Protein–RNA interactions for Protein: P29536

LMOD1, Leiomodin-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 600 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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LMOD1P29536 PDE1A-202ENST00000358139 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
LMOD1P29536 ZSCAN26-201ENST00000316606 2362 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
LMOD1P29536 GRIA3-207ENST00000620443 4943 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
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LMOD1P29536 GYPA-209ENST00000512789 258 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
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LMOD1P29536 BEND2-201ENST00000380030 1938 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
LMOD1P29536 OR7C1-204ENST00000642000 11290 ntAPPRIS P1 BASIC7.22□□□□□ -1.25
LMOD1P29536 HORMAD2-202ENST00000403975 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
LMOD1P29536 SMARCE1-208ENST00000474246 2124 ntTSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
LMOD1P29536 AXDND1-201ENST00000367618 3642 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
LMOD1P29536 PABPC1P6-201ENST00000445594 1829 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
LMOD1P29536 ROR1-AS1-202ENST00000424995 2189 ntTSL 2 BASIC7.22□□□□□ -1.25
LMOD1P29536 GYPE-201ENST00000358615 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.22□□□□□ -1.25
LMOD1P29536 AC134882.1-201ENST00000603738 1676 ntBASIC7.22□□□□□ -1.25
LMOD1P29536 MTND4P12-201ENST00000498999 1377 ntBASIC7.21□□□□□ -1.25
LMOD1P29536 CPB2-201ENST00000181383 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
LMOD1P29536 SREK1IP1-204ENST00000513458 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.25
LMOD1P29536 OR2M3-202ENST00000641626 9913 ntAPPRIS P1 BASIC7.21□□□□□ -1.25
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LMOD1P29536 PRKDC-202ENST00000338368 12784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
LMOD1P29536 HEPH-206ENST00000441993 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
LMOD1P29536 DCTN5-201ENST00000300087 11011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
LMOD1P29536 MIR433-201ENST00000384837 93 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
LMOD1P29536 DNAJA1P3-201ENST00000399417 1194 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
LMOD1P29536 AL133270.1-201ENST00000402635 279 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
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