Protein–RNA interactions for Protein: Q13635

PTCH1, Protein patched homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTCH1Q13635 PCDH9-201ENST00000377861 28227 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
PTCH1Q13635 AC020633.1-201ENST00000468439 2247 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
PTCH1Q13635 ARHGEF12-202ENST00000397843 9660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
PTCH1Q13635 STARD9-201ENST00000290607 15567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
PTCH1Q13635 RLIM-201ENST00000332687 8317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
PTCH1Q13635 SPATA31D2P-201ENST00000429999 4388 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
PTCH1Q13635 SNORD35B-201ENST00000363660 87 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
PTCH1Q13635 HIST1H2APS3-201ENST00000403259 134 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
PTCH1Q13635 HDGFP1-201ENST00000405943 252 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
PTCH1Q13635 RN7SKP199-201ENST00000410325 305 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
PTCH1Q13635 TTTY12-201ENST00000413466 979 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
PTCH1Q13635 LINC00382-201ENST00000427918 890 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
PTCH1Q13635 Z74696.2-201ENST00000436514 498 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
PTCH1Q13635 RPL6P9-201ENST00000466502 859 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
PTCH1Q13635 ADGRL3-AS1-204ENST00000509461 481 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
PTCH1Q13635 ASNSP4-201ENST00000511103 447 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
PTCH1Q13635 LINC00534-201ENST00000517400 793 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
PTCH1Q13635 AC018682.2-201ENST00000517716 399 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
PTCH1Q13635 PCAT1-201ENST00000519319 734 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
PTCH1Q13635 AC009446.1-202ENST00000521131 473 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
PTCH1Q13635 CA3-AS1-203ENST00000524052 430 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
PTCH1Q13635 AC103796.1-201ENST00000530663 358 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
PTCH1Q13635 LINC02423-202ENST00000542577 460 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
PTCH1Q13635 LINC00644-201ENST00000555156 295 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
PTCH1Q13635 NPM1P47-201ENST00000560843 856 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
PTCH1Q13635 LINC01470-205ENST00000584829 681 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
PTCH1Q13635 RFESD-202ENST00000380005 2587 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
PTCH1Q13635 F2RL2-201ENST00000296641 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
PTCH1Q13635 OR8B3-202ENST00000641139 2170 ntAPPRIS P1 BASIC5.49□□□□□ -1.53
PTCH1Q13635 CEP192-203ENST00000506447 7960 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
PTCH1Q13635 STAG2-205ENST00000371160 6045 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
PTCH1Q13635 CNTN1-201ENST00000347616 5507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
PTCH1Q13635 AC093591.2-201ENST00000565254 3843 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
PTCH1Q13635 POLK-210ENST00000508526 2019 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
PTCH1Q13635 PDCD1LG2-201ENST00000397747 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
PTCH1Q13635 SLC17A4-203ENST00000439485 3699 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
PTCH1Q13635 PTPRD-203ENST00000381196 9911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
PTCH1Q13635 COX7B2-201ENST00000355591 542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
PTCH1Q13635 ANP32E-202ENST00000369115 708 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
PTCH1Q13635 ZNF602P-201ENST00000405929 924 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
PTCH1Q13635 RNU2-22P-201ENST00000411266 212 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
PTCH1Q13635 ZNF736P2Y-201ENST00000416040 1279 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
PTCH1Q13635 DYNLL1P7-201ENST00000429273 258 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
PTCH1Q13635 LINC01773-201ENST00000437598 787 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
PTCH1Q13635 RPL23AP89-201ENST00000439324 255 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
PTCH1Q13635 AC115115.1-201ENST00000449927 248 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
PTCH1Q13635 AC080162.1-201ENST00000480764 491 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
PTCH1Q13635 LINC01957-201ENST00000506392 751 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
PTCH1Q13635 LINC02483-201ENST00000512043 1143 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
