Protein–RNA interactions for Protein: Q15853

USF2, Upstream stimulatory factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF2Q15853 MACC1-201ENST00000332878 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.84
USF2Q15853 PARP8-211ENST00000505554 3825 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.84
USF2Q15853 OTUD4P1-201ENST00000237841 3067 ntBASIC3.59□□□□□ -1.84
USF2Q15853 SCAF11-212ENST00000549162 3934 ntTSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.84
USF2Q15853 DGKH-201ENST00000261491 17261 ntTSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.84
USF2Q15853 AP001148.1-201ENST00000624124 2359 ntBASIC3.59□□□□□ -1.84
USF2Q15853 ZNF43-207ENST00000595461 3399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.84
USF2Q15853 MAPK10-263ENST00000641052 4307 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
USF2Q15853 IDE-202ENST00000371581 4480 ntTSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
USF2Q15853 FCHSD2-205ENST00000409853 1867 ntTSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
USF2Q15853 TM4SF18-201ENST00000296059 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
USF2Q15853 PLCL2-202ENST00000432376 3940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
USF2Q15853 USP34-201ENST00000398571 11357 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
USF2Q15853 PSG11-201ENST00000306322 990 ntTSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
USF2Q15853 C1orf100-201ENST00000308105 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
USF2Q15853 OR10AG1-201ENST00000312345 1016 ntAPPRIS P1 BASIC3.58□□□□□ -1.84
USF2Q15853 AC067945.1-201ENST00000342609 618 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
USF2Q15853 SNORA31-201ENST00000362607 130 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
USF2Q15853 SNORA58B-201ENST00000364259 136 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
USF2Q15853 CFHR1-202ENST00000367424 1070 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
USF2Q15853 AL391704.2-201ENST00000418379 981 ntTSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
USF2Q15853 CENPIP1-201ENST00000425713 902 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
USF2Q15853 Z82246.1-201ENST00000428201 457 ntTSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
USF2Q15853 AC007559.1-201ENST00000428736 355 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
USF2Q15853 MTCO1P43-201ENST00000431831 488 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
USF2Q15853 NEK4P1-201ENST00000433383 879 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
USF2Q15853 TRAPPC13P1-201ENST00000435991 1062 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
USF2Q15853 Z99127.2-201ENST00000441426 334 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
USF2Q15853 OR1H1P-201ENST00000448731 937 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
USF2Q15853 NECTIN3-AS1-202ENST00000467426 664 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
USF2Q15853 RPS23P1-201ENST00000491662 432 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
USF2Q15853 RPL7P47-201ENST00000497299 556 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
USF2Q15853 SCARNA22-201ENST00000503991 125 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
USF2Q15853 AC026434.1-201ENST00000511474 454 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
USF2Q15853 LINC02429-202ENST00000513836 694 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
USF2Q15853 AC090151.1-201ENST00000520784 730 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
USF2Q15853 AC044810.3-201ENST00000527565 589 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
USF2Q15853 HIGD1AP10-201ENST00000527837 282 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
USF2Q15853 AP000676.2-201ENST00000529711 301 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
USF2Q15853 AP002812.4-201ENST00000532139 286 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
USF2Q15853 OR6C73P-201ENST00000546432 358 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
USF2Q15853 LINC00871-201ENST00000555246 408 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
USF2Q15853 AL049870.4-201ENST00000555741 486 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
USF2Q15853 AL121594.4-201ENST00000556211 1196 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
USF2Q15853 AC020659.1-204ENST00000562920 400 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
USF2Q15853 AL360157.1-201ENST00000565962 87 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
USF2Q15853 AC002091.1-201ENST00000578788 557 ntTSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
USF2Q15853 AL034351.1-201ENST00000605288 668 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
USF2Q15853 HMGN2P28-201ENST00000606102 262 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
