSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
GRIK2Q13002 SLC4A1APP1-201ENST00000419995 602 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
GRIK2Q13002 AL645608.4-201ENST00000423619 154 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
GRIK2Q13002 AC009226.1-201ENST00000432413 539 ntTSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
GRIK2Q13002 RPS17P8-201ENST00000434525 335 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
GRIK2Q13002 AL590867.3-201ENST00000436953 438 ntTSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
GRIK2Q13002 AC072062.1-204ENST00000437897 1132 ntTSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
GRIK2Q13002 DMD-AS3-201ENST00000439592 293 ntTSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
GRIK2Q13002 CBX1P1-201ENST00000440184 427 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
GRIK2Q13002 SPANXN4-202ENST00000446864 431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
GRIK2Q13002 AC009365.2-201ENST00000453078 799 ntTSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
GRIK2Q13002 FAM107B-218ENST00000479731 570 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
GRIK2Q13002 AC093824.1-201ENST00000508796 343 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
GRIK2Q13002 AC011405.1-201ENST00000514207 248 ntTSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
GRIK2Q13002 MIR100HG-213ENST00000531470 560 ntTSL 4 BASIC4.68□□□□□ -1.66
GRIK2Q13002 AP002812.4-201ENST00000532139 286 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.8 ms