Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXD2

SCG3, Secretogranin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 468 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCG3Q8WXD2 AC091133.5-201ENST00000603088 301 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
SCG3Q8WXD2 AC239809.3-208ENST00000611452 531 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
SCG3Q8WXD2 uc_338.5-201ENST00000611839 155 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
SCG3Q8WXD2 AC005858.4-201ENST00000623191 700 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
SCG3Q8WXD2 AC015871.5-202ENST00000623252 701 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
SCG3Q8WXD2 AC100810.6-201ENST00000638068 285 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
SCG3Q8WXD2 SAMMSON-210ENST00000641260 1308 ntBASIC6.64□□□□□ -1.35
SCG3Q8WXD2 PIGN-220ENST00000638167 4195 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
SCG3Q8WXD2 CASP1-210ENST00000528974 1402 ntTSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
SCG3Q8WXD2 SLC10A7-204ENST00000502607 1638 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
SCG3Q8WXD2 C16orf87-202ENST00000394806 6640 ntTSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
SCG3Q8WXD2 TDO2-208ENST00000536354 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.64□□□□□ -1.35
SCG3Q8WXD2 ASTN2-AS1-201ENST00000418250 1756 ntTSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
SCG3Q8WXD2 PPFIA2-203ENST00000443686 3782 ntTSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
SCG3Q8WXD2 SERPINB7-206ENST00000540675 2193 ntTSL 2 BASIC6.64□□□□□ -1.35
SCG3Q8WXD2 SLC35A5-201ENST00000261034 2444 ntTSL 5 BASIC6.64□□□□□ -1.35
SCG3Q8WXD2 PTPRO-208ENST00000542557 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
SCG3Q8WXD2 KIAA1109-201ENST00000264501 15896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
SCG3Q8WXD2 FAM205A-201ENST00000378788 4225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
SCG3Q8WXD2 ESF1-201ENST00000202816 3216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
SCG3Q8WXD2 BPIFA2-201ENST00000253362 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
SCG3Q8WXD2 SETDB2-201ENST00000258672 2138 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
SCG3Q8WXD2 CFAP47-202ENST00000313548 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
SCG3Q8WXD2 OR4Q3-201ENST00000331723 942 ntAPPRIS P1 BASIC6.63□□□□□ -1.35
SCG3Q8WXD2 BPIFA2-202ENST00000354932 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
SCG3Q8WXD2 RNU5E-1-201ENST00000362477 120 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
SCG3Q8WXD2 RNA5SP321-201ENST00000362722 111 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
SCG3Q8WXD2 RNA5SP140-201ENST00000364524 92 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
SCG3Q8WXD2 SNORA64.3-201ENST00000365647 134 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
SCG3Q8WXD2 CHD6-202ENST00000373222 2477 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
SCG3Q8WXD2 RNU6-1158P-201ENST00000391167 107 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
SCG3Q8WXD2 MDM2-208ENST00000393410 732 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
SCG3Q8WXD2 MEIG1-202ENST00000407572 625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
SCG3Q8WXD2 AL023284.3-201ENST00000407767 334 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
SCG3Q8WXD2 RN7SKP240-201ENST00000410583 375 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
SCG3Q8WXD2 RN7SKP29-201ENST00000410957 272 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
SCG3Q8WXD2 RNU6-1068P-201ENST00000410958 103 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
SCG3Q8WXD2 RAB28P1-201ENST00000411517 641 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
SCG3Q8WXD2 AC093865.1-201ENST00000415387 433 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
SCG3Q8WXD2 LINC01811-201ENST00000415991 594 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
SCG3Q8WXD2 ELOCP4-201ENST00000420090 333 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
SCG3Q8WXD2 AL139184.1-202ENST00000422303 222 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
SCG3Q8WXD2 AL031846.1-202ENST00000424436 592 ntTSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
SCG3Q8WXD2 AC244453.3-201ENST00000426275 459 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
SCG3Q8WXD2 AL121902.1-201ENST00000426963 459 ntTSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
SCG3Q8WXD2 AC018644.1-201ENST00000429934 551 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
SCG3Q8WXD2 RPL36AP53-201ENST00000432891 316 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
SCG3Q8WXD2 AC016691.1-201ENST00000441321 413 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
SCG3Q8WXD2 GAPDHP37-201ENST00000442317 968 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
