Protein–RNA interactions for Protein: P23469

PTPRE, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, humanhuman

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Length 700 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPREP23469 AC012175.1-201ENST00000603755 531 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
PTPREP23469 AC243919.1-201ENST00000613086 785 ntTSL 5 BASIC7.86□□□□□ -1.15
PTPREP23469 AC011890.2-201ENST00000613393 294 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
PTPREP23469 AC018926.3-201ENST00000618841 406 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
PTPREP23469 PHLPP2-201ENST00000393524 8467 ntTSL 2 BASIC7.86□□□□□ -1.15
PTPREP23469 NPIPB8-202ENST00000529716 2058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.86□□□□□ -1.15
PTPREP23469 AC093155.3-201ENST00000370548 2013 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.86□□□□□ -1.15
PTPREP23469 OSBPL9P1-201ENST00000604744 1469 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
PTPREP23469 FMO4-201ENST00000367749 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
PTPREP23469 OGT-202ENST00000373719 5461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
PTPREP23469 ARHGAP42P1-201ENST00000507474 1976 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
PTPREP23469 ALB-219ENST00000621085 1418 ntTSL 5 BASIC7.86□□□□□ -1.15
PTPREP23469 ST7-206ENST00000393447 2182 ntTSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
PTPREP23469 SATL1-201ENST00000395409 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.86□□□□□ -1.15
PTPREP23469 AP1M1-201ENST00000291439 13193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
PTPREP23469 MROH3P-201ENST00000435735 2676 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
PTPREP23469 ZMYM4-201ENST00000314607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.85□□□□□ -1.15
PTPREP23469 XPO1-202ENST00000404992 4105 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.85□□□□□ -1.15
PTPREP23469 EPB41L2-209ENST00000525193 2121 ntTSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
PTPREP23469 CTNND1-218ENST00000528232 5745 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
PTPREP23469 PRND-201ENST00000305817 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
PTPREP23469 TATDN2P3-201ENST00000452855 3665 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
PTPREP23469 ZFHX4-204ENST00000518282 12175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
PTPREP23469 FAM208A-210ENST00000614531 3441 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
PTPREP23469 ENTPD1-205ENST00000453258 5044 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
PTPREP23469 RNU6-1252P-201ENST00000363054 104 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
PTPREP23469 Y_RNA.180-201ENST00000363867 113 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
PTPREP23469 RNU6-450P-201ENST00000364654 107 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
PTPREP23469 RNU6-657P-201ENST00000383904 107 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
PTPREP23469 AL606923.1-201ENST00000406616 190 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
PTPREP23469 AC112721.2-201ENST00000409910 541 ntTSL 4 BASIC7.85□□□□□ -1.15
PTPREP23469 VDAC1P9-201ENST00000412766 841 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
PTPREP23469 PGBD4P6-201ENST00000421501 610 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
PTPREP23469 RPL21P91-201ENST00000429231 479 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
PTPREP23469 AL121872.1-202ENST00000435867 308 ntTSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
PTPREP23469 AL121871.1-201ENST00000443413 436 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
PTPREP23469 AC044784.2-201ENST00000447297 366 ntTSL 3 BASIC7.85□□□□□ -1.15
PTPREP23469 OR1H1P-201ENST00000448731 937 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
PTPREP23469 LINC02540-201ENST00000455554 570 ntTSL 3 BASIC7.85□□□□□ -1.15
PTPREP23469 NDUFAF4P3-201ENST00000456468 525 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
PTPREP23469 AC079168.1-201ENST00000458741 345 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
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PTPREP23469 AC128716.1-201ENST00000475129 166 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
PTPREP23469 AL035404.1-201ENST00000497982 568 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
PTPREP23469 SUMO2P4-201ENST00000504193 276 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
PTPREP23469 IGHV3-63-201ENST00000518422 341 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
PTPREP23469 AC083923.2-201ENST00000519880 574 ntTSL 4 BASIC7.85□□□□□ -1.15
PTPREP23469 AC005363.1-201ENST00000530779 351 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
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PTPREP23469 AC106729.1-201ENST00000567777 466 ntTSL 3 BASIC7.85□□□□□ -1.15
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PTPREP23469 CT45A7-202ENST00000620885 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
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PTPREP23469 AC120057.5-201ENST00000623840 154 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
PTPREP23469 AC111152.1-202ENST00000635848 339 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
PTPREP23469 PAPOLG-201ENST00000238714 4263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
PTPREP23469 PSG9-202ENST00000270077 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
PTPREP23469 FNDC7-201ENST00000370017 3332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
PTPREP23469 MYO6-202ENST00000369977 5597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
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PTPREP23469 ATF7IP2-203ENST00000396559 3641 ntTSL 2 BASIC7.85□□□□□ -1.15
PTPREP23469 LINC02044-201ENST00000490139 2502 ntTSL 2 BASIC7.85□□□□□ -1.15
PTPREP23469 FYB1-209ENST00000512982 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.85□□□□□ -1.15
PTPREP23469 LARP1B-201ENST00000326639 4891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
PTPREP23469 FAM221B-203ENST00000423537 2931 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
PTPREP23469 TTTY10-202ENST00000455084 1628 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
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PTPREP23469 SETDB1-205ENST00000368969 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
PTPREP23469 C11orf72-201ENST00000333139 2431 ntTSL 2 BASIC7.84□□□□□ -1.15
PTPREP23469 AC068189.1-201ENST00000501164 2632 ntTSL 2 BASIC7.84□□□□□ -1.15
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PTPREP23469 LIMCH1-201ENST00000313860 6165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
PTPREP23469 UNC13B-210ENST00000636694 8012 ntTSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
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PTPREP23469 AFP-201ENST00000226359 1914 ntTSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
PTPREP23469 KCNA2-208ENST00000638616 3279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
PTPREP23469 AC019117.1-201ENST00000636929 1462 ntTSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
PTPREP23469 MGST2-201ENST00000265498 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
PTPREP23469 SSX3-201ENST00000298396 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
PTPREP23469 LINC01699-201ENST00000319701 259 ntTSL 2 BASIC7.84□□□□□ -1.15
PTPREP23469 RPL23AP57-201ENST00000332361 466 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
PTPREP23469 S100A7L2-201ENST00000368725 339 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
PTPREP23469 RNU6-187P-201ENST00000384139 106 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
PTPREP23469 EFCAB9-201ENST00000398186 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.84□□□□□ -1.15
PTPREP23469 LINC00428-201ENST00000415620 227 ntTSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
PTPREP23469 AC073283.2-202ENST00000426892 591 ntTSL 4 BASIC7.84□□□□□ -1.15
PTPREP23469 AL109761.1-201ENST00000428689 422 ntTSL 3 BASIC7.84□□□□□ -1.15
PTPREP23469 FSIP2-AS1-201ENST00000429929 440 ntTSL 3 BASIC7.84□□□□□ -1.15
PTPREP23469 AL590128.1-201ENST00000433407 286 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
PTPREP23469 AC005019.1-201ENST00000436455 431 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
PTPREP23469 LINC01307-201ENST00000439146 474 ntTSL 3 BASIC7.84□□□□□ -1.15
PTPREP23469 HBG2-204ENST00000444587 307 ntTSL 2 BASIC7.84□□□□□ -1.15
PTPREP23469 AC093166.3-201ENST00000448785 303 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
PTPREP23469 AL035409.1-201ENST00000454305 497 ntTSL 2 BASIC7.84□□□□□ -1.15
PTPREP23469 PCMTD1P1-201ENST00000455560 355 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
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