Protein–RNA interactions for Protein: Q15751

HERC1, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC1, humanhuman

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Length 4,861 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC1Q15751 PROS1-203ENST00000407433 3335 ntTSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
HERC1Q15751 FOCAD-201ENST00000338382 5765 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
HERC1Q15751 ENPP2-201ENST00000075322 2651 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
HERC1Q15751 CUL2-209ENST00000537177 4271 ntTSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
HERC1Q15751 IGF1-206ENST00000456098 7370 ntTSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
HERC1Q15751 LZIC-201ENST00000377213 945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
HERC1Q15751 EI24P3-201ENST00000399046 1062 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
HERC1Q15751 AL353608.1-201ENST00000419576 416 ntTSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
HERC1Q15751 MYCBP2-AS1-201ENST00000422231 519 ntTSL 3 BASIC2.24□□□□□ -2.05
HERC1Q15751 AC004870.4-201ENST00000424359 360 ntTSL 2 BASIC2.24□□□□□ -2.05
HERC1Q15751 RPL35AP21-201ENST00000437667 333 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
HERC1Q15751 SERPINA7P1-201ENST00000443077 631 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
HERC1Q15751 RNU4-29P-201ENST00000515943 174 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
HERC1Q15751 AC006116.10-201ENST00000591836 581 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
HERC1Q15751 AC026368.1-201ENST00000614934 690 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
HERC1Q15751 AL031658.2-201ENST00000616850 651 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
HERC1Q15751 OR8J3-204ENST00000642058 3806 ntAPPRIS P1 BASIC2.24□□□□□ -2.05
HERC1Q15751 RWDD2B-207ENST00000493196 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
HERC1Q15751 ENPP2-202ENST00000259486 3233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
HERC1Q15751 SCN1A-203ENST00000409050 5946 ntTSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
HERC1Q15751 PPARGC1B-201ENST00000309241 10568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
HERC1Q15751 LINC00862-204ENST00000637098 1400 ntTSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
HERC1Q15751 DOCK8-204ENST00000432829 7452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
HERC1Q15751 HEATR1-203ENST00000366582 8447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
HERC1Q15751 ZNF445-202ENST00000425708 10052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
HERC1Q15751 MFN1-201ENST00000263969 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
HERC1Q15751 A2MP1-204ENST00000566278 4130 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
HERC1Q15751 AL358472.1-201ENST00000431295 329 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
HERC1Q15751 AC069540.2-201ENST00000441776 351 ntTSL 3 BASIC2.23□□□□□ -2.05
HERC1Q15751 TRAV1-1-201ENST00000542354 392 ntAPPRIS P1 BASIC2.23□□□□□ -2.05
HERC1Q15751 DEFB109F-202ENST00000542600 509 ntTSL 2 BASIC2.23□□□□□ -2.05
HERC1Q15751 AC011473.1-201ENST00000601280 443 ntTSL 2 BASIC2.23□□□□□ -2.05
HERC1Q15751 AC079906.1-201ENST00000621214 815 ntTSL 3 BASIC2.23□□□□□ -2.05
HERC1Q15751 DLD-214ENST00000639772 421 ntTSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
HERC1Q15751 KCNJ1-202ENST00000324036 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
HERC1Q15751 MUC4-215ENST00000475231 16273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
HERC1Q15751 LCOR-204ENST00000371103 10342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
HERC1Q15751 AMPD1-203ENST00000520113 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
HERC1Q15751 BICRAL-202ENST00000394168 6515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
HERC1Q15751 SEC31A-215ENST00000505472 4159 ntTSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
HERC1Q15751 CRISP1-202ENST00000335847 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
HERC1Q15751 NIPBL-201ENST00000282516 10435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
HERC1Q15751 ATP2C1-205ENST00000504381 3498 ntTSL 2 BASIC2.23□□□□□ -2.05
HERC1Q15751 AL138749.1-201ENST00000397864 791 ntTSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
HERC1Q15751 AF240627.1-201ENST00000416002 879 ntTSL 3 BASIC2.23□□□□□ -2.05
HERC1Q15751 AL392046.1-203ENST00000450106 651 ntTSL 2 BASIC2.23□□□□□ -2.05
HERC1Q15751 RPL7P1-201ENST00000468161 747 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
HERC1Q15751 MFAP3L-206ENST00000506110 548 ntTSL 3 BASIC2.23□□□□□ -2.05
HERC1Q15751 AC087672.2-201ENST00000522498 429 ntTSL 2 BASIC2.23□□□□□ -2.05