SCG3Q8WXD2 PFN1P11-201ENST00000445829 389 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
SCG3Q8WXD2 MRPL50P4-201ENST00000446432 475 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
SCG3Q8WXD2 LINC01361-202ENST00000452834 1526 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
SCG3Q8WXD2 CLEC1A-204ENST00000457018 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
SCG3Q8WXD2 RPL7P22-201ENST00000466005 733 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
SCG3Q8WXD2 AC099340.1-201ENST00000475247 599 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
SCG3Q8WXD2 AC104563.1-201ENST00000476147 376 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
SCG3Q8WXD2 LINC01181-201ENST00000503718 556 ntTSL 4 BASIC6.63□□□□□ -1.35
SCG3Q8WXD2 AC008629.1-202ENST00000504820 525 ntTSL 4 BASIC6.63□□□□□ -1.35
SCG3Q8WXD2 AC026427.2-201ENST00000506228 536 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
SCG3Q8WXD2 WDFY3-AS1-201ENST00000510449 493 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
SCG3Q8WXD2 AC093305.1-201ENST00000514105 522 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
SCG3Q8WXD2 RN7SKP67-201ENST00000515905 235 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
SCG3Q8WXD2 RNU7-30P-201ENST00000516835 62 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
SCG3Q8WXD2 AP002340.1-201ENST00000529298 285 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
SCG3Q8WXD2 ALG9-IT1-201ENST00000531305 684 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
SCG3Q8WXD2 OR5B19P-201ENST00000531766 928 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
SCG3Q8WXD2 AP003031.2-202ENST00000533590 572 ntTSL 4 BASIC6.63□□□□□ -1.35
SCG3Q8WXD2 AC063926.1-201ENST00000539532 415 ntTSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
SCG3Q8WXD2 AC007068.2-201ENST00000543168 395 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
SCG3Q8WXD2 ARL1-211ENST00000551828 776 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
SCG3Q8WXD2 AL049779.1-201ENST00000553306 670 ntTSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
SCG3Q8WXD2 PSMA3P-201ENST00000555485 635 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
SCG3Q8WXD2 AC087286.3-201ENST00000561409 953 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
SCG3Q8WXD2 AC040977.1-201ENST00000573222 343 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
SCG3Q8WXD2 FOPNL-205ENST00000573429 646 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
SCG3Q8WXD2 RN7SL230P-201ENST00000580835 303 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
SCG3Q8WXD2 AC064805.2-201ENST00000582959 523 ntTSL 4 BASIC6.63□□□□□ -1.35
SCG3Q8WXD2 AC010325.2-201ENST00000594114 260 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
SCG3Q8WXD2 SOX9-AS1-216ENST00000602213 821 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
SCG3Q8WXD2 OR10AB1P-201ENST00000609613 938 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
SCG3Q8WXD2 HOXA11-AS1_3.1-201ENST00000613383 98 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
SCG3Q8WXD2 MIR7109-201ENST00000613748 65 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
SCG3Q8WXD2 WDR72-208ENST00000614174 4224 ntTSL 2 BASIC6.63□□□□□ -1.35
SCG3Q8WXD2 AC243772.3-201ENST00000617878 1537 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
SCG3Q8WXD2 TADA2A-212ENST00000620367 1043 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
SCG3Q8WXD2 LINC01297-204ENST00000621052 4222 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
SCG3Q8WXD2 LINC00836-201ENST00000625325 582 ntTSL 4 BASIC6.63□□□□□ -1.35
SCG3Q8WXD2 TPTEP1-208ENST00000636884 213 ntBASIC6.63□□□□□ -1.35
SCG3Q8WXD2 SUPT3H-206ENST00000637763 498 ntTSL 3 BASIC6.63□□□□□ -1.35
SCG3Q8WXD2 ANKRD12-203ENST00000400020 9115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
SCG3Q8WXD2 ECT2L-201ENST00000367682 4343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
SCG3Q8WXD2 ECT2L-203ENST00000423192 4319 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
SCG3Q8WXD2 SEPT7-AS1-203ENST00000437235 3810 ntTSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
SCG3Q8WXD2 RALGAPA2-201ENST00000202677 6152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
SCG3Q8WXD2 TRPC4-210ENST00000625583 3009 ntTSL 1 (best) BASIC6.63□□□□□ -1.35
SCG3Q8WXD2 ZNF836-201ENST00000322146 2811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.63□□□□□ -1.35
SCG3Q8WXD2 FANCD2-205ENST00000431693 2450 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
SCG3Q8WXD2 HHLA1-201ENST00000414222 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
SCG3Q8WXD2 SETDB2-205ENST00000611815 5313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
SCG3Q8WXD2 CASC19-228ENST00000641414 1684 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
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