Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMW8

USP18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP18Q9UMW8 BLZF2P-201ENST00000553776 1130 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
USP18Q9UMW8 RPL10P14-201ENST00000565265 298 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
USP18Q9UMW8 RN7SL290P-201ENST00000578661 300 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
USP18Q9UMW8 DIAPH2-AS1-204ENST00000579945 974 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
USP18Q9UMW8 AC100775.1-201ENST00000590942 522 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
USP18Q9UMW8 RSL24D1P11-201ENST00000591045 491 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
USP18Q9UMW8 AC009027.1-201ENST00000604510 479 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
USP18Q9UMW8 DPY19L1-208ENST00000612226 607 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
USP18Q9UMW8 AC006338.2-201ENST00000616864 791 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
USP18Q9UMW8 AC092656.1-203ENST00000624134 423 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
USP18Q9UMW8 AC245088.3-201ENST00000634383 424 ntAPPRIS P1 BASIC5.6□□□□□ -1.51
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USP18Q9UMW8 AL392088.2-201ENST00000637607 285 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
USP18Q9UMW8 AC015813.1-203ENST00000585065 4722 ntTSL 2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
USP18Q9UMW8 ZNF534-202ENST00000332323 2086 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
USP18Q9UMW8 NPIPB9-201ENST00000357796 2037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
USP18Q9UMW8 DDX18P4-201ENST00000511690 1966 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
USP18Q9UMW8 KCTD16-201ENST00000507359 13950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
USP18Q9UMW8 IQCH-214ENST00000629425 1822 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
USP18Q9UMW8 SLC16A9-201ENST00000395347 3646 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.6□□□□□ -1.51
USP18Q9UMW8 DYNC1I2-201ENST00000340296 2589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
USP18Q9UMW8 DENND4A-201ENST00000431932 5875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
USP18Q9UMW8 SLC1A3-201ENST00000265113 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
USP18Q9UMW8 ZNF611-201ENST00000319783 3153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
USP18Q9UMW8 RAB3GAP1-207ENST00000539493 3161 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
USP18Q9UMW8 HMMR-203ENST00000393915 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
USP18Q9UMW8 USF3-202ENST00000478658 8461 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
USP18Q9UMW8 OR5AN1-203ENST00000641998 7647 ntAPPRIS P1 BASIC5.59□□□□□ -1.51
USP18Q9UMW8 ZNF573-208ENST00000536220 2257 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
USP18Q9UMW8 INO80D-201ENST00000403263 14136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
USP18Q9UMW8 TTC41P-203ENST00000548527 1475 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
USP18Q9UMW8 AC114947.2-201ENST00000565748 2125 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
USP18Q9UMW8 MTND4P26-201ENST00000415971 1359 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
USP18Q9UMW8 UGP2-203ENST00000445915 1955 ntTSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
USP18Q9UMW8 MAX-203ENST00000341653 330 ntTSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
USP18Q9UMW8 MIR133B-201ENST00000362210 119 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
USP18Q9UMW8 RNU1-43P-201ENST00000365052 165 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
USP18Q9UMW8 C1orf105-203ENST00000367727 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
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USP18Q9UMW8 MT-TH-201ENST00000387441 69 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
USP18Q9UMW8 C8orf22-202ENST00000399653 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
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USP18Q9UMW8 AP000254.1-201ENST00000609934 520 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
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USP18Q9UMW8 AL359715.5-201ENST00000623431 443 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
USP18Q9UMW8 LINC01002-236ENST00000634022 378 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
USP18Q9UMW8 AC073869.7-201ENST00000640874 297 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
USP18Q9UMW8 DAZ4-205ENST00000440066 1891 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
USP18Q9UMW8 DAZ1-206ENST00000620725 1891 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
USP18Q9UMW8 SNX10-202ENST00000396376 2491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
USP18Q9UMW8 RAB18-209ENST00000621805 4894 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
USP18Q9UMW8 SLFN13-201ENST00000285013 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
USP18Q9UMW8 COPB2-205ENST00000507777 3034 ntTSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
USP18Q9UMW8 BICRAL-201ENST00000314073 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
USP18Q9UMW8 RNF6P1-201ENST00000444889 1784 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
USP18Q9UMW8 RBMS3-202ENST00000383766 2757 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.52
USP18Q9UMW8 GHR-207ENST00000537449 4419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.52
USP18Q9UMW8 PSMC6-201ENST00000445930 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.52
USP18Q9UMW8 BACH1-202ENST00000399921 5769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.52
USP18Q9UMW8 ADGRL2-209ENST00000370727 5164 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.52
USP18Q9UMW8 AL356473.1-201ENST00000406203 1408 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
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