HERC1Q15751 AC124784.1-201ENST00000552426 571 ntTSL 3 BASIC2.23□□□□□ -2.05
HERC1Q15751 AC010591.1-201ENST00000603941 649 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
HERC1Q15751 U2SURP-208ENST00000473835 7276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
HERC1Q15751 MYO9A-203ENST00000444904 7749 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
HERC1Q15751 DMXL1-215ENST00000539542 11236 ntTSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
HERC1Q15751 CASP1-210ENST00000528974 1402 ntTSL 2 BASIC2.23□□□□□ -2.05
HERC1Q15751 SENP7-202ENST00000348610 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
HERC1Q15751 MRRF-202ENST00000344641 9826 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.23□□□□□ -2.05
HERC1Q15751 MIPOL1-206ENST00000545536 2073 ntTSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
HERC1Q15751 ZNF254-202ENST00000357002 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
HERC1Q15751 F2RL2-201ENST00000296641 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
HERC1Q15751 SNORA74C-2-201ENST00000411179 201 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
HERC1Q15751 BX119904.3-201ENST00000428194 957 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
HERC1Q15751 AC090686.1-201ENST00000481577 749 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
HERC1Q15751 AC093534.2-201ENST00000511418 420 ntTSL 3 BASIC2.23□□□□□ -2.05
HERC1Q15751 RNA5SP497-201ENST00000516081 97 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
HERC1Q15751 STX3-204ENST00000530221 534 ntTSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
HERC1Q15751 ISCA1P3-201ENST00000577104 373 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
HERC1Q15751 GALNT5-201ENST00000259056 6171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
HERC1Q15751 ZNF780A-205ENST00000594395 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.23□□□□□ -2.05
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HERC1Q15751 CEP170-215ENST00000481987 3031 ntTSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
HERC1Q15751 AC097504.1-201ENST00000515103 2415 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
HERC1Q15751 LIMD1-201ENST00000273317 11331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
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HERC1Q15751 THAP12P5-201ENST00000405864 2275 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
HERC1Q15751 DCLK1-202ENST00000360631 8007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
HERC1Q15751 AL365214.2-201ENST00000433684 1365 ntTSL 2 BASIC2.23□□□□□ -2.05
HERC1Q15751 LIMA1-214ENST00000552783 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
HERC1Q15751 MBNL3-206ENST00000394311 11263 ntTSL 2 BASIC2.23□□□□□ -2.05
HERC1Q15751 TLR8-201ENST00000218032 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
HERC1Q15751 OR5V1-215ENST00000377154 1266 ntAPPRIS P1 BASIC2.23□□□□□ -2.05
HERC1Q15751 HMGB3P19-201ENST00000403971 560 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
HERC1Q15751 ERMN-204ENST00000409925 556 ntTSL 4 BASIC2.23□□□□□ -2.05
HERC1Q15751 AL592078.1-201ENST00000421866 321 ntTSL 3 BASIC2.23□□□□□ -2.05
HERC1Q15751 TOMM20P4-201ENST00000427861 435 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
HERC1Q15751 AC239809.1-201ENST00000450470 217 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
HERC1Q15751 OR52E3P-201ENST00000452083 936 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
HERC1Q15751 BNIP3P41-201ENST00000503774 571 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
HERC1Q15751 PTGES3P3-201ENST00000511479 482 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
HERC1Q15751 RN7SKP18-201ENST00000516005 275 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
HERC1Q15751 OR11H5P-201ENST00000554039 926 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
HERC1Q15751 ZNF479-203ENST00000620639 1239 ntTSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
HERC1Q15751 SMC1A-202ENST00000375340 9930 ntTSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
HERC1Q15751 LIG3-202ENST00000378526 8400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
HERC1Q15751 DCLK1-208ENST00000615680 7592 ntTSL 2 BASIC2.22□□□□□ -2.05
HERC1Q15751 ATF7IP-214ENST00000540793 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
HERC1Q15751 ANKRD34C-201ENST00000421388 4951 ntAPPRIS P1 BASIC2.22□□□□□ -2.05
HERC1Q15751 IL1RAP-205ENST00000412504 4875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
HERC1Q15751 C3orf67-AS1-202ENST00000482372 2203 ntTSL 2 BASIC2.22□□□□□ -2.05
HERC1Q15751 SLC26A7-210ENST00000617233 5257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
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