USF2Q15853 AL360267.1-201ENST00000607309 666 ntTSL 4 BASIC3.58□□□□□ -1.84
USF2Q15853 AC135803.1-201ENST00000608748 565 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
USF2Q15853 LINC02266-201ENST00000610239 1151 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
USF2Q15853 MIR8058-201ENST00000615737 89 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
USF2Q15853 GPR34-203ENST00000620846 1282 ntTSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
USF2Q15853 PRKCQ-AS1-218ENST00000624974 1132 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
USF2Q15853 AC125613.1-204ENST00000636224 1248 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
USF2Q15853 ZFAND6-213ENST00000559835 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
USF2Q15853 AGTR2-201ENST00000371906 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
USF2Q15853 TAOK3-202ENST00000419821 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
USF2Q15853 DAZ4-207ENST00000634662 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
USF2Q15853 PCDH11X-204ENST00000373088 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
USF2Q15853 ADGRV1-201ENST00000405460 19557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
USF2Q15853 RNA5SP191-201ENST00000362585 102 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
USF2Q15853 RN7SKP115-201ENST00000363177 317 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
USF2Q15853 CLIC2-202ENST00000369449 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
USF2Q15853 RNU1-89P-201ENST00000384592 164 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
USF2Q15853 RSU1P3-201ENST00000412878 835 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
USF2Q15853 AC098820.3-201ENST00000414135 976 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
USF2Q15853 MTND2P16-201ENST00000419987 799 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
USF2Q15853 AL592494.2-201ENST00000425455 1548 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
USF2Q15853 AC092164.1-202ENST00000428036 486 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
USF2Q15853 AL160175.1-201ENST00000428124 247 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
USF2Q15853 REG1CP-203ENST00000434852 460 ntTSL 4 BASIC3.57□□□□□ -1.84
USF2Q15853 VN1R54P-201ENST00000435210 1049 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
USF2Q15853 AC097523.2-201ENST00000435551 652 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
USF2Q15853 AC076966.1-201ENST00000435560 351 ntTSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
USF2Q15853 CLEC5A-203ENST00000439991 501 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
USF2Q15853 ZNF962P-201ENST00000443465 3140 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
USF2Q15853 RPL34P26-201ENST00000445636 354 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
USF2Q15853 AC013476.1-201ENST00000446709 537 ntTSL 4 BASIC3.57□□□□□ -1.84
USF2Q15853 AL121760.1-201ENST00000447206 346 ntTSL 2 BASIC3.57□□□□□ -1.84
USF2Q15853 RPL31P44-201ENST00000447680 377 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
USF2Q15853 RPL29P29-201ENST00000448725 423 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
USF2Q15853 EIF4EBP2P1-201ENST00000450009 343 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
USF2Q15853 AC108463.1-201ENST00000450258 347 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
USF2Q15853 AC146507.1-201ENST00000468335 354 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
USF2Q15853 AC007537.2-201ENST00000472093 511 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
USF2Q15853 TIPARP-AS1-202ENST00000478005 554 ntTSL 4 BASIC3.57□□□□□ -1.84
USF2Q15853 RN7SL808P-201ENST00000496066 299 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
USF2Q15853 AC098799.3-201ENST00000506095 438 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
USF2Q15853 HMGB3P15-201ENST00000507326 574 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
USF2Q15853 AC147055.1-201ENST00000509261 750 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
USF2Q15853 PARP4P3-201ENST00000510265 317 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
USF2Q15853 AC005351.1-201ENST00000511152 786 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
USF2Q15853 KCTD9P2-201ENST00000512203 1013 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
USF2Q15853 GPX8-208ENST00000515370 1036 ntTSL 2 BASIC3.57□□□□□ -1.84
USF2Q15853 AC090150.2-201ENST00000521869 815 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
USF2Q15853 AC068672.2-201ENST00000524022 336 ntTSL 3 BASIC3.57□□□□□ -1.84
USF2Q15853 OR5M7P-201ENST00000526140 972 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
USF2Q15853 NAP1L1-204ENST00000535020 1686 ntTSL 2 BASIC3.57□□□□□ -1.84
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