PTCH1Q13635 AC084398.2-201ENST00000551918 564 ntTSL 4 BASIC5.48□□□□□ -1.53
PTCH1Q13635 AC007599.1-201ENST00000568688 1174 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
PTCH1Q13635 AC010528.1-201ENST00000568714 739 ntTSL 4 BASIC5.48□□□□□ -1.53
PTCH1Q13635 OR7M1P-201ENST00000608946 533 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
PTCH1Q13635 FAM26D-205ENST00000628083 1117 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
PTCH1Q13635 VGLL4-219ENST00000638314 93 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
PTCH1Q13635 PMS1-215ENST00000447232 2576 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
PTCH1Q13635 ARFGEF2-201ENST00000371917 8852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
PTCH1Q13635 ABI3BP-201ENST00000284322 4498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
PTCH1Q13635 MTCO1P7-201ENST00000419523 1542 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
PTCH1Q13635 ZNF33A-201ENST00000307441 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC5.48□□□□□ -1.53
PTCH1Q13635 CYYR1-AS1-201ENST00000357401 3412 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
PTCH1Q13635 RNFT1-201ENST00000305783 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
PTCH1Q13635 STAMBPL1-202ENST00000371924 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
PTCH1Q13635 FMN1-202ENST00000334528 12355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
PTCH1Q13635 GLCE-201ENST00000261858 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
PTCH1Q13635 MAPK10-303ENST00000641324 3959 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
PTCH1Q13635 MAP3K7-202ENST00000369325 4633 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
PTCH1Q13635 PEAK1-201ENST00000312493 11512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
PTCH1Q13635 CLIC2-202ENST00000369449 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
PTCH1Q13635 MLIP-203ENST00000370877 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
PTCH1Q13635 SNORD3H-201ENST00000384486 214 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
PTCH1Q13635 EYA1-205ENST00000388742 3907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
PTCH1Q13635 IL1R1-204ENST00000409929 1858 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
PTCH1Q13635 RPS7P15-201ENST00000415804 584 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
PTCH1Q13635 MTND2P15-201ENST00000418575 892 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
PTCH1Q13635 LINC02263-202ENST00000420701 597 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
PTCH1Q13635 AL353681.1-201ENST00000435828 731 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
PTCH1Q13635 HSPD1P21-201ENST00000436541 245 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
PTCH1Q13635 AC106707.2-201ENST00000484182 374 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
PTCH1Q13635 AC005726.1-201ENST00000494679 427 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
PTCH1Q13635 AC093535.1-201ENST00000515808 747 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
PTCH1Q13635 AC073655.2-202ENST00000547927 401 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
PTCH1Q13635 AL355076.2-201ENST00000555736 544 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
PTCH1Q13635 LINC01584-202ENST00000563990 852 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
PTCH1Q13635 AC022146.1-201ENST00000595307 847 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
PTCH1Q13635 VN1R81P-201ENST00000602085 372 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
PTCH1Q13635 LSM1P2-201ENST00000604911 322 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
PTCH1Q13635 AL031666.3-201ENST00000609320 1006 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
PTCH1Q13635 AC074029.4-201ENST00000624796 1859 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
PTCH1Q13635 LINC01630-206ENST00000635103 4292 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
PTCH1Q13635 AC073869.7-201ENST00000640874 297 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
PTCH1Q13635 CMYA5-201ENST00000446378 12847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
PTCH1Q13635 BAZ2B-203ENST00000392782 8058 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
PTCH1Q13635 LRP6-201ENST00000261349 10020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
PTCH1Q13635 RAD17-203ENST00000345306 2789 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
PTCH1Q13635 OR4F17-202ENST00000585993 2669 ntAPPRIS P1 BASIC5.47□□□□□ -1.53
PTCH1Q13635 PRO1804-201ENST00000623780 2050 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
PTCH1Q13635 GRAMD1C-208ENST00000472026 1876 ntTSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
PTCH1Q13635 CUL4AP1-201ENST00000514750 1863 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
PTCH1Q13635 MTND5P23-201ENST00000430812 1655 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 112.1 ms