Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPL8

TIMMDC1, Complex I assembly factor TIMMDC1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 285 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMMDC1Q9NPL8 SSU72P6-201ENST00000532644 488 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
TIMMDC1Q9NPL8 AP000889.2-201ENST00000532684 490 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
TIMMDC1Q9NPL8 AC007569.1-202ENST00000547282 303 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
TIMMDC1Q9NPL8 TIMM9-207ENST00000555930 448 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
TIMMDC1Q9NPL8 TIMM9-209ENST00000556367 572 ntTSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
TIMMDC1Q9NPL8 AC009145.3-201ENST00000567386 476 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
TIMMDC1Q9NPL8 AL157899.1-201ENST00000604110 936 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
TIMMDC1Q9NPL8 LINC02112-204ENST00000606222 429 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
TIMMDC1Q9NPL8 LRMDA-216ENST00000611306 393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
TIMMDC1Q9NPL8 AC009093.5-201ENST00000620963 359 ntTSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
TIMMDC1Q9NPL8 AC131009.3-201ENST00000621809 287 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
TIMMDC1Q9NPL8 IQCA1-202ENST00000309507 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
TIMMDC1Q9NPL8 AF287957.1-201ENST00000607368 1595 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
TIMMDC1Q9NPL8 TC2N-202ENST00000360594 3751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
TIMMDC1Q9NPL8 AC007996.1-201ENST00000620414 2821 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
TIMMDC1Q9NPL8 FRMD6-205ENST00000554167 4176 ntTSL 2 BASIC6.51□□□□□ -1.37
TIMMDC1Q9NPL8 LINC01524-201ENST00000428009 4390 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
TIMMDC1Q9NPL8 CDC7-203ENST00000428239 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
TIMMDC1Q9NPL8 MAMDC2-AS1-202ENST00000414515 2097 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
TIMMDC1Q9NPL8 AC090337.1-201ENST00000579651 2074 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
TIMMDC1Q9NPL8 AL031320.2-201ENST00000591892 2079 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
TIMMDC1Q9NPL8 AL731556.1-201ENST00000394628 3711 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
TIMMDC1Q9NPL8 STEAP2-205ENST00000394629 2261 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
TIMMDC1Q9NPL8 TNPO1P2-201ENST00000426249 2665 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
TIMMDC1Q9NPL8 TLR10-208ENST00000622002 3673 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
TIMMDC1Q9NPL8 KRT222-202ENST00000394052 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
TIMMDC1Q9NPL8 AC119744.1-201ENST00000454746 1715 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
TIMMDC1Q9NPL8 LINC01020-202ENST00000508201 1800 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
TIMMDC1Q9NPL8 PAPD4-203ENST00000428308 2204 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
TIMMDC1Q9NPL8 TEAD1-203ENST00000526600 8477 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
TIMMDC1Q9NPL8 ETFBKMT-201ENST00000357721 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
TIMMDC1Q9NPL8 DLG2-230ENST00000532653 2891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
TIMMDC1Q9NPL8 FANCD2-205ENST00000431693 2450 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
TIMMDC1Q9NPL8 ZNF253-201ENST00000355650 2268 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
TIMMDC1Q9NPL8 DCSTAMP-201ENST00000297581 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
TIMMDC1Q9NPL8 C9orf72-202ENST00000379997 1873 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
TIMMDC1Q9NPL8 ARCN1-201ENST00000264028 3845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
TIMMDC1Q9NPL8 DEFB1-201ENST00000297439 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
TIMMDC1Q9NPL8 STAG3L4-201ENST00000352103 530 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
TIMMDC1Q9NPL8 RNY1P12-201ENST00000364251 105 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
TIMMDC1Q9NPL8 RNU6-1026P-201ENST00000384465 108 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
TIMMDC1Q9NPL8 MIR187-201ENST00000385062 109 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
TIMMDC1Q9NPL8 AL136100.1-201ENST00000407696 330 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
TIMMDC1Q9NPL8 CTNNA2-204ENST00000409266 432 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
TIMMDC1Q9NPL8 RNU6-370P-201ENST00000411008 104 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
TIMMDC1Q9NPL8 AC006150.1-201ENST00000412014 263 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
TIMMDC1Q9NPL8 BX284668.3-201ENST00000414128 882 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
TIMMDC1Q9NPL8 MRLN-201ENST00000414264 422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
TIMMDC1Q9NPL8 AL034379.1-201ENST00000423216 253 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
