Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0V3

SH3BP4, SH3 domain-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 963 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4Q9P0V3 OFD1P11Y-201ENST00000418213 1177 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
SH3BP4Q9P0V3 PAICSP7-201ENST00000419829 962 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
SH3BP4Q9P0V3 MTHFD2L-207ENST00000433372 1407 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
SH3BP4Q9P0V3 AL445259.1-202ENST00000434768 379 ntTSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
SH3BP4Q9P0V3 HMGB1P45-201ENST00000435986 653 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
SH3BP4Q9P0V3 AL359378.1-201ENST00000439891 400 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
SH3BP4Q9P0V3 ELOCP10-201ENST00000440624 327 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
SH3BP4Q9P0V3 AL365258.1-201ENST00000440885 247 ntTSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
SH3BP4Q9P0V3 MTND3P1-201ENST00000441336 220 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
SH3BP4Q9P0V3 RPS26P30-201ENST00000443431 335 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
SH3BP4Q9P0V3 LINC01035-201ENST00000445072 784 ntTSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
SH3BP4Q9P0V3 RPL12P26-201ENST00000452430 487 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
SH3BP4Q9P0V3 SUN3-208ENST00000453192 801 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
SH3BP4Q9P0V3 AL122008.1-201ENST00000456078 452 ntTSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
SH3BP4Q9P0V3 AL021393.1-201ENST00000456740 539 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
SH3BP4Q9P0V3 B4GALT4-AS1-201ENST00000470790 544 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
SH3BP4Q9P0V3 SETP11-201ENST00000473027 690 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
SH3BP4Q9P0V3 AC090114.3-201ENST00000479267 829 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
SH3BP4Q9P0V3 AC116353.3-201ENST00000511215 249 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
SH3BP4Q9P0V3 PTK2-206ENST00000517712 3351 ntTSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
SH3BP4Q9P0V3 AC023632.1-201ENST00000518463 375 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
SH3BP4Q9P0V3 AC105999.2-201ENST00000521363 881 ntTSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
SH3BP4Q9P0V3 LINC02235-201ENST00000534675 466 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
SH3BP4Q9P0V3 AKIRIN1P1-201ENST00000547384 544 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
SH3BP4Q9P0V3 AC034102.2-201ENST00000548861 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
SH3BP4Q9P0V3 AC144548.2-201ENST00000550231 946 ntTSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
SH3BP4Q9P0V3 LINC02406-201ENST00000553029 546 ntTSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
SH3BP4Q9P0V3 AC127381.1-201ENST00000555979 939 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
SH3BP4Q9P0V3 AC044913.1-201ENST00000557200 430 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
SH3BP4Q9P0V3 AC009562.1-202ENST00000558755 565 ntTSL 4 BASIC4.93□□□□□ -1.62
SH3BP4Q9P0V3 AC051619.4-201ENST00000560034 292 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
SH3BP4Q9P0V3 AC092078.2-201ENST00000560900 581 ntTSL 4 BASIC4.93□□□□□ -1.62
SH3BP4Q9P0V3 AC010546.1-201ENST00000569391 485 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
SH3BP4Q9P0V3 AC138207.5-201ENST00000579561 409 ntTSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
SH3BP4Q9P0V3 PIK3C3-207ENST00000587402 452 ntTSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
SH3BP4Q9P0V3 AC010422.4-201ENST00000601420 533 ntTSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
SH3BP4Q9P0V3 AC078795.2-201ENST00000602835 1252 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
SH3BP4Q9P0V3 ELOCP34-201ENST00000604436 327 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
SH3BP4Q9P0V3 AP000254.1-201ENST00000609934 520 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
SH3BP4Q9P0V3 AC116447.1-201ENST00000613153 453 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
SH3BP4Q9P0V3 CLPS-202ENST00000616014 436 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
SH3BP4Q9P0V3 AC092656.1-203ENST00000624134 423 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
SH3BP4Q9P0V3 AP003072.4-201ENST00000624580 310 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
SH3BP4Q9P0V3 AC074387.1-201ENST00000632044 823 ntTSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
SH3BP4Q9P0V3 CYP4F35P-202ENST00000636121 390 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
SH3BP4Q9P0V3 AL121759.2-201ENST00000636173 570 ntTSL 4 BASIC4.93□□□□□ -1.62
SH3BP4Q9P0V3 AL392088.2-201ENST00000637607 285 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
SH3BP4Q9P0V3 CASC19-206ENST00000641028 1430 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
SH3BP4Q9P0V3 CMYA5-201ENST00000446378 12847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