TIMMDC1Q9NPL8 AL121916.1-201ENST00000429405 308 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
TIMMDC1Q9NPL8 RPS10P21-201ENST00000430654 475 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
TIMMDC1Q9NPL8 AC119618.1-201ENST00000434191 222 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
TIMMDC1Q9NPL8 AL731534.1-201ENST00000434711 269 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
TIMMDC1Q9NPL8 RPL23AP19-201ENST00000436229 369 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
TIMMDC1Q9NPL8 DDX3P2-201ENST00000446138 111 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
TIMMDC1Q9NPL8 MRPS31P2-201ENST00000451581 518 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
TIMMDC1Q9NPL8 GAPDHP53-201ENST00000458397 924 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
TIMMDC1Q9NPL8 AL356364.1-201ENST00000458443 182 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
TIMMDC1Q9NPL8 APOOP2-201ENST00000461561 539 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
TIMMDC1Q9NPL8 RPL31P50-201ENST00000471002 296 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
TIMMDC1Q9NPL8 CR383656.1-201ENST00000484916 377 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
TIMMDC1Q9NPL8 RN7SL267P-201ENST00000485107 261 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
TIMMDC1Q9NPL8 AC106872.2-201ENST00000494303 480 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
TIMMDC1Q9NPL8 OR51A1P-201ENST00000511110 946 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
TIMMDC1Q9NPL8 LINC02492-204ENST00000515660 584 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
TIMMDC1Q9NPL8 RNU4-29P-201ENST00000515943 174 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
TIMMDC1Q9NPL8 SCARNA11.1-201ENST00000516918 132 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
TIMMDC1Q9NPL8 RPL7P20-201ENST00000520308 745 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
TIMMDC1Q9NPL8 AC008691.1-202ENST00000521472 811 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
TIMMDC1Q9NPL8 PCED1B-AS1-202ENST00000547600 523 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
TIMMDC1Q9NPL8 AC089984.3-201ENST00000552838 363 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
TIMMDC1Q9NPL8 OR4T1P-201ENST00000554933 911 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
TIMMDC1Q9NPL8 AL355102.1-201ENST00000555383 460 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
TIMMDC1Q9NPL8 ZNF573-209ENST00000585724 453 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
TIMMDC1Q9NPL8 AL354740.1-205ENST00000586413 1230 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
TIMMDC1Q9NPL8 AC098848.2-201ENST00000588023 330 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
TIMMDC1Q9NPL8 AC104184.1-201ENST00000607513 721 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
TIMMDC1Q9NPL8 AL391813.2-201ENST00000609113 322 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
TIMMDC1Q9NPL8 TP53TG1_2.1-201ENST00000611226 182 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
TIMMDC1Q9NPL8 AC096861.1-201ENST00000616652 240 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
TIMMDC1Q9NPL8 SNX18P10-201ENST00000625014 519 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
TIMMDC1Q9NPL8 RPS4Y2-201ENST00000629237 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
TIMMDC1Q9NPL8 MARCH6-215ENST00000640713 231 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
TIMMDC1Q9NPL8 FGD6-205ENST00000549499 3757 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
TIMMDC1Q9NPL8 MACROD2-203ENST00000402914 4425 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
TIMMDC1Q9NPL8 ESRRG-201ENST00000359162 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
TIMMDC1Q9NPL8 AL049634.1-201ENST00000453770 1720 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
TIMMDC1Q9NPL8 TXNRD1-203ENST00000397736 3832 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
TIMMDC1Q9NPL8 ZNF532-201ENST00000336078 6696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
TIMMDC1Q9NPL8 WDR95P-201ENST00000425638 1542 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
TIMMDC1Q9NPL8 GPR89A-203ENST00000462900 1527 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
TIMMDC1Q9NPL8 LRRC37B-202ENST00000341671 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
TIMMDC1Q9NPL8 CNTN5-202ENST00000418526 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
TIMMDC1Q9NPL8 SGO2-201ENST00000357799 4214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
TIMMDC1Q9NPL8 CDC42BPA-201ENST00000334218 10134 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
TIMMDC1Q9NPL8 AC110760.2-201ENST00000508031 2546 ntTSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
TIMMDC1Q9NPL8 LRRC37B-201ENST00000327564 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
TIMMDC1Q9NPL8 LINC01111-201ENST00000518732 1663 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
TIMMDC1Q9NPL8 ZPLD1-201ENST00000306176 3619 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
TIMMDC1Q9NPL8 SLC2A14-203ENST00000431042 3458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73 ms