SH3BP4Q9P0V3 RC3H1-201ENST00000258349 10988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
SH3BP4Q9P0V3 AL590399.5-201ENST00000428709 3325 ntTSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
SH3BP4Q9P0V3 CCDC178-202ENST00000383096 3391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
SH3BP4Q9P0V3 AL118496.1-201ENST00000440201 1812 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
SH3BP4Q9P0V3 DOPEY1-202ENST00000349129 8210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
SH3BP4Q9P0V3 DCTN4-201ENST00000424236 4054 ntTSL 2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
SH3BP4Q9P0V3 ASAH2-204ENST00000447815 2311 ntTSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
SH3BP4Q9P0V3 GABRG2-217ENST00000639384 5360 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
SH3BP4Q9P0V3 RGS13-201ENST00000391995 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
SH3BP4Q9P0V3 CYP4Z2P-201ENST00000423332 1512 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
SH3BP4Q9P0V3 AJ009632.2-202ENST00000634644 1513 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
SH3BP4Q9P0V3 RAD51AP1-201ENST00000228843 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
SH3BP4Q9P0V3 RNF182-207ENST00000537663 3382 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.92□□□□□ -1.62
SH3BP4Q9P0V3 DNAAF4-CCPG1-201ENST00000565113 4589 ntTSL 2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
SH3BP4Q9P0V3 LTA4H-202ENST00000413268 1908 ntTSL 2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
SH3BP4Q9P0V3 ABCB5-202ENST00000404938 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
SH3BP4Q9P0V3 DNAJC12-201ENST00000225171 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
SH3BP4Q9P0V3 C11orf74-202ENST00000347206 633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-1200P-201ENST00000384162 107 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
SH3BP4Q9P0V3 RNA5SP339-201ENST00000390987 122 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
SH3BP4Q9P0V3 AL035419.1-201ENST00000397037 564 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
SH3BP4Q9P0V3 AC009804.1-201ENST00000400949 179 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
SH3BP4Q9P0V3 AL031577.2-201ENST00000404133 280 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
SH3BP4Q9P0V3 AF274854.1-201ENST00000413236 615 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
SH3BP4Q9P0V3 AL359633.2-201ENST00000415787 622 ntTSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
SH3BP4Q9P0V3 AC009498.1-201ENST00000419860 541 ntTSL 4 BASIC4.92□□□□□ -1.62
SH3BP4Q9P0V3 AL139421.1-201ENST00000423010 169 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
SH3BP4Q9P0V3 AC009313.1-201ENST00000425470 503 ntTSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
SH3BP4Q9P0V3 IFNNP1-201ENST00000429219 553 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
SH3BP4Q9P0V3 AC234064.1-201ENST00000436312 247 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
SH3BP4Q9P0V3 LINC02094-201ENST00000437646 520 ntTSL 2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
SH3BP4Q9P0V3 AL590399.3-201ENST00000438072 543 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
SH3BP4Q9P0V3 RPS24P1-201ENST00000438550 371 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
SH3BP4Q9P0V3 LINC00484-204ENST00000439438 454 ntTSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
SH3BP4Q9P0V3 MTCYBP34-201ENST00000439552 670 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
SH3BP4Q9P0V3 AL121917.1-201ENST00000441270 893 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
SH3BP4Q9P0V3 ARL5AP2-201ENST00000444698 533 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
SH3BP4Q9P0V3 AL929288.2-201ENST00000446368 407 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
SH3BP4Q9P0V3 AC079776.3-201ENST00000450665 370 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
SH3BP4Q9P0V3 Z99127.1-201ENST00000452442 670 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
SH3BP4Q9P0V3 NDUFA12P1-201ENST00000455914 406 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
SH3BP4Q9P0V3 AC011287.2-201ENST00000456809 842 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
SH3BP4Q9P0V3 RN7SL717P-201ENST00000478343 297 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
SH3BP4Q9P0V3 AC104687.1-201ENST00000485829 412 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
SH3BP4Q9P0V3 RN7SL184P-201ENST00000488308 297 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
SH3BP4Q9P0V3 AC005912.1-201ENST00000495392 255 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
SH3BP4Q9P0V3 LINC02005-201ENST00000498832 782 ntTSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
SH3BP4Q9P0V3 LINC02213-202ENST00000506021 774 ntTSL 2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
SH3BP4Q9P0V3 AC010424.1-201ENST00000506336 297 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
SH3BP4Q9P0V3 AC092436.2-201ENST00000515188 411 ntTSL 2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
SH3BP4Q9P0V3 NDUFA5P2-201ENST00000519723 344 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.